工具箱2 swMATH ID: 14081 软件作者: Sanft KR、Wu S、Roh M、Fu J、Lim RK、Petzold LR 描述: StochKit2:具有事件的生化系统离散随机模拟软件。小结:StochKit2是流行的StochKit随机模拟软件包的第一次重大升级。StochKit2提供了Gillespie随机模拟算法(SSA)的几种变体的高效实现,以及具有自动步长选择的tau-leaping。StochKit2的功能包括基于模型属性、事件处理和多核架构上的自动并行性自动选择最佳SSA方法。代码的底层结构已经完全更新,为扩展其功能提供了一个灵活的框架。可用性:StochKit2可在Linux/Unix、Mac OS X和Windows上运行。它在GPL版本3下免费提供,可以从以下网址下载http://sourceforge.net/projects/stochkit/。 主页: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3157925/ 相关软件: 工具箱;蟒蛇;吉莱斯Py2;ppsim公司;libSBML(库SBML);科帕西;生物网络生成;斯托奇Py;github;小脑;国际NA;科内克特;NetworkX公司;侵蚀;朱庇特;JuMP公司;微分方程.jl;斯莫尔丁;PySB公司;Gillespie.jl公司 引用于: 9文件 全部的 前5名24位作者引用 2 卡斯滕·马尔 1 保罗·巴拉里尼 1 马哈茂德·本特里奥 1 辛奎马尼,尤金尼奥 1 保罗·亨里·库内德 1 Dayar,Tugrul公司 1 伯特·德彪舍尔(Bert J.Debusschere)。 1 大卫·多蒂 1 贾斯汀·菲格曼 1 拉蒙·格里玛 1 简·哈塞纳尔 1 Najm,Habib N。 1 M.Can Orhan 1 塔贾纳·彼得罗夫 1 尼古拉·波波维奇 1 科斯敏·萨夫塔 1 吉多·桑吉内蒂 1 哈奇克五世(Khachik V.Sargsyan)。 1 大卫·施诺尔 1 埃里克·塞弗森。 1 彼得·斯温(Peter S.Swain)。 1 菲比安·约阿希姆(Fabian Joachim Theis) 1 斯特凡诺·托纳齐 1 丹尼尔·温德尔 全部的 前5名6篇连载文章中引用 1 计算物理杂志 1 数学生物学杂志 1 Automatica公司 1 应用概率杂志 1 理论计算机科学 1 物理学报A:数学与理论 全部的 前5名在9个字段中引用 7 生物学和其他自然科学(92-XX) 三 概率论与随机过程(60-XX) 三 统计学(62-XX) 1 常微分方程(34-XX) 1 动力系统和遍历理论(37至XX) 1 数值分析(65-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 经典热力学,传热(80-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文