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Gillespie.jl公司

swMATH ID: 28297
软件作者: 西蒙·弗罗斯特。
说明: Gillespie.jl(Frost 2016)是一个使用Gillespie直接方法(有时称为Doob-Gillespie算法)进行随机模拟的Julia软件包(Doob-Gellespie 1945;Gillespee 1977),该方法广泛应用于许多领域,包括系统生物学和流行病学。它借用了Mario Pineda-Krch(Pineda-Grch 2008)的R库GillespieSSA的基本接口(尽管没有任何代码),尽管Gillespie.jl目前只实现了标准的精确方法,而GillespieSSA还包括其他方法,如tau-leaping,Gillespie.jl旨在使性能与手工编码的C代码不相上下,同时保持一个简单但灵活的接口。
主页: https://github.com/sdwfrost/Gillespie.jl
源代码:  https://github.com/sdwfrost/Gillespie.jl
依赖项: 朱莉娅
关键词: JOSS公司;期刊开源软件;随机模拟;朱莉娅;Doob-Gillespie算法;R GillespieSSA公司
相关软件: GillespieSSA公司;朱莉娅;JuMP公司;libSBML(库SBML);微分方程.jl;科帕西;斯莫尔丁;生物净发电;PySB公司;斯托奇Py;炉灶用具2;斯托奇SS;生物模拟器.jl
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标准条款

1出版物描述软件 年份
Gillespie.jl:Julia中的随机模拟算法链接
西蒙·弗罗斯特
2016