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生物2RDF

swMATH ID: 23946
软件作者: 弗兰克·科伊斯·贝洛;Nicole Tourigny;很好,本杰明;让·莫里塞特
描述: Bio2rdf:人类和小鼠后基因组知识的语义网络图谱。Bio2RDF项目使用基于语义网络规则的数据集成方法来回答一个广泛的问题:关于小鼠和人类基因组的已知信息是什么?使用其rdfizing服务,由30个公共生物信息学数据提供商(GO、NCBI、UniProt、KEGG、PDB和许多其他提供商)构建了6500万个三元组的语义混搭。节点的平均链接库(ALR)为4.7,这意味着一个普通主题通过仓库中的直接或反向链接与4.7个其他主题相连。给出了该图的知识图及其内容的描述性统计。可在url下载N3格式的Bio2RDF地图集图形的可下载版本{http://bio2rdf.org/下载}.
主页: http://bio2rdf.org/
相关软件: 凯格;DBpedia(数据库);ArrayExpress公司;字符串;公共化学;SimRank公司;橙色4WS;PL-银行;SEGS公司;SegMine公司;NCDaware排名;前-前;生物胺;网络SDM;节点2vec;阿勒夫;阿伯纳;PROSITE公司;PSI-爆炸;比奥克莱斯利
引用于: 3文件

标准条款

2出版物描述软件 年份
Bio2rdf第2版:生命科学相关数据的覆盖范围、互操作性和来源得到改进
Alison Callahan;何塞·克鲁兹·托莱多;彼得·安塞尔;米歇尔·杜蒙蒂尔
2013
Bio2rdf:人类和小鼠后基因组知识的语义网络图谱
弗朗索瓦·贝洛;Nicole Tourigny;很好,本杰明;让·莫里塞特
2008

按年份列出的引文