6AUV公司

大鼠神经元一氧化氮合酶血红素结构域与4-甲基-6-(2-(5-(3-((甲基氨基)甲基)苯基)吡啶-3-基)乙基)吡啶-2-胺复合物的结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.76 Å
  • R值自由:0.222 
  • R值工作:0.184 
  • 观察到的R值:0.186 

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文学类

使用含氟苯连接剂的强效和选择性2-氨基吡啶基支架改善人神经一氧化氮合酶抑制剂的细胞通透性。

做,H.T。王,H.Y。李,H。克雷菲,G。普洛斯,T.L。R.B.西尔弗曼。

(2017)医学化学杂志60: 9360-9375

  • 内政部:https://doi.org/10.1021/cs.jmedchem.7b01356
  • 相关结构的主要引文:
    6个UQ,6欧元,6美国,6个输出,6个单元,6AUV公司,6个UW,6个UX,6月,6澳Z,6AV0型,6AV1型,6AV2型,6AV3型,6AV4版,6月5日,第6页,6AV7型

  • PubMed摘要:

    抑制神经元型一氧化氮合酶(nNOS)是治疗神经退行性疾病的一种很有前景的治疗方法。最近,我们在提高携带2-氨基吡啶支架的人类nNOS抑制剂的效力和异构体选择性方面取得了相当大的进展。然而,这些抑制剂仍然存在细胞膜通透性过低的问题,无法进入中枢神经系统药物开发。我们在本文中报告了通过PAMPA-BBB和Caco-2测定来提高nNOS抑制剂渗透性的研究。本研究中最具渗透性的化合物(12)对人类nNOS(K=30 nM),与其他NOS亚型,尤其是人类eNOS相比具有极高的选择性(hnNOS/heNOS=2799,是我们迄今为止获得的最高hnNOS/heNOS比率)。X射线晶体学分析表明,12在大鼠和人类nNOS中采用了类似的结合模式,其中2-氨基吡啶和氟苯连接物分别与谷氨酸和酪氨酸残基形成关键氢键。


  • 组织附属关系

    美国伊利诺伊州埃文斯顿谢里登路2145号西北大学发展治疗中心分子创新与药物发现中心生命过程化学研究所化学系、分子生物科学系、化学系。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
一氧化氮合酶,脑422褐家鼠突变: 0 
基因名称:1号B个
欧盟委员会:1.14.13.39
UniProt公司
寻找蛋白质第29476页 (褐家鼠)
探索第29476页 
转到UniProtKB:第29476页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第29476页
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体5独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互

HEM查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
H[身份验证B]
含FE的原卟啉IX
C类34H(H)32铁氮4O(运行)4
KABFMIBPWCXCRK-RGGAHWMASA-L公司
第79周
W79查询

下载理想坐标CCD文件
E[认证A],
J[认证B]
4-甲基-6-[2-(5-{3-[(甲胺基)甲基]苯基}吡啶-3-基)乙基]吡啶-2-胺
C类21H(H)24N个4
MGNVQSKYSZRQCR-UHFFFAOYSA-N公司
H4B型
H4B查询

下载理想坐标CCD文件
D[认证A],
本人【授权B】
5,6,7,8-四氢生物蝶呤
C类9H(H)15N个5O(运行)
FNKQXYHWGSIFBK-RPDRRWSUSA-N公司
ZN公司
ZN查询

下载理想坐标CCD文件
G[认证A]锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N公司
ACT公司
ACT查询

下载理想坐标CCD文件
F[认证A],
K[认证B]
醋酸盐离子
C类2H(H)O(运行)2
QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M公司
绑定相关性批注
身份证件来源绑定相关性
第79周 绑定数据库: 6AUV公司 Ki公司:最小值:47,最大值:82(nM),来自2次分析
绑定MOAD: 6紫外线 Ki公司:来自1次分析的47(nM)
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.76 Å
  • R值自由:0.222 
  • R值工作:0.184 
  • 观察到的R值:0.186 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=52.12α = 90
b=111.181β = 90
c=164.173γ = 90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
XDS公司数据缩减
无目标的数据缩放
REFMAC公司阶段划分

结构验证

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配体结构质量评估


进入历史和资金信息

存款数据


资金筹措组织位置授权编号
国立卫生研究院/国立普通医学科学研究所(NIH/NIGMS)美国GM57353号

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2018-07-11
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2019-02-20
    变更:作者支持证据、数据收集
  • 版本1.2:2020-01-01
    更改:作者支持证据
  • 版本1.3:2023-10-04
    更改:数据收集、数据库引用、派生计算、优化描述