配体诱导NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。
公共医学 : 23583913 内政部: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2013.04.001 相关结构的主要引文: 200万吨 , 200万u , 200伏 PubMed摘要: 多域支架蛋白NHERF1调节各种跨膜受体和离子转运蛋白的组装和细胞内运输。 NHERF1的两个PDZ(突触后密度95/盘大/小带闭塞1)结构域具有非常不同的配体结合能力:PDZ1识别多种具有高亲和力的膜蛋白,而PDZ2仅结合有限数量的靶蛋白。 在这里,我们利用核磁共振技术确定了区分囊性纤维化跨膜调节器羧基末端1型PDZ结合基序(QDTRL)两个PDZ结构域结合亲和力的结构和动力学机制。 与PDZ2类似,我们确定了一个耦合到规范PDZ1域的螺旋-环-螺旋子域。 扩展的PDZ1域具有高度的灵活性,在快时间尺度和慢时间尺度上具有相关的主干运动,而扩展的PDZ域则相对刚性。 扩展的PDZ1结构的延展性有助于将配体结合位点的构象变化传递到远程螺旋-环-螺旋延伸。 相比之下,配体结合对扩展的PDZ2结构域的构象和动力学只有适度的影响。 研究表明,配体诱导的结构和动态变化以及假定PDZ结合位点的序列变化决定了NHERF1两个PDZ结构域的配体选择性和结合亲和力。