200伏

NHERF1 C-末端CFTR肽和扩展PDZ2结构域的复合结构


实验数据快照

  • 方法:溶液核磁共振
  • 计算的一致性:1000 
  • 提交的符合项:20 
  • 选择标准:能量最低的结构

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文学类

配体诱导NHERF1延伸PDZ结构域的动态变化。

巴塔查里亚,S。Ju,J.H。新奥尔洛娃。哈吉,J.A。D.考本。布,Z。

(2013)分子生物学杂志425: 2509-2528

  • 内政部:https://doi.org/10.1016/j.jmb.2013.04.001
  • 相关结构的主要引文:
    200万吨,200万u,200伏

  • PubMed摘要:

    多域支架蛋白NHERF1调节各种跨膜受体和离子转运蛋白的组装和细胞内运输。NHERF1的两个PDZ(突触后密度95/盘大/小带闭塞1)结构域具有非常不同的配体结合能力:PDZ1识别多种具有高亲和力的膜蛋白,而PDZ2仅结合有限数量的靶蛋白。在这里,我们利用核磁共振技术确定了区分囊性纤维化跨膜调节器羧基末端1型PDZ结合基序(QDTRL)两个PDZ结构域结合亲和力的结构和动力学机制。与PDZ2类似,我们确定了一个耦合到规范PDZ1域的螺旋-环-螺旋子域。扩展的PDZ1域具有高度的灵活性,在快时间尺度和慢时间尺度上具有相关的主干运动,而扩展的PDZ域则相对刚性。扩展的PDZ1结构的延展性有助于将配体结合位点的构象变化传递到远程螺旋-环-螺旋延伸。相比之下,配体结合对扩展的PDZ2结构域的构象和动力学只有适度的影响。研究表明,配体诱导的结构和动态变化以及假定PDZ结合位点的序列变化决定了NHERF1两个PDZ结构域的配体选择性和结合亲和力。


  • 组织附属关系

    美国纽约州纽约市Convent大道89号纽约结构生物中心,邮编:10027。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体详细信息图像
Na(+)/H(+)交换调节辅因子NHE-RF1128智人突变: 0 
基因名称:SLC9A3R1型NHERF公司NHERF1
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质O14745号机组 (智人)
转到UniProtKB:O14745号机组
PHAROS公司:O14745号机组
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团O14745号机组
序列注释
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通过序列| 3D结构查找类似蛋白质

实体ID:2
分子链条序列长度有机体详细信息图像
C-末端CFTR肽5不适用突变: 0 
序列注释
展开
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实验数据和验证

实验数据

  • 方法:溶液核磁共振
  • 计算的一致性:1000 
  • 提交的符合项:20 
  • 选择标准:能量最低的结构

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