铜绿假单胞菌PAO1，PA3544型（algE）

细胞质的
细胞质膜
周质的
外层膜
细胞外的
未知
在JBrowse中查看 假循环/代谢途径

基因特征概述

应变 铜绿假单胞菌PAO1（Stover等人，2000）
GCF_ 000006765.1 |最新
位置标签
PA3544型
姓名
algE公司
同义词：alg76
复制副本 染色体
基因组定位 3968449- 3969921 （+股）
转座子突变体 2PAO1中的转座子突变体

交叉引用

参考序列 NP_252234.1号
GI公司 15598740
昂飞 PA3544_标签_地址
Entrez公司 879838
GenBank（基因银行） AAG06932.1型
INSDC公司 AAG06932.1型
NCBI位置标签 PA3544型
蛋白质id（GenBank） gb|AAG06932.1|AE004775_3|gnl|PseudoCAP|PA3544
钨极氩弧焊 NTL03PA03544号
UniParc公司 UPI000012584E公司
UniProtKB帐户 第18895页
UniProtKB ID 阿尔及利亚
UniRef100公司 UniRef100_P18895号文件
UniRef50公司 UniRef50_P18895号文件
UniRef90公司 UniRef90_P18895号文件

产品

要素类型 客户尽职调查
编码帧 1
产品名称
藻酸盐生产外膜蛋白AlgE前体
产品名称置信度：第1类
同义词 海藻酸生产蛋白AlgE
翻译证据
充电（pH值7） -20.33
Kyte-Doolittle疏水值 -0.642
分子量（kDa） 54.4
等电点（pI） 4.67

亚细胞定位

单个映射
本地化 信心 采购管理信息
外层膜 第3类
外层膜 第1类
亚细胞定位的其他证据

AlphaFold 2蛋白质结构预测

使用由开发的神经网络模型预测蛋白质结构DeepMind公司。如果UniProtKB登录与该蛋白质相关，将在下面提供搜索链接。

在AlphaFold数据库中查找预测的3D结构：搜索

PDB 3D结构

加入 标题 加入日期 化合物 来源 分辨率 方法 标识百分比
4XNK型 转运蛋白 01/15/15 AlgE1的X射线结构 铜绿假单胞菌PAO1 2.8 X射线衍射 100
4AZL公司 膜蛋白 06/26/12 在褐藻酸转运蛋白AlgE的中观结构中，来自铜绿假单胞菌PAO1的晶型2。 空气假单胞菌 2.8 X射线衍射 100
5IYU公司 膜蛋白 03/24/16 算法_CIM 铜绿假单胞菌PAO1 2.7 X射线衍射 100
4B61型 膜蛋白 08/08/12 铜绿假单胞菌（Pseudomoas aeruginosa，PAO1）中褐藻酸转运蛋白AlgE的中层结构。晶体形态3。 假单胞菌（PSEUDOMAS AERUGINOSA PAO1） 2.402 X射线衍射 100
5D5D型 转运蛋白 08/10/15 AlgE在100K下的细观原位连续X射线晶体学结构 铜绿假单胞菌（ATCC 15692/PAO1/1C/PRS 101/LMG 12228株） 2.4 X射线衍射 100
4XNL（4×NL） 转运蛋白 01/15/15 AlgE2的X射线结构 铜绿假单胞菌PAO1 2.9 X射线衍射 100
4AFK（空军基地） 膜蛋白 01/19/12 铜绿假单胞菌海藻酸转运蛋白AlgE的中层结构 空气假单胞菌 1.897 X射线衍射 100
3个RBH 转运蛋白 03/29/11 铜绿假单胞菌藻酸盐输出蛋白AlgE的结构 铜绿假单胞菌 2.301 X射线衍射 100
7ACG公司 膜蛋白 09/10/20 在褐藻酸盐出口商的中观结构中，来自铜绿假单胞菌的AlgE在9.8单酰基甘油中 铜绿假单胞菌 1.85 X射线衍射 100

毒力证据

来源1
数据库 变频数据库:VF0091型
类别 海藻酸生物合成
证据
宿主生物
笔记
参考

病原体关联分析

结果
通用
在病原体和非病原体菌株中都发现
该基因在6个属中被发现

正交/比较基因组学

假单胞菌属Ortholog数据库 在假单胞菌正交试验数据库中查看正交试验
假单胞菌群 POG002122（490名成员）
推定Inparalogs 未找到

互动

STRING数据库 搜索预测的蛋白质-蛋白质相互作用使用：
搜索词：PA3544型
搜索词：algE公司

人类同源

工具书类

过氧化氢对铜绿假单胞菌的粘液转化：囊性纤维化肺中毒力激活的机制。
Mathee K、Ciofu O、Sternberg C、Lindum PW、Campbell JIA、Jensen P、Johnsen AH、Givskov M、Ohman DE、Sören M、Höiby N、Kharazmi A
微生物学（阅读）1999年6月；145（第6部分）：1349-1357
PubMed编号：10411261
铜绿假单胞菌海藻酸生物合成相关algE基因的核苷酸序列和表达。
Chu L、May TB、Chakrabarty AM、Misra TK
基因1991年10月30日；107(1):1-10
PubMed编号：1743507