铜绿假单胞菌PAO1，PA0336号（rppH）

基因特征概述

应变	铜绿假单胞菌PAO1（Stover等人，2000） GCF_ 000006765.1 |最新
位置标签	PA0336号
姓名	rppH值 同义词：ygdP
复制副本	染色体
基因组定位	378096- 378575 （+股）
转座子突变体	2PAO1中的转座子突变体
直系基因中的转座子突变	1直系遗传中的转座子突变体

交叉引用

参考序列	NP_249027.1号
GI公司	15595533
昂飞	PA0336_位于
Entrez公司	882290
GenBank（基因银行）	AAG03725.1型
INSDC公司	AAG03725.1型
NCBI位置标签	PA0336号
蛋白质id（GenBank）	gb|AAG03725.1|AE004471_8|gnl|PseudoCAP|PA0336
钨极氩弧焊	NTL03PA00337型
UniParc公司	UPI0000130902公司
UniProtKB帐户	Q9X4P2号
UniProtKB ID	RPPH_海上
UniRef100公司	UniRef100_A6UYD9型
UniRef50公司	UniRef50_A6UYD9型
UniRef90公司	统一参考90_A6UYD9

产品

要素类型	客户尽职调查
编码帧	1
产品名称	RNA焦磷酸水解酶 产品名称置信度：第1类
同义词	双核糖苷低聚磷酸焦磷酸酶 Nudix水解酶YgdP
翻译证据	使用纳米流高压液相色谱（HPLC）结合LTQ XL质谱仪上的微喷雾电离进行鉴定（PMID:24291602）。
充电（pH值7）	4.17
Kyte-Doolittle疏水值	-0.500
分子量（kDa）	18.7
等电点（pI）	9.51

亚细胞定位

单个映射	本地化 信心 采购管理信息 细胞质的 第3类 20472543
亚细胞定位的其他证据

AlphaFold 2蛋白质结构预测

使用由开发的神经网络模型预测蛋白质结构DeepMind公司。如果UniProtKB登录与该蛋白质相关，将在下面提供搜索链接。

在AlphaFold数据库中查找预测的3D结构：搜索

病原体关联分析

结果	通用 在病原体和非病原体菌株中都发现 该基因在247个属中被发现

正交/比较基因组学

假单胞菌属Ortholog数据库	在假单胞菌正交试验数据库中查看正交试验
假单胞菌群	POG000328（533名成员）
推定Inparalogs	未找到

互动

STRING数据库

搜索预测的蛋白质-蛋白质相互作用使用： 搜索词：PA0336号 搜索词：rppH值 搜索词：RNA焦磷酸水解酶

人类同源

工具书类

与大肠杆菌K1侵袭性相关的基因ygdP指定了一种Nudix水解酶，Orf176，对腺苷（5’）-五磷酸-（5′）-腺苷（Ap5A）具有活性。 Bessman MJ、Walsh JD、Dunn CA、Swaminathan J、Weldon JE、Shen J 生物化学杂志2001年10月12日；276(41):37834-8 PubMed编号：11479323

Nudix型RNA焦磷酸水解酶提供毒性因子绿脓杆菌素的内环境稳定，并在铜绿假单胞菌中发挥全局调节作用。 Kujawa M、Lirski M、Ziecina M、Drabinska J、Modzelan M、Kraszewska E Mol Microbiol 2017年11月；106(3):381-394 PubMed编号：28833678