铜绿假单胞菌PAO1，PA0285型（皮帕）

基因特征概述

应变	铜绿假单胞菌PAO1（Stover等人，2000） GCF_ 000006765.1 |最新
位置标签	PA0285型
姓名	皮帕
复制副本	染色体
基因组定位	318312- 320594 （-股）
转座子突变体	2PAO1中的转座子突变体
直系基因中的转座子突变	1直系遗传中的转座子突变体

交叉引用

参考序列	NP_248976.1号
GI公司	15595482
昂飞	PA0285_位于
Entrez公司	879674
GenBank（基因银行）	AAG03674.1型
INSDC公司	AAG03674.1型
NCBI位置标签	PA0285型
蛋白质id（GenBank）	gb|AAG03674.1|AE004466_8|gnl|PseudoCAP|PA0285
钨极氩弧焊	NTL03PA00286型
UniParc公司	UPI00000C4FE1号机组
UniProtKB帐户	问题9I6K5
UniProtKB ID	Q9I6K5_海洋
UniRef100公司	统一参考100_Q9I6K5
UniRef50公司	UniRef50_Q4KK97号文件
UniRef90公司	UniRef90_Q9I6K5号文件

产品

要素类型	客户尽职调查
编码帧	1
产品名称	环二GMP磷酸二酯酶 产品名称置信度：第1类
同义词	推测磷酸二酯酶
翻译证据	使用纳米流高压液相色谱（HPLC）结合LTQ XL质谱仪上的微喷雾电离进行鉴定（PMID:24291602）。
充电（pH值7）	-12.43
Kyte-Doolittle疏水值	-0.275
分子量（kDa）	86.4
等电点（pI）	6.31

亚细胞定位

单个映射	本地化 信心 PMID（项目管理标识） 细胞质膜 第3类 20472543
亚细胞定位的其他证据

AlphaFold 2蛋白质结构预测

使用由开发的神经网络模型预测蛋白质结构DeepMind公司。如果UniProtKB登录与该蛋白质相关，将在下面提供搜索链接。

在AlphaFold数据库中查找预测的3D结构：搜索

病原体关联分析

结果	通用 在病原体和非病原体菌株中都发现 在536属中发现了对该基因的攻击

正交/比较基因组学

假单胞菌属Ortholog数据库	在假单胞菌正交试验数据库中查看正交试验
假单胞菌群	POG000282（516名成员）
推定Inparalogs	未找到

互动

STRING数据库

搜索预测的蛋白质-蛋白质相互作用使用： 搜索词：PA0285型 搜索词：皮帕 搜索词：环二GMP磷酸二酯酶

人类同源

工具书类

铜绿假单胞菌碱性c-di-GMP所需的双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶。 Wei Q、Leclercq S、Bhasme P、Xu A、Zhu B、Zhang Y、ZhangM、Wang S、Ma LZ 应用环境微生物2019年11月1日；85(21) PubMed编号：31444209

c-di-GMP磷酸二酯酶PipA（PA0285）调节铜绿假单胞菌PAO1的自身聚集和Pf4噬菌体的产生。 Cai YM、Yu KW、Liu JH、Cai Z、Zhou ZH、Liu Y、Wang TF、Yang L 应用环境微生物2022年6月28日；88（12）：e0003922 PubMed编号：35638845