宫颈癌蛋白质组

宫颈癌是全世界女性第三常见的癌症。生存率因癌症分期而异。经过治疗，80-90%的I期女性和50-65%的II期女性在诊断后5年内仍能存活。只有25%至35%的III期癌症女性和15%或更少的IV期癌症女性在5年后仍能存活。

两种可通过性交传播的人乳头瘤病毒（HPV）是几乎所有宫颈癌的病因。风险因素包括早熟性行为、多个性伴侣、吸烟和社会经济地位低下。有一种已获批准的预防人乳头瘤病毒感染的疫苗。

大多数宫颈癌是起源于宫颈远端鳞状上皮的鳞状细胞癌。由宫颈管内的柱状细胞引起的癌被定义为腺癌，并且更为罕见。

在这里，我们使用TCGA转录组学数据和基于抗体的蛋白质数据来探索宫颈癌蛋白质组。根据291例患者的转录组数据，731个基因被认为是预后基因；223基因与不良预后和508基因与预后良好有关。

TCGA数据分析

在这项元数据研究中，我们使用了来自TCGA的数据，TCGA共有291名鳞癌或腺癌患者的转录组学数据。在收集数据时，大多数患者（220名患者）仍然活着。缺少有关阶段分布的信息。

宫颈癌的不良预后基因

对于不利基因，诊断时较高的相对表达水平会显著降低患者的总体生存率。有223宫颈癌预后不良相关基因。在表1中，列出了与不良预后相关的前20个最重要的基因。

PON2是一个与宫颈癌不良预后相关的基因最好的分离是通过16.7fpkm的表达截止来实现的，这将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为36%，低表达患者的5年生存率为77%，p值：1.43e-5。抗体靶向免疫组织化学染色PON2（HPA029193）显示了宫颈癌样本中的差异表达模式。

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PON2-生存分析
PON2-高表达
PON2-低表达

LPCAT1是另一个与宫颈癌预后不良相关的基因最好的分离是通过16.4 fpkm的表达截止值实现的，将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为43%，低表达患者的生存率为72%，p值：7.11e-5。使用抗体靶向的免疫组织化学染色LPCAT1型（HPA012501）显示宫颈癌样本中的差异表达模式。

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LPCAT1型-生存分析
LPCAT1型-高表达
LPCAT1型-低表达

表1。这20个最显著的基因与宫颈癌的不良预后相关。

基因描述预测位置 mRNA（癌症） p值

EREG公司表皮调节素分泌型，膜 1.1 1.67e-7页

ESM1系统内皮细胞特异性分子1 保密 3.3 2.11e-7段

EGLN1型 egl-9家族缺氧诱导因子1 细胞内 8.2 2.99电子-7

GALNT2公司多肽N-乙酰氨基半乳糖基转移酶2 细胞内 23 1.22e-6

功能表11 岩藻糖基转移酶11 细胞内 4 2.39e-6号机组

AIG1型雄激素诱导1 膜，细胞内 6.1 3.26e-6段

ASL公司精氨琥珀酸裂解酶细胞内 9.3 4.05e-6段

ITGA5型整合素亚基α5 膜 14 4.07电子-6

ERG公司 ETS转录因子ERG 细胞内 1.4 6.18e-6页

SUMF2型硫酸酯酶修饰因子2 细胞内 30.4 6.58e-6页

喷洒7 SPRY域包含7 细胞内 4.5 8.48e-6页

C1或74 1号染色体开放阅读框74 细胞内 4.7 8.52e-6段

TAF1A公司 TATA-box结合蛋白相关因子，RNA聚合酶I亚单位A 细胞内 2.6 9.26至6

LOXL2型赖氨酰氧化酶样2 分泌型，细胞内 8.3 9.83电子-6

TGFBI公司转化生长因子β诱导分泌型，细胞内 40.1 1.03e-5号机组

MOCS1号机组钼辅因子合成1 细胞内 1.6 1.07电子-5

CXCL8系列 C-X-C基序趋化因子配体8 保密 37.2 1.18e-5段

P4HA2型脯氨酰4-羟化酶亚基α2 细胞内 8.3 1.24e-5号机组

FASN公司脂肪酸合成酶细胞内 30.1 1.42e-5号机组

PON2 对氧磷酶2 分泌型，细胞内 15.2 1.43e-5号机组

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宫颈癌的有利预后基因

对于有利基因，诊断时较高的相对表达水平可显著提高患者的总体生存率。有508与宫颈癌预后良好相关的基因。在表2中，列出了与良好预后相关的前20个最重要的基因。

MCM5是一个与宫颈癌预后良好相关的基因最佳分离是通过21.2 fpkm的表达截止值实现的，该值将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为72%，低表达患者为34%，p值：2.81e-6。抗体靶向免疫组织化学染色MCM5型（CAB000101）显示了宫颈癌样本中的差异表达模式。

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百万立方米5-生存分析
MCM5型-高表达
MCM5型-低表达

ARHGAP4是另一个与宫颈癌预后良好相关的基因最佳分离是通过在17.0 fpkm的表达截止值实现的，该值将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为79%，低表达患者的生存率为53%，p值：3.94e-5。抗体靶向免疫组织化学染色ARHGAP4型（HPA001012）显示了宫颈癌样本中的差异表达模式。

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ARHGAP4型-生存分析
ARHGAP4型-高表达
ARHGAP4型-低表达

表2。这20个最显著的基因与宫颈癌的良好预后相关。

基因描述预测位置 mRNA（癌症） p值

EAF2型 ELL相关因子2 细胞内 4 2.25e-9页

SSBP3型单链DNA结合蛋白3 细胞内 21.3 2.48e-9段

NCAPH2公司非SMC凝聚素Ⅱ复合物亚基H2 细胞内 31.4 2.24e-8页

KIF22型驱动蛋白家族成员22 细胞内 28.5 3.87e-8页

RIBC2号机组带线圈的RIB43A域2 细胞内 8.7 7.08e-8段

PLA1A公司磷脂酶A1成员A 分泌型，细胞内 1.8 2.81e-7

减贫战略36 丝氨酸蛋白酶36 保密 2.3 2.97e-7

NMRAL1型类NmrA氧化还原传感器1 细胞内 16.5 3.33e-7段

RBM38型 RNA结合基序蛋白38 细胞内 24.6 3.64e-7页

TNFRSF13C公司 TNF受体超家族成员13C 膜 1.1 4.44e-7段

ISCU公司铁硫簇组装酶细胞内 16.3 4.90至7

零位1 zyg-11相关细胞周期调节因子细胞内 15.7 1.18e-6段

SH3GLB2型含有GRB2样的SH3结构域，内白素B2 细胞内 18.9 1.56e-6型

MEI1公司减数分裂双链断裂形成蛋白1 细胞内 5.5 1.59e-6号机组

DDX49型 DEAD盒解旋酶49 细胞内 22.5 2.01e-6页

SLC25A28型溶质载体家族25成员28 细胞内 35.1 2.18e-6段

SLC2A8系列溶质载体家族2成员8 膜 5.8 2.57电子-6

阿克拉1A1 醛酮还原酶家族1成员A1 细胞内 56.2 2.66e-6页

MCM5型微小染色体维持复合物组分5 细胞内 29.7 2.81e-6

DUOX1型双氧化酶1 膜，细胞内 11.6 4.31e-6段

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宫颈癌转录组

转录组分析显示71%（n=14342)所有人类基因中（n=20162) 在宫颈癌中表达。根据宫颈癌中的mRNA水平与其他16个分析过的癌组织中mRNA水平的比值，根据宫颈癌特异性表达将所有基因分为五个不同类别之一。

图1。基于宫颈癌和所有其他癌症组织中转录物丰度，所有基因在五类中的分布。

162与其他癌症相比，这些基因在宫颈癌中的表达水平有所提高（图1）。如表3所示，提升类别进一步细分为三个类别。

表3。子宫颈癌高表达细分类别中的基因数量。

17种癌症的分布

在单个中检测到在一些地方检测到检测到多个全部检测到总计

特异性
富含癌症 0 0 2 0 2

集团丰富 0 25 59 5 89

癌症增强 8 21 35 7 71

总计 8 46 96 12 162

其他信息

宫颈癌起源于宫颈过渡区的细胞。过渡区是覆盖宫颈远端（部分）的鳞状上皮和宫颈内通道的柱状腺细胞之间的边界。国际妇产科学联合会（FIGO）分期系统确认宫颈癌的四个阶段。第一阶段描述了局限于子宫颈的癌症。第二阶段是指宫颈癌已扩散至宫颈以外，但未扩散至阴道下三分之一或盆腔壁。三期癌症已经扩散到盆腔壁和/或阴道下三分之一。IV期肿瘤超出真正的骨盆，或临床上累及膀胱和/或直肠粘膜。宫颈癌最常见的症状之一是阴道异常出血，但在某些情况下，可能直到癌症晚期才出现明显症状。

宫颈癌通常发展非常缓慢，通常会持续数月甚至数年。最初的癌前病变是可以治疗的，可以通过巴氏涂片检测出来。使用巴氏涂片成功的细胞学筛查程序显著降低了宫颈癌的发病率。

今天，大多数被诊断为宫颈癌的女性没有进行常规巴氏涂片检查，或者没有对异常的巴氏涂膜检查结果进行随访。在成功建立宫颈癌筛查项目的国家，宫颈癌筛查计划的广泛使用使浸润性宫颈癌的发病率降低了50%或更多。然而，巴氏涂片筛查在印度和中国等发展中国家仍然是一项挑战。因此，这些国家的宫颈癌发病率很高。

2006年6月，美国食品和药物管理局批准了一种预防HPV16和18感染的疫苗。研究表明，该疫苗似乎可以预防癌前病变和早期宫颈癌。