NBRC人常在微生物鸡尾酒
近年来，人类肠道内的一些细菌与肥胖、抑郁症等有着很深的关系※1，※2。同时，作为癌症的治疗药被关注的免疫检查点阻碍药的药效也暗示着与肠内细菌有关※3。因此，期待着以人类微生物分析为基础创造出新的医药品和食品等。
另一方面，人体微生物素分析由采样、保存、DNA提取、文库制备、序列、数据分析等多个工序组成，由于各工序的方法和作业者的不同，测定结果会产生偏差※4。因此，所得到的数据缺乏可靠性和比较兼容性成为了课题。
NBRC为了支持人类微生物研究，开发了国产首款“NBRC人类常在微生物鸡尾酒”，于2022年1月13日开始提供。
宣传册在这里
※1:Ozato N.et al.，npj Biofilms Microbiomes，5:28（2019）
※2:Valles-Colomer M.et al.，Nat.Microbiol。，4:623-632（2019）
※3:Routy B.et al.，Science，359:91-97（2018）
※4:Tourlousse D.M.et al.，Microbiome，9:95（2021）
NBRC人类常在微生物鸡尾酒的阵容
NBRC人常在菌体鸡尾酒（Cell-Mock-003）
NBRC人常在菌菌体鸡尾酒是将生活在人的肠内、口腔、皮肤等的18种NBRC株纯培养，将各自的细胞数等量混合而成的。
因为混合了DNA提取效率不同的革兰氏阳性/阴性菌，所以推荐在DNA提取中研究试剂和通过一系列实验工序验证原生质体等。
NBRC人常在菌DNA鸡尾酒（DNA-Mock-003）
NBRC人常在菌DNA鸡尾酒是从生活在人的肠内、口腔、皮肤等的20种NBRC株的纯培养物中提取基因组DNA，将各自的基因组DNA的拷贝数等量混合而成的。
因为混合了尺寸、GC含量、分类群不同的基因组，所以推荐用于序列文库的制备方法和数据解析方法的验证等。
- ※5：在数据表中公开了各批次的验证结果（使用喷枪序列的检测比例）和使用例（以16SrRNA基因为对象的元16S分析）的结果。
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NBRC人常在微生物鸡尾酒的特征和所含微生物
●从日本人的肠内、口腔内、皮肤等中检测出的20种※6使用NBRC股票
●混合以覆盖广泛的分类群
●平衡良好地混合难以提取DNA的革兰氏阳性菌和容易提取的阴性菌
●16S rRNA基因的拷贝数、基因组大小、GC含量多种多样
●可以获得鸡尾酒构成株的全基因组序列
●鸡尾酒构成股票可以作为NBRC股票获得
NBRC人类常在微生物鸡尾酒中含有的20种※6微生物
|
学名
|
NBRC
编号
|
革兰氏染色
|
基因组
尺寸（Mbp）
|
GC含量（%）
|
16S
rRNA
复制数
|
生物的
安全的
水平
|
|
Anaerostipes caccae
|
|
阳性 |
3.3 |
44.5 |
4个 |
1个 |
| Bifidobacterium longum |
114370 |
阳性 |
2.6 |
60.1 |
5 |
1个 |
| Bifidobacterium longumsubsp。longum |
114494 |
阳性 |
2.5 |
60.1 |
4个 |
1个 |
| Blautia parvula |
113351T |
阳性 |
6.2 |
46.7 |
5 |
1* |
| Collinsella aerofaciens |
114504 |
阳性 |
2.3 |
60.3 |
5 |
1* |
| Enterocloster clostridiofarmis |
113352 |
阳性 |
5.7 |
48.9 |
5 |
1* |
| Flavonifractor plautii |
113805 |
阳性 |
4.3 |
60.3 |
3 |
1个 |
| Lactobacillus delbrueckii |
3202※7 |
阳性 |
1.9 |
50.1 |
8个 |
1个 |
| 中继器信号 |
114413 |
阳性 |
3.8 |
42.5 |
5 |
1个 |
| Akkermansia muciniphila |
114322 |
阴性 |
2.8 |
55.7 |
3 |
1个 |
| Bacteroides uniformis |
113350 |
阴性 |
5.0 |
46.2 |
4个 |
1* |
| Escherichia coli |
3301 |
阴性 |
4.8 |
50.8 |
7 |
1个 |
| 电气石funiformis※8 |
114415 |
阴性 |
2.5 |
31.4 |
6个 |
1个 |
| 电子计算机※8 |
114414 |
阴性 |
2.6 |
50.6 |
7 |
1个 |
| Parabacteroides distasonis |
113806 |
阴性 |
5.2 |
45.0 |
7 |
1* |
| 流式调节器 |
13955T |
阳性 |
2.0 |
36.9 |
5 |
1* |
| Cutibacterium acnessubsp。 acnes |
113869 |
阳性 |
2.6 |
60.0 |
3 |
1* |
| Staphylococcus epidermidis |
113846 |
阳性 |
2.5 |
32.1 |
6个 |
1* |
| Bacillus subtilis |
13719T |
阳性 |
4.3 |
43.3 |
10 |
1个 |
| Pseudomonas putida |
14164T |
阴性 |
6.2 |
62.3 |
7 |
1* |
※6：人常在菌菌体鸡尾酒（Cell-Mock-003）中有18种
※7：本菌株注册后至2022年Lactobacillus delbrueckiisubsp。delbrueckii的基准株公开了，不过，基因组解析的结果L.delbrueckiisubsp。lactis在工作空间的边缘L.delbrueckiisubsp。jakobsenii中选择另一种天花板类型。
※8：人常在菌体鸡尾酒（Cell-Mock-003）中不含。
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关于入手
现在提供的NBRC人类常在微生物鸡尾酒有以下两种。
|
产品名称
|
NBRC人常在菌体鸡尾酒
Cell-Mock-003
|
NBRC人常在菌DNA鸡尾酒
DNA-Mock-003
|
| 内容量 |
500µL×1根 |
30µL1个 |
手续费
（含税・按运费） |
¥21340 |
¥34980 |
| 保存溶剂 |
15%glycerol in PBS（pH7.4） |
10mM Tris-HCl（pH8.5） |
| 含量 |
2x1010细胞/500µL |
1500ng/30µL |
| 保存形态 |
冻结（-80℃）※10 |
冻结（-80℃）※10 |
| 数据表※5 |
230502 NC（2023.5制造）
提供的批次 |
240101ND（2024.1制造）
提供的批次 |
了解更多信息手续费·消费税率修改的通知来修改标记元素的显示属性。
- ※5：在数据表中公开了各批次的验证结果（使用喷枪序列的检测比例）和使用例（以16SrRNA基因为对象的元16S分析）的结果。
- ※10：到手后请使用-80℃的冷冻器进行冷冻保存。
- ・手续费不包含运费（运费到付）。
- ・汇款手续费请委托人承担。
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关于NBRC人常在微生物鸡尾酒
本鸡尾酒是国立研究开发法人新能源·产业技术综合开发机构（NEDO）的“NEDO先导研究程序/新产业创造新技术先导研究程序/面向人类微生态的产业利用的解析技术及革新性控制技术的开发”（2018年度～2020年度）的支持，与国立研究开发法人产业技术综合研究所、一般社团法人日本微生物财团、以及国立研究开发法人理化学研究所共同开发。
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关于引用
在论文等中引用人类常在微生物鸡尾酒时，请引用以下论文。
Tourlousse，D.M.，Narita，K.，Miura，T.et al.Characterization and demonstration of mock communities as control reagents for accurate human microbiome community measurements。icrobiology Spectrum，10（2）：e01915-21。
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关于过去提供的数据表
过去提供的数据表如下。
| 产品名称 |
NBRC人常在菌体鸡尾酒
Cell-Mock-003 |
NBRC人常在菌DNA鸡尾酒
DNA-Mock-003 |
| 数据表※5 |
210501NC（2021.5制造） |
210401ND（2021.4制造） |
- ※5：在数据表中公开了各批次的验证结果（使用喷枪序列的检测比例）和使用例（以16SrRNA基因为对象的元16S分析）的结果。
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