分析信息基因组

数据标识 ANGE 0000000003357
数据标题 基因组(Bifidobacterium longum strain NBRC114370 chromosome,complete genome)
物种名称 Bifidobacterium longum
确认号或ID CP084012
批注 Bifidobacterium longum strain NBRC114370chromosome,complete genome。
基因组序列版本 CP084012.1
注册日期或更新日期 2021-09-30
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数组长度(bp)或数组数(rc) 2424828
形式 循环,循环
BioProject
BioSample
数组类型 genomic DNA
轨道,轨道 NBRC114370
分离源 human feces
plasmid
备注
对菌株的评论 The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline(PGAP)。Information about PGAP can be found here:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/;##Genome-Asembly-Dat-START##;Assembly Method:Flye v.2.8.3;Racon v.1.4.20;Medaka v.1.2.2;Pilon v.1.23;Assembly Name::Blon_114370;Genome Representation::完全;扩展最终版本:是;Genome Coverage::297.0x;序列技术::Illumina MiSeq;Oxford Nanopore MiniON;##Genome-Asembly-Da-END##;##Genome-Annotation-Dat-START##;Annotation Provider::NCBI;Annotation Date::09/23/2021 10:49:18;Annotation Pipeline::NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline(PGAP);Annotation Method:Best-placed reference protein set;GeneMarkS-2+;Annotation Software revision::5.3;Features Annotated:Gene;CDS;rRNA;tRNA;ncRNA;repeat_region;Genes(total)::2297;CDSs(total)::2200;生成::2143;CDSs::2143;Genes(RNA)::97;rRNAs::5,5,5(5S,16S,23S);complete rRNAs::5,5,5(5S,16S,23S);tRNAs::78;ncRNAs::4;顺序::57;CDSs(without protein)::57;Pseudo Genes(ambiguous residues)::0of57;(frameshifted)::14of57;插入:48 of 57;Pseudo Genes(internal stop)::3 of 57;Pseudo Genes(multiple problems)::7of57;CRISPR Arrays::1;##Genome-Annotation-Dat-END#
引用 1个
标题 车辆化和调车控制信息
杂志名/注册机构名 未加工的,未加工的
出版年月
卷、号、页
作者 Tourlousse,D.M.Narita,K.Miura,T.Furukawa,M.Shimamura,M.Sekiguchi,Y.Kawasaki,H。
PubMed
引用 2
标题 直接Submission
杂志名/注册机构名 Submitted(21-SEP-2021)Biomedical Research Institute,National Institute of Advanced Industrial Science and Technology,Biomedical Research Institute,AIST Tsukuba Central6,1-1Higashi,Tsukuba,Ibaraki305-8566,Japan
出版年月
卷、号、页
作者 Tourlousse,D.M.Narita,K.Miura,T.Furukawa,M.Shimamura,M.Sekiguchi,Y.Kawasaki,H。
PubMed

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提供机构 1个 Taxonomy 项目名称 0 收藏 1个 微生物种类 1个 实验 0 微生物菌株 1个 属性 文档 0 分析数据
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