| 数据标识 |
ANGE 0000000003036
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| 数据标题 |
基因组（Escherichia coli strain NBRC3301 chromosome，complete genome）
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| 物种名称 |
Escherichia coli
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| 确认号或ID |
CP048439
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| 批注 |
Escherichia coli strain NBRC3301chromosome，complete genome。
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| 基因组序列版本 |
CP048439.1
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| 注册日期或更新日期 |
2020-02-13
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| 数组获取URL |
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| 数组文件下载 |
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| CDS文件下载 |
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| 数组长度（bp）或数组数（rc） |
4656310
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| 形式 |
循环，循环
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| BioProject |
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| BioSample |
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| 数组类型 |
genomic DNA
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| 轨道，轨道 |
NBRC3301
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| 分离源 |
human feces
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| plasmid |
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| 备注 |
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| 对菌株的评论 |
Bacteria and source DNA available from Japan Collection of Microorganism（JCM）。；The annotation was added by the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline（PGAP）。Information about PGAP can be found here:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok/；##Genome-Asembly-Dat-START##；Assembly Method:Flye v.2.5；Unicylcer v.0.4.7；Genome Coverage:：45x（ONT）+100x（Illumnina）；Sequencing Technology:：Illumina MiSeq（V2chemistry，2x251bp reads）；Oxford Nanopore MiniION（R9.4.1 flow cell）；###Genome-Asembly-Da-END##；##Genome-Annotation-Dat-START##；Annotation Provider:：NCBI；Annotation Date:02/06/202010:48:18；Annotation Pipeline:：NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline（PGAP）；Annotation Method：Best-placed reference protein set；GeneMarkS-2+；Annotation Software revision:：4.11；Features Annotated:Gene；CDS；rRNA；tRNA；ncRNA；repeat_region；Genes（total）：：4609；CDSs（total）：：4486；生成：4357；CDSs（with protein）：：4357；Genes（RNA）：123；rRNAs::8,7,7（5S，16S，23S）；complete rRNAs:8,7,7（5S，16S，23S）；tRNAs::86；ncRNAs:：15；平面Genes（total）：：129；CDSs（without protein）：：129；Pseudo Genes（ambiguous residues）：：0of129；（frameshifted）：：46of129；插入：70 of 129；Pseudo Genes（internal stop）：：33 of 129；Pseudo Genes（multiple problems）：：17of129；CRISPR Arrays:：2；###Genome-Annotation-Dat-END#
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| 引用 |
1个
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| 标题 |
Escherichia coli strain NBRC3301
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| 杂志名/注册机构名 |
未加工的，未加工的
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| 出版年月 |
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| 卷、号、页 |
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| 作者 |
Tourlousse，D.M.Sakamoto，M.Miura，T.Narita，K.Ohashi，A.Uchino，Y.Yamazoe，A.Kameyama，K.Terauchi，J.Ohkuma，M.Kawasaki，H.Sekiguchi，Y。
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| PubMed |
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| 引用 |
2
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| 标题 |
直接Submission
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| 杂志名/注册机构名 |
Submitted（03-FEB-2020）Biomedical Research Institute，Advanced Biomeasurements Research Group，National Institute of Advanced Industrial Science and Technology，Biomedical Research Institute，AIST Tsukuba Central6,1-1-1-1Higashi，Tsukuba，Ibaraki305-8566，Japan
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| 出版年月 |
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| 卷、号、页 |
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| 作者 |
Tourlousse，D.M.Sakamoto，M.Miura，T.Narita，K.Ohashi，A.Uchino，Y.Yamazoe，A.Kameyama，K.Terauchi，J.Ohkuma，M.Kawasaki，H.Sekiguchi，Y。
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| PubMed |
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