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    帐户1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶(无活性)[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:329470,更新日期2024年3月5日

    摘要

    官方符号
    帐户由提供管理信息
    官方全名
    1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶(无活性)由提供管理信息
    主要来源
    管理层:管理层:1919717
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000040272 联盟基因组:MGI:1919717
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;肌形态;蘑菇总科;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    Phacs;2610203E10瑞克
    摘要
    预计可实现相同的蛋白质结合活性和转氨酶活性。预计参与细胞氨基酸代谢过程。与人类ACCS同源(1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶同系物(无活性))。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    肢体E14.5(RPKM 2.8)、CNS E11.5(RPKM2.6)和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    2 E1;2 51.62立方厘米
    外显子计数:
    14
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 2 NC_000068.8(93663812..93680343,补码)
    108.20200622 上一次装配 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 2 NC_000068.7(93833467..93849997,补码)

    染色体2-NC_000068.8描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene aristaless-like homeobox 4 Neighboring gene exostosin glycosyltransferase 2 Neighboring gene ribosomal protein S2 pseudogene Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr2:93662723-93662832 Neighboring gene 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (inactive)-like Neighboring gene predicted gene, 54116 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_05168 Neighboring gene predicted gene 1335

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    PubChem的途径

    一般蛋白质信息

    首选名称
    1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶样蛋白1
    姓名
    1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶(非功能性)
    1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶同源物
    ACC合成酶样蛋白1

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. 纳米_001290782.1NP_001277711.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型a

      参见NP_001277711.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:该变体(1)编码较长的亚型(a)。
      源序列
      AK011867、AL732472、BC039569
      共识CDS
      CCDS71105.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型,Q8CHS6型
      相关
      ENSMUSP00000106877.2公司,ENSMUST0000011246.8号
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:81483
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    2. NM_183220.3NP_899043.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型b

      参见NP_899043.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上不同,缺少5'编码区的一部分,并在下游的框内起始密码子处启动翻译。与亚型a相比,编码亚型(b)在N末端较短。
      源序列
      AK011867、AL732472、BC039569
      共识CDS
      CCDS16457.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型
      相关
      ENSMUSP00000036268.9,ENSMUST00000041593.15
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000068.8参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      93663812..93680343补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_011239625.2号XP_011237927.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X4

      参见XP_011237927.1的相同蛋白质及其注释位置

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:10247
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    2. XM_036162322.1号费用_036018215.11-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X1

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型,Q8CHS6型
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:81483
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    3. XM_006499761.4号XP_006499824.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X1

      参见XP_006499824.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型,Q8CHS6型
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:81483
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶
    4. XM_006499760.4号XP_006499823.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶样蛋白1亚型X1

      参见XP_006499823.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型,Q8CHS6型
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:81483
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    5. XM_006499764.3号XP_006499827.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X2

      参见XP_006499827.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    6. XM_006499763.3号XP_006499826.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X2

      参见XP_006499826.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型
      保守领域(1)总结
      第02450页
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    7. XM_006499765.3号XP_006499828.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X2

      参见XP_006499828.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型
      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    8. XM_006499766.3号XP_006499829.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X2

      参见XP_006499829.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2AIG8型
      相关
      ENSMUSP00000065389.5号,ENSMUST00000068513.11号
      保守领域(1)总结
      第02450页
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    9. XM_006499768.3号XP_006499831.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X4

      参见XP_006499831.1的相同蛋白质及其注释位置

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:10247
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    10. XM_030251803.1号XP_030107663.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X4

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:10247
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-甲酸合酶
    11. XM_030251804.1号XP_030107664.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X4

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:10247
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    12. XM_030251802.1XP_030107662.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X4

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:10247
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    13. XM_036162323.1号XP_036018216.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X2

      保守领域(1)总结
      PLN02450号
      位置:58460
      PLN02450;1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶
    14. XM_011239623.1号XP_011237925.1号1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶样蛋白1亚型X3

      参见XP_011237925.1的相同蛋白质及其注释位置

      保守领域(1)总结
      第00609页
      位置:62434
      类AAT;天冬氨酸转氨酶家族。该家族属于依赖磷酸吡哆醛(PLP)的天冬氨酸转氨酶超家族(第一折叠)。磷酸吡哆醛与α-氨基酸结合形成一种称为希夫碱或醛亚胺的化合物。。。

    核糖核酸

    1. XR_374480.5型RNA序列

    2. XR_004940649.1型RNA序列

    3. XR_004940650.1号RNA序列