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    Asxl2型ASXL转录调节器2[肌肉(家鼠)]

    基因ID:75302,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    Asxl2型由提供MGI公司
    官方全名
    ASXL转录调节器2由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:1922552
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000037486 联盟基因组:MGI:1922552
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    肌肉
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria属;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    mKIAA1685;4930556B16里亚克
    总结
    该基因编码果蝇Asx基因的同源物,该基因与轴向模式相关的基因相互作用。该基因突变的小鼠显示出异常的轴向骨骼模式,表明小鼠的功能与果蝇相似。该基因也可能参与骨密度,特别是破骨细胞生成。[由RefSeq提供,2012年8月]
    表达式
    在肝脏E14(RPKM 2.4)、CNS E11.5(RPKM2.3)和28个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    地点:
    12 A1.1;12 1.81立方厘米
    外显子计数:
    17
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 12 NC_000078.7(3476892..3560811)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 12 NC_000078.6(3426857..3510811)

    染色体12-NC_000078.7描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene RIKEN cDNA I920046F24 gene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31408 Neighboring gene RIKEN cDNA 1110002L01 gene Neighboring gene kinesin family member 3C Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4022 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr12:3427648-3427949 Neighboring gene predicted gene, 31332 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31410 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31411 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31412 Neighboring gene ribosomal protein S7, pseudogene 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31413 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_31417 Neighboring gene dystrobrevin, beta Neighboring gene 40S ribosomal protein S26-like

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:邮编61617
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC176101型

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    成人心脏发育中的上游活动 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与动物器官形态发生 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    骨矿化上游与骨成熟的关系 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或胚胎骨骼系统内形态发生 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    心脏发育的上游活动 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或心脏内形态发生 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    巨噬细胞分化上游因子 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内RNA聚合酶II对转录的负调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    破骨细胞分化的上游作用 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or参与骨成熟的骨矿化正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与脂肪细胞分化的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与脂质储存的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对巨噬细胞分化的正向调节 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游ofor内破骨细胞分化的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内转移酶活性正调节 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与DNA模板转录的调节 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    PR-DUB复合体的部件 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于核内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    推测Polycomb组蛋白ASXL2
    姓名
    额外的性梳,如2,转录调节器
    额外性梳样蛋白2
    多梳组蛋白ASXH2同源物

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001270988.2NP_001257917.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型1

      参见NP_001257917.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      说明
      转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较长的亚型(1)。
      源序列
      AC155273、AC160138、AK036839、AK080679、BP763544
      UniProtKB/TrEMBL公司
      B2RUG8公司,六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      pfam05066型
      地点:1183
      HARE-HTH;HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域
      pfam13919型
      地点:263381
      ASXH;Asx同源结构域
      pfam13922型
      地点:13561416
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
    2. NM_172421.6NP_766009.2号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型2

      参见NP_766009.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      说明
      转录变异体:与变异体1相比,该变异体(2)在编码区中缺少一个框内外显子。编码亚型(2)比亚型1短。
      源序列
      AC155273、AC160138、AK016141、AK036839、BP763544
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D6版本1,六层五氧化二钒,F8VQA8型
      相关的
      ENSMUSP00000117384.3公司,ENSMUST00000153102.9
      保守领域(3)总结
      pfam05066型
      地点:1183
      HARE-HTH;HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域
      辉瑞13919
      地点:212333
      ASXH;Asx同源结构域
      pfam13922型
      地点:13081368
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000078.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      3476892..3560811
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_036157639.1号XP_036013532.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X4

      UniProtKB/TrEMBL公司
      第6页第21页
      保守领域(4)总结
      PHA03247型
      地点:480924
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:13071367
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam05066型
      地点:1182
      HARE-HTH;HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域
      pfam13919型
      地点:210332
      ASXH;Asx同源结构域
    2. XM_006515239.5号XP_006515302.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X2

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(4)总结
      PHA03247型
      地点:528972
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:13551415
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam05066型
      地点:1182
      HARE-HTH;HB1,ASXL,限制性内切酶HTH结构域
      辉瑞13919
      地点:262380
      ASXH;Asx同源结构域
    3. XM_036157645.1号XP_036013538.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X8

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:340784
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11671227
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域,Asx
      pfam13919型
      地点:74192
      ASXH;Asx同源结构域
    4. XM_006515241.2号XP_006515304.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X9

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:292736
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11191179
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:22144
      ASXH;Asx同源结构域
    5. XM_030246969.2号XP_030102829.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X5

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:471915
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:12981358
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域,Asx
      辉瑞13919
      地点:205323
      ASXH;Asx同源结构域
    6. XM_036157641.1号XP_036013534.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X7

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:355799
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11821242
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:89207
      ASXH;Asx同源结构域
    7. XM_036157640.1号XP_036013533.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X6

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:457901
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:12841344
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:191309
      ASXH;Asx同源结构域
    8. XM_030246972.2号XP_030102832.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X10

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:273717
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11001160
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域,Asx
      pfam13919型
      地点:4125
      ASXH;Asx同源结构域
    9. XM_036157648.1号XP_036013541.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X10

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:273717
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      辉瑞13922
      地点:11001160
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:4125
      ASXH;Asx同源结构域
    10. XM_030246970.2号XP_030102830.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X8

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:340784
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11671227
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:74192
      ASXH;Asx同源结构域
    11. XM_036157644.1号XP_036013537.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X7

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:355799
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      辉瑞13922
      地点:11821242
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:89207
      ASXH;Asx同源结构域
    12. XM_036157642.1XP_036013535.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X7

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:355799
      PHA03247;大被盖蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11821242
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:89207
      ASXH;Asx同源结构域
    13. XM_036157649.1号XP_036013542.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X10

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:273717
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11001160
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:4125
      ASXH;Asx同源结构域
    14. XM_036157646.1号XP_036013539.1号推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X8

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:340784
      PHA03247;大被盖蛋白UL36;临时的
      辉瑞13922
      地点:11671227
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:74192
      ASXH;Asx同源结构域
    15. XM_036157643.1号XP_036013536.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X7

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:355799
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11821242
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:89207
      ASXH;Asx同源结构域
    16. XM_036157647.1号XP_036013540.1型推测Polycomb组蛋白ASXL2亚型X8

      UniProtKB/TrEMBL公司
      六层五氧化二钒
      保守领域(3)总结
      PHA03247型
      地点:340784
      PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
      pfam13922型
      地点:11671227
      PHD_3;转录增强子的PHD结构域
      pfam13919型
      地点:74192
      ASXH;Asx同源结构域