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    BC034090号cDNA序列BC034090[肌肉(家鼠)]

    基因ID:207792,更新日期2024年3月5日

    总结

    官方符号
    BC034090号由提供MGI公司
    官方全名
    cDNA序列BC034090由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:2672904
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000033722 联盟基因组:MGI:2672904
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    肌肉
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria属;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    mKIAA1614;6820428L09号
    总结
    预计可启用蛋白激酶C结合活性。预计参与中心体循环;细胞极性的建立或维持;和细胞定位的调节。预测在心尖质膜中具有活性;细胞皮层;和细胞核。与人类同源的KIAA1614(KIAA1615)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在肾成体(RPKM 13.3)、肾上腺成体(RP KM 6.5)和19个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    地点:
    1个G3;1 66.47立方厘米
    外显子计数:
    14
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 1 NC_000067.7(155088217..155123504,补遗)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6(155212471..155245639,补码)

    1号染色体-NC_000067.7描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene predicted gene, 30922 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2569 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:157001032-157001362 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E500 Neighboring gene major histocompatibility complex, class I-related Neighboring gene syntaxin 6 Neighboring gene high mobility group protein B3 pseudogene Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:157081058-157081259 Neighboring gene predicted gene, 31102 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7760 Neighboring gene xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 Neighboring gene predicted gene, 17974 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:157242079-157242280 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr1:157264431-157264732 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02724 Neighboring gene predicted gene, 31713

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:邮编61617
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    一般蛋白质信息

    首选名称
    非特征化蛋白KIAA1614同源物

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001370865.1号NP_001357794.1非特征化蛋白KIAA1614同源物

      状态:已验证

      源序列
      AC110268型
      共识CDS
      CCDS87895.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A087WP46型
      相关的
      ENSMUSP00000139623.2号,ENSMUST00000186156.7
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:11141195
      PDZ信号;PDZ结构域存在于各种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C端多肽,并结合到内部(非C端)。。。
      pfam15737型
      地点:337461
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      155088217..155123504补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_006530031.5号XP_006530094.1号非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X2

      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:10461127
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质-蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C末端多肽,并结合内部(非C末端)。。。
      pfam15737型
      地点:337461
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    2. XM_148974.13号XP_148974.3手机非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X1

      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:10831164
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质-蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C末端多肽,并结合内部(非C末端)。。。
      pfam15737型
      地点:306430
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    3. XM_030252447.1号XP_030108307.1号非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X3

      UniProtKB/TrEMBL公司
      F6T2X5型,企8K058
      相关的
      ENSMUSP00000037456.5,ENSMUST00000035914.5号
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:752833
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C端多肽,并结合到内部(非C端)。。。
      辉瑞15737
      地点:199
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    4. XM_006530035.4号XP_006530098.1号非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X3

      UniProtKB/TrEMBL公司
      F6T2X5型,企8K058
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:752833
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C端多肽,并结合到内部(非C端)。。。
      pfam15737型
      地点:199
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    5. XM_036163040.1号XP_036018933.1型非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X3

      UniProtKB/TrEMBL公司
      F6T2X5型,企8K058
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:752833
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质-蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C末端多肽,并结合内部(非C末端)。。。
      pfam15737型
      地点:199
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    6. XM_006530036.5号XP_006530099.1号非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X4

      UniProtKB/TrEMBL公司
      企8K058
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:687768
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C端多肽,并结合到内部(非C端)。。。
      pfam15737型
      地点:134
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)
    7. 圣诞节_036163046.1XP_036018939.1号非特征化蛋白KIAA1614同源亚型X5

      UniProtKB/TrEMBL公司
      企8K058
      保守领域(2)总结
      cd00992
      地点:619700
      PDZ信号;PDZ结构域发现于多种真后生动物信号分子中,通常呈串联排列。可能负责特定的蛋白质相互作用,因为大多数PDZ结构域结合C端多肽,并结合到内部(非C端)。。。
      pfam15737型
      地点:134
      DUF4685;未知函数域(DUF4685)

    核糖核酸

    1. XR_003954294.2号RNA序列

    2. XR_004941304.1型RNA序列

    3. 传真:004941302.1RNA序列

    4. XR_004941303.1型RNA序列

    5. XR_387502.5型RNA序列

    6. XR_878643.4号RNA序列