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基质金属蛋白酶9基质金属肽酶9[智人(人类)]

基因ID:4318,更新日期2024年5月14日

总结

官方符号
基质金属蛋白酶9由提供HGNC公司
官方全名
基质金属肽酶9由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:7176
请参阅相关
乐团:ENSG00000100985 MIM:120361; 联盟基因组:HGNC:7176
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
也称为
GELB;CLG4B;基质金属蛋白酶-9;心轴2
总结
基质金属蛋白酶(MMP)家族的蛋白质参与正常生理过程中细胞外基质的分解,如胚胎发育、生殖和组织重塑,以及疾病过程,如关节炎和转移。大多数MMP作为无活性的前蛋白分泌,当被细胞外蛋白酶切割时被激活。该基因编码的酶降解IV型和V型胶原蛋白。对恒河猴的研究表明,该酶参与IL-8诱导的骨髓造血祖细胞动员,而小鼠研究表明,其在肿瘤相关组织重塑中发挥作用。[由RefSeq提供,2008年7月]
表达式
骨髓(RPKM144.9)、淋巴结(RPKM49.8)和其他3种组织中的偏倚表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

位置:
20季度13.12
外显子计数:
13
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 20 NC_000020.11(46008908..46016561)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 20 NC_060944.1(47744921..47752589)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 20 NC_000020.10(44637547..44645200)

染色体20-NC_000020.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene zinc finger protein 335 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12968 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17956 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:44603922-44604458 Neighboring gene ferritin light chain pseudogene 1 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:44624055-44624562 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:44632651-44633302 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:44633303-44633954 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr20:44640983-44641493 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12969 Neighboring gene SLC12A5 and MMP9 antisense RNA 1 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12970 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12971 Neighboring gene solute carrier family 12 member 5 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13245 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 3425 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 17957 Neighboring gene nuclear receptor coactivator 5 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:44717073-44717887 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr20:44717888-44718701

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:第4337页
  • 出版物:项目管理标识号24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

表型

相关条件

描述 测验
Metaphyseal发育不全2
MedGen公司:C2751322元 OMIM公司:613073 基因审查:无法使用的
比较实验室

EBI GWAS目录

描述
宿主-微生物相互作用形成了炎症性肠病的遗传结构。

HIV-1相互作用

复制交互

互动 酒吧
HIV-1感染显著降低血浆临床样本中的MMP9 公共医学
巨噬细胞感染HIV-1减少组织蛋白酶B和MMP9之间的相互作用 公共医学
siRNA敲低基质金属肽酶9(明胶酶B;92kDa明胶酶;92kDAIV型胶原酶;MMP9)抑制HeLa P4/R5细胞中HIV-1复制 公共医学

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 HIV-1 JRFL Env(gp120)上调ARPE-19和原始人类RPE细胞中的MMP9,并依赖DC-SIGN 公共医学
环境价值 HIV-1 gp120介导的人甘露糖受体结合诱导阴道上皮细胞MMP-9表达 公共医学
环境价值 siRNA抑制NRF2导致暴露于HIV-1 gp120的星形胶质细胞中NOX2、NFkappaB(p65/p50)、TNF-α和MMP-9蛋白增加 公共医学
环境价值 基于侧脑室注射HIV-1包膜糖蛋白gp120,基质金属蛋白酶MMP2和MMP9参与IL-1β裂解和激活的成熟过程 公共医学
环境价值 与gp120和甲基苯丙胺共同孵育刺激LPS诱导的单核细胞来源巨噬细胞MMP-9表达和生物活性 公共医学
环境价值 嗜T和嗜M型HIV-1 gp120蛋白能够诱导T细胞或胶质瘤细胞分泌基质金属蛋白酶9(MMP-9);MMP-9是HIV-1患者脑脊液中存在的一种细胞外金属蛋白酶 公共医学
奈夫 nef(奈夫) HIV-1 Nef的过度表达和ALK对星形胶质瘤细胞明胶酶活化的影响 公共医学
nef(奈夫) 大鼠脑脊液(CSF)样品中的MMP-9活性是通过将重组HIV-1 Nef蛋白注射到大鼠脑室内而不是在注射热处理的Nef、HIV-1 gp120、HIV-1gp160或PBS后诱导的 公共医学
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat的基本结构域(49RKRRQR57)对于增强FGF诱导的ERK、Rho-A和MLC2的激活以及上调人足细胞MMP-9的表达至关重要 公共医学
塔特 HIV-1 Tat蛋白通过抑制闭塞素的表达和通过基质金属蛋白酶-9裂解闭塞素来增加原代人脑微血管内皮细胞的通透性 公共医学
塔特 人类星形胶质细胞中MMP-9的表达需要HIV-1Tat诱导的MAPK(ERK、JNK和p38)激活 公共医学
塔特 NF-κB激活途径导致HIV-1Tat介导的人星形胶质细胞MMP-9上调 公共医学
塔特 HIV-1 Tat以IL-1β、TNF-α和酪氨酸磷酸酶依赖性方式上调单核细胞MMP-9的表达 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 GOA提供

过程 证据代码 酒吧
参与细胞凋亡过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞迁移 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与细胞迁移 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与细胞对UV-A的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞对镉离子的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞对脂多糖的反应 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与细胞对活性氧的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与胶原分解代谢过程 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与胶原分解代谢过程 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与胚胎植入 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与内胚层细胞分化 IEP公司
从表达式模式推断
更多信息
公共医学 
参与肾上腺素受体信号通路 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与细胞外基质分解 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与细胞外基质组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与巨噬细胞分化 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与凋亡过程的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与阳离子通道活性的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞凋亡信号通路中半胱氨酸型内肽酶活性的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与肾发育中上皮细胞分化的负调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与内源性凋亡信号通路的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与DNA结合的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与凋亡过程的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与表皮生长因子受体信号通路的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与角质形成细胞迁移的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与蛋白质磷酸化的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与受体结合的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与线粒体细胞色素c释放的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与血管相关平滑肌细胞增殖的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与蛋白水解 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与神经炎症反应的调节 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
淀粉样β的参与反应 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与骨骼系统开发 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
基质金属蛋白酶-9
姓名
巨噬细胞明胶酶
基质金属肽酶9(明胶酶B、92kDa明胶酶、92kDAIV型胶原酶)
基质金属蛋白酶9(明胶酶B、92kDa明胶酶、92kDAIV型胶原酶)
V型胶原酶
NP_004985.2号

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_011468.1参考序列基因

    范围
    5001..12654
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. NM_004994.3号NP_004985.2号基质金属蛋白酶-9前蛋白

    参见NP_004985.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    源序列
    AW468235、BC006093、CN288579、J05070
    共识CDS
    CCDS13390.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    b2r7版本9第14780页Q3LR70系列第8季度第725季度Q9H4Z1型问题9UCJ9问题9UCL1问题9UDK2
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B7Z507型
    相关的
    ENSP0000361405.3标准ENST00000372330.3标准
    保留域(6)总结
    智能00059
    位置:281329
    FN2;纤维结合蛋白2型结构域
    cd00094
    位置:514704
    换热器;血红素样重复序列。;血红素是一种血红素结合蛋白,将血红素运输到肝脏。类血红素重复序列出现在玻璃体凝集素和一些基质金属蛋白酶家族(基质蛋白)中。一些基质蛋白的HX重复序列结合组织抑制剂。。。
    cd04278
    位置:115444
    ZnMc_MMP;锌依赖性金属蛋白酶,基质金属蛋白酶(MMP)亚家族。基质金属蛋白酶(MMPs)负责细胞外基质和细胞表面分子的大量胞周蛋白水解,在形态发生、细胞命运和细胞凋亡等方面起着至关重要的作用。。。
    pfam00040型
    位置:347388
    fn2;纤维连接蛋白II型结构域
    pfam00413型
    位置:115444
    肽酶_M10;马特里欣
    pfam04886型
    位置:472506
    PT;PT重复

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000020.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    46008908.46016561
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060944.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    47744921.47752589
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)