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    CLDN1型水蛭素1[智人(人类)]

    基因ID:9076,更新于2024年3月17日

    总结

    官方符号
    CLDN1型由提供HGNC公司
    官方全名
    克劳丁1由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:2032
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000163347 MIM:603718; 联盟基因组:HGNC:2032
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已审核
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    CLD1;SEMP1;ILVASC公司
    总结
    紧密连接代表上皮细胞或内皮细胞片中的一种细胞间粘附模式,在细胞周围形成连续的密封,并作为物理屏障阻止溶质和水自由通过细胞旁空间。这些连接由向外的细胞质小叶中的一组连续网络链组成,向内的胞质外小叶中有互补的凹槽。该基因编码的蛋白质是克劳丁家族的一员,是一种完整的膜蛋白,是紧密连接链的组成部分。功能缺失突变导致新生儿鱼鳞病硬化性胆管炎综合征。[由RefSeq提供,2008年7月]
    表达式
    皮肤(RPKM 138.8)、肝脏(RPKM107.2)和6种其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    28年第3季度
    外显子计数:
    4
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    2003年10月10日 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) NC_000003.12(190305707..190322446,补码)
    2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) NC_060927.1(193121997..193138734,补体)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) NC_000003.11(190023496..190040235,补遗)

    染色体3-NC_000003.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:189894452-189894952 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:189894953-189895453 Neighboring gene RNA, U6 small nuclear 1109, pseudogene Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20984 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20985 Neighboring gene NMNAT1 pseudogene 3 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr3:189949260-189950459 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 15001 Neighboring gene claudin 16 Neighboring gene OCT4-NANOG hESC enhancer GRCh37_chr3:190080003-190080564 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 3521 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 14389 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr3:190158638-190158813 Neighboring gene transmembrane protein 207 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 15127 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20986 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 15002 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:190232063-190232564 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:190232565-190233064 Neighboring gene OCT4-NANOG hESC enhancer GRCh37_chr3:190258615-190259497 Neighboring gene interleukin 1 receptor accessory protein Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr3:190283646-190284845 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:190302729-190303262 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:190303263-190303796 Neighboring gene glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1 pseudogene 3

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    表型

    相关条件

    说明 测验
    新生儿鱼鳞病硬化性胆管炎综合征
    MedGen公司:1843355元 OMIM公司:607626 基因审查:无法使用的
    比较实验室

    EBI GWAS目录

    说明
    神经认知作为精神分裂症抗精神病药物治疗反应指标的全基因组药物基因组研究。

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp120 环境 暴露于HIV-1或HIV-1 gp120导致人类视网膜色素上皮细胞中紧密连接蛋白ZO-1、Occludin、Claudin-1、Claudin-2、Claudins-3、Claudinin-4和Claudin-5的显著下调 公共医学
    Tat公司 塔特 HIV-1 Tat干扰并下调视网膜色素上皮细胞中的紧密连接蛋白claudin-1、claudin-3和claudin-4,而claudin-2上调 公共医学
    塔特 脑微血管内皮细胞暴露于HIV-1Tat导致claudin-1、claudin-5和闭塞带-2的表达减少,claudin-5的细胞重新分布,这表明Tat对血脑屏障的潜在干扰 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    功能 证据代码 酒吧
    实现相同的蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现相同的蛋白质结合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现结构分子活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    激活病毒受体 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    卷入双细胞紧密连接组件 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    卷入双细胞紧密连接组件 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    通过质膜细胞粘附分子参与钙非依赖性细胞间粘附 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞连接维护 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or或在细胞-细胞连接组织内 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对丁酸盐的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞对铅离子的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    转化生长因子β刺激参与细胞反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    肿瘤坏死因子参与细胞反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与II型干扰素的细胞反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与血神经屏障的建立 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    内皮性肠屏障的建立 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    皮肤屏障的建立 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与肝再生 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与血脑屏障的维持 美国国家航空航天局
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与双细胞紧密连接组装的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与创伤愈合中上皮细胞增殖的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与创伤愈合的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白复合物齐聚 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与地塞米松反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    与乙醇反应有关 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    白介素-18的参与反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与脂多糖反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    涉及对有毒物质的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与共生体进入宿主细胞 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与跨血神经屏障的外源性转运 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    第1条
    姓名
    衰老相关上皮膜蛋白1

    NCBI参考序列(参考序列)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_021418.1参考序列基因

      范围
      5001..21740
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_021101.5号NP_066924.1号第1条

      参见NP_066924.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      源序列
      AC009520、AY358652、DA907275
      共识CDS
      CCDS3295.1公司
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O95832号
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A5JSJ9型,D3DNV9型,第7季度第4季度第9季度
      相关的
      ENSP00000295522.3标准,ENST00000295522.4标准
      保守领域(1)总结
      pfam00822型
      位置:5173
      PMP22_Claudin;PMP-22/EMP/MP20/Claudin家族

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000003.12参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      190305707..190322446补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060927.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      193121997..193138734补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)