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    CDT1型染色质许可和DNA复制因子1[智人（人类）]

    基因ID:81620，更新日期2024年4月11日

    总结

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    官方符号
    CDT1型由提供HGNC公司
    官方全名
    染色质许可和DNA复制因子1由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:24576
    请参阅相关
    乐团：ENSG00000167513 MIM:605525； 联盟基因组：HGNC:24576
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
    也称为
    DUP；RIS2系统
    总结
    该基因编码的蛋白质参与DNA复制所必需的复制前复合物的形成。编码的蛋白质可以结合双生素，阻止复制，并可能起到阻止该蛋白质在不适当的来源启动复制的作用。细胞周期蛋白A依赖性激酶对该蛋白的磷酸化导致该蛋白降解。[由RefSeq提供，2011年3月]
    表达式
    骨髓（RPKM13.5）、胎盘（RPKM2.5）和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    鼠标 全部的
    新款
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    基因组背景

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    位置：
    16季度24.3
    外显子计数：
    10
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    2003年10月10日 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 16 NC_000016.10（88803789..88809258）
    2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 16 NC_060940.1（94874309..94879778）
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) 16 NC_000016.9（88870197…8887566）

    染色体16-NC_000016.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene piezo type mechanosensitive ion channel component 1 (Er blood group) Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7872 Neighboring gene HSP90AB1 associated lncRNA 1 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88810272-88810958 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7873 Neighboring gene uncharacterized LOC339059 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88829625-88830384 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88830385-88831146 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88834041-88834626 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88834627-88835210 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88835211-88835794 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88836379-88836962 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88836963-88837546 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88842592-88843342 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 11369 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 11370 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 11371 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 11372 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7874 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88850859-88851772 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7876 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88856742-88857272 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88869451-88870026 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7878 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88870745-88871628 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88871629-88872511 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88873249-88873762 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88876670-88877205 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7879 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88878711-88879395 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88879396-88880079 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88882597-88883098 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr16:88883099-88883598 Neighboring gene CDK7 strongly-dependent group 2 enhancer GRCh37_chr16:88884193-88885392 Neighboring gene adenine phosphoribosyltransferase Neighboring gene galactosamine (N-acetyl)-6-sulfatase Neighboring gene Neanderthal introgressed variant-containing enhancer experimental_46374 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 7882 Neighboring gene uncharacterized LOC107983950 Neighboring gene trafficking protein particle complex subunit 2L

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
    • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目：项目编号：4337
    • 出版物：项目管理标识号24309898
    • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. 不典型肝细胞的增殖和非癌组织中CDT1的表达与肝癌术后复发有关。 森山M，等科学代表，2022年11月28日。PMID 36443564，免费PMC文章
    2. 儿童急性淋巴细胞白血病中CDT1的高表达通过激活EMT促进细胞增殖、侵袭和迁移。 石焕，等《生物Regul Homost Agents杂志》，2021年7月30日。PMID 34348833号
    3. 一名携带双等位基因CDT1变体的Meier-Gorlin综合征成年人成功怀孕。 纳普KM，等《美国医学遗传学杂志》，2021年3月PMID 33338304
    4. Cdt1变异体揭示了与细胞周期蛋白/CDK和MCM相互作用的意外方面，对正常基因组复制很重要。 Pozo PN，等Mol Biol Cell，2018年12月1日。PMID 30281379，免费PMC文章
    5. 不匹配修复蛋白被招募到紫外光损伤部位导致G1期许可因子Cdt1降解。 田中M，等《细胞周期》，2017年4月3日。PMID 28278049，免费PMC文章

    查看PubMed中的所有（131）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    什么是GeneRIF？
    1. 不典型肝细胞的增殖和非癌组织中CDT1的表达与肝癌术后复发有关。
      标题：不典型肝细胞的增殖和非癌组织中CDT1的表达与肝细胞癌术后复发相关。
    2. 长非编码RNA-PCGEM1通过海绵状microRNA miR-129-5p增强染色质许可和DNA复制因子1的表达，促进前列腺癌的进展。
      标题：长非编码RNA-PCGEM1通过海绵状微RNA miR-129-5p增强染色质许可和DNA复制因子1表达，促进前列腺癌进展。
    3. 儿童急性淋巴细胞白血病中CDT1的高表达通过激活EMT促进细胞增殖、侵袭和迁移。
      标题：儿童急性淋巴细胞白血病中CDT1的高表达通过激活EMT促进细胞增殖、侵袭和迁移。
    4. 一例患有Meier-Gorlin综合征且携带双等位基因CDT1变异体的成年人的成功妊娠。
      标题：一名患有Meier-Gorlin综合征的成人成功怀孕，该综合征携带双等位基因CDT1变异体。
    5. SLFN11促进CUL4降解CDT1以应对复制性DNA损伤，而其缺失会导致ATR/CHK1抑制剂的合成致死性。
      标题：SLFN11促进CUL4降解CDT1，以应对复制性DNA损伤，而其缺失导致ATR/CHK1抑制剂的合成致死性。
    6. Meier-Gorlin综合征患者中发现的Cdt1突变导致Cdt1/微小染色体维持蛋白结合或细胞周期蛋白/CDK结合缺陷
      标题：Cdt1变异体揭示了与细胞周期蛋白/CDK和MCM相互作用的意外方面，对正常基因组复制很重要。
    7. 有丝分裂激酶Aurora B与Cdt1相互作用并磷酸化Cdt1。Aurora B类磷酸化Cdt1表现出MT结合减弱，其细胞表达诱导有缺陷的动粒微管附着，伴随着有丝分裂进程的延迟。
      标题：Cdt1通过Aurora B激酶依赖机制稳定动粒-微管连接。
    8. Cdt2整个C末端区域的缺失降低了其对Cdt1的多泛素化活性，导致Cdt1降解减少。
      标题：Cdt2 C末端区域的DNA结合域增强了DNA合成偶联的CRL4Cdt2泛素连接酶对Cdt1的活性。
    9. 结果表明，Cdc6和Cdt1在高水平表达时，单独或联合表达，与乳腺癌患者队列中较低的生存率显著相关。与这一发现一致，与正常乳腺上皮细胞相比，乳腺癌细胞中Cdc6和Cdt1的表达上调。ER阴性乳腺癌中Cdc6和Cdt1的表达显著增高。
      标题：Cdc6和Cdt1在乳腺癌中的预后意义。
    10. CDT1、MCM7和NUDT1在肝细胞癌组织中表达上调，比单纯的α-胎儿蛋白提供更准确的诊断。
      标题：基于下一代测序，五种新的致癌信号可作为AFP相关的肝细胞癌诊断生物标记物。
    提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（66）

    表型

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    在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

    使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

    相关条件

    说明 测验
    Meier-Gorlin综合征4
    MedGen公司：C3151120号 OMIM公司：613804 基因审查：无法使用的
    		比较实验室

    EBI GWAS目录

    说明
    日本人群血液学和生物化学特征的全基因组关联研究。
    EBI GWAS目录

    变化

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    参见ClinVar中的变体

    参见dbVar中的研究和变体

    参见变体查看器（GRCh37.p13）

    参见变体查看器（GRCh38）

    基因型

    HIV-1相互作用

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    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    Vpr（Vpr） 虚拟专用数据库 Chk1在Ser345位置的磷酸化是HIV-1Vpr诱导的G2/M阻滞所必需的，可能是通过Cdt1的DNA再复制信号传导 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

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    互动

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    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

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    标记

    同源性

    基因本体论 GOA提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用DNA绑定 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    启用DNA绑定 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    支持DNA聚合酶结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    启用染色质结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    		 公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    参与DNA复制检查点信号 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与DNA复制检查点信号 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与DNA复制起始前复合物组装 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与DNA复制起始前复合物组装 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    有丝分裂纺锤体微管与动粒的连接 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与细胞分裂 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与有丝分裂细胞周期 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与DNA模板DNA复制的负调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与细胞周期的负调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与DNA复制的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与DNA模板DNA复制的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与染色质结合的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与DNA模板DNA复制起始的调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与DNA模板DNA复制起始的调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    参与调控核细胞周期DNA复制 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与山梨醇反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    位于动粒内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    定位于核体 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		  
    核质定位 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		  
    核质定位 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		  
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    位于核内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    位于核内 美国国家航空航天局
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    		 公共医学 

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    DNA复制因子Cdt1
    姓名
    双人停车，果蝇，同源

    NCBI参考序列（参考序列）

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    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_028266.1参考序列基因

      范围
      5012..10481
      下载
      GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_030928.4号→NP_112190.2DNA复制因子Cdt1

      参见NP_112190.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已审阅

      源序列
      AB053172、AC092384、BC000137
      共识CDS
      CCDS32510.1标准
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q86XX9问题，Q96CJ5型，Q96GK5型，Q96H67型，Q96HE6号机组，问题9BWM0，问题9H211
      相关的
      ENSP00000301019.4标准，ENST00000301019.9标准
      保守领域（2）总结
      cd08674
      位置：168→352
      Cdt1_m；复制许可因子Cdt1的中间翼螺旋折叠结合双生素，以抑制MCM复合体与复制起源和DNA的结合
      cd08767
      位置：415→537
      Cdt1_c；复制许可因子Cdt1的C末端折叠对Cdt1活性至关重要，并与MCM2-7解旋酶直接相互作用

    注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000016.10参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      88803789..88809258
      下载
      GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060940.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      94874309..94879778
      下载
      GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）
    核苷酸 蛋白质
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    第9季度第11.3季度 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q9H211

    基因链接输出

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

    化学品信息
    医疗
    分子生物学数据库
    研究材料
    工具
    其他