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    NFKB2型核因子κB亚基2[智人(人类)]

    基因ID:4791,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    NFKB2型由提供HGNC公司
    官方全名
    核因子κB亚基2由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:7795
    请参阅相关
    乐团:ENSG0000077150 MIM:164012; 联盟基因组:HGNC:7795
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    第52页;第100页;H2TF1;LYT10;CVID10;LYT-10;NF-kB2;第49页/第100页
    总结
    该基因编码转录因子复合物核因子-kappa-B(NFkB)的一个亚基。NFkB复合物在多种细胞类型中表达,并作为炎症和免疫功能相关基因的中心激活物发挥作用。由该基因编码的蛋白质可以作为转录激活物或阻遏物,这取决于其二聚体伴侣。p100全长蛋白被共同翻译成p52活性形式。在B细胞淋巴瘤中观察到该位点的染色体重排和移位,其中一些可能导致融合蛋白的形成。该基因在第18号染色体上有一个假基因。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2013年12月]
    表达式
    阑尾(RPKM 21.5)、骨髓(RPKM20.6)和25个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    10季度24.32
    外显子计数:
    24
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    2003年10月10日 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 10 NC_000010.11(102394110..102402529)
    2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 10 NC_060934.1(103279058..103287478)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) 10 NC_000010.10(104153867..104162286)

    染色体10-NC_000010.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2752 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2753 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2754 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3925 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3926 Neighboring gene paired like homeodomain 3 Neighboring gene golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104029238-104029738 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104029739-104030239 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13217 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 15234 Neighboring gene uncharacterized LOC107984263 Neighboring gene MPRA-validated peak1080 silencer Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr10:104147078-104147638 Neighboring gene NANOG hESC enhancer GRCh37_chr10:104151284-104151791 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr10:104151792-104152298 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3927 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2755 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3928 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3929 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13585 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2756 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104160632-104161328 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 3575 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2757 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104169870-104170552 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104170553-104171234 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2758 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3930 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2759 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3931 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3932 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3933 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3934 Neighboring gene pleckstrin and Sec7 domain containing Neighboring gene F-box and leucine rich repeat protein 15

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 HIV-1 gp120治疗后,人类神经细胞中α-管蛋白、TRADD、IFN-gamma R2、GAS1、MADD、NF-kappaB、I-kappa B、14-3-3蛋白、APaf1、PARP、IGF-1受体、RB1、Rb2/p130、ARC和caspase 6的mRNA表达水平上调 公共医学
    包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 HIV-1 gp41细胞质域诱导的NFkappaB活化需要TAK1、RelA和NEMO蛋白 公共医学
    环境价值 HIV-1 gp41的细胞质域(残基704-773)诱导NFkappaB活化。gp41中12个氨基酸序列(762CLFSYHRLRDLL)的缺失导致NFkappaB活性的显著丧失,酪氨酸766尤其重要 公共医学
    Tat公司 塔特 HIV-1Tat与IFN-γ和TNF-α联合作用,通过激活p38、Jnk和Akt信号通路及其下游转录因子NF-κB和STAT-1α,增加人类星形胶质细胞中CXCL10 mRNA和蛋白 公共医学
    塔特 用细胞透性超氧化物歧化酶(SOD)处理星形胶质细胞可降低Tat诱导的ROS生成和NF-kappaB活化 公共医学
    塔特 在HIV-1 Tat表达和HIV感染的星形胶质细胞中,内皮素-1(ET-1)通过ET-1启动子中的NF-kappaB(NF-kabpaB)反应位点显著升高 公共医学
    塔特 在凝胶转移、GST下拉和亲和矩阵分析中,HIV-1 Tat已在体外与NFkappaB结合 公共医学
    塔特 NFkappaB将p160核受体辅激活物GRIP1连接到HIV-1 LTR启动子,从而通过HIV-1 Tat调节该启动子的完全激活 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat通过细胞干扰素诱导的双链RNA依赖性蛋白激酶PKR激活NFkappaB 公共医学
    塔特 p56-lck在HIV-1 Tat激活NFkappaB中起关键作用 公共医学
    塔特 一氧化氮抑制HIV-1 Tat激活NFkappaB 公共医学
    Vpr(Vpr) 虚拟专用数据库 HIV-1 Vpr通过诱导丝氨酸866处NFKappaB2(p100)的磷酸化来刺激非规范NFKappa B途径,从而将p100加工成RelB/p52及其随后的核转位 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    组件 证据代码 酒吧
    Bcl3/NF-kappaB2复合物的一部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    部分染色质 ISA公司
    根据序列比对推断
    更多信息
     
    细胞质中有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于细胞质中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于胞浆中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    核质定位 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
     
    核质定位 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    核因子NF-kappa-B p100亚单位
    姓名
    DNA-结合因子KBF2
    NFKB,p52/p100亚单位
    淋巴细胞易位染色体10蛋白
    核因子Kappa-B亚单位2
    核因子NF-kappa-B p52亚单位
    B细胞中Kappa轻链基因增强子的核因子2
    B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
    癌基因Lyt-10
    转录因子NFKB2

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_033874.2参考序列基因

      范围
      6596..13415
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)轻轨_1347

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_001077494.3号NP_001070962.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

      参见NP_001070962.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      说明
      转录变体:该变体(1)编码最长的亚型(a)。变体1和5编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AL121928、S76638
      共识CDS
      CCDS41564.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A8K9D9型D3DR83型质量00653Q04860问题Q9BU75型Q9H471型Q9H472型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
      相关的
      ENSP0000358983.3号ENST00000369966.8号
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
      cd08798
      位置:774849
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:483620
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NF-κB被认为是应激反应的中枢调节因子,被不同的应激条件激活,包括物理应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:531629
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:488547
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:599630
      ANK;ANK重复[结构图案]
    2. NM_001261403.3号NP_001248332.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

      参见NP_001248332.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      说明
      转录变体:与变体1相比,该变体(4)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
      源序列
      AL121928号
      共识CDS
      CCDS41565.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
      相关的
      ENSP0000498308.1标准ENST00000652277.1标准
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
      人民币08798元
      位置:774849
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:483620
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:531629
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:488547
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:599630
      ANK;ANK重复[结构图案]
    3. 纳米_001288724.1NP_001275653.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

      参见NP_001275653.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      说明
      转录变体:与变体1相比,该变体(3)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
      源序列
      AL121928、BC002844、DB091090
      共识CDS
      邮编41565.1
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
      相关的
      ENSP0000410256.1标准ENST00000428099.6
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
      cd08798
      位置:774849
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:483620
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:531629
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:488547
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:599630
      ANK;ANK重复[结构图案]
    4. NM_001322934.2NP_001309863.1型核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

      状态:已审阅

      说明
      转录变体:该变体(5)和变体1编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AK098415,AL121928,KT935449
      共识CDS
      CCDS41564.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A8K9D9型D3DR83型Q00653问题Q04860问题Q9BU75型Q9H471型第9季度第472次
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
      相关的
      ENSP0000499294.1标准ENST00000661543.1标准
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
      cd08798
      位置:774849
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:483620
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:531629
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:488547
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:599630
      ANK;ANK重复[结构图案]
    5. NM_001322935.1NP_001309864.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型c

      状态:已审阅

      源序列
      AL121928、BC002844
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
    6. NM_002502.6号NP_002493.3号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

      参见NP_002493.3的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      说明
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
      源序列
      AL121928号
      共识CDS
      CCDS41565.1号文件
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A1P8C958型
      相关的
      ENSP0000189444.6标准ENST00000189444.11号机组
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
      cd08798
      位置:774849
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:483620
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NF-κB被认为是应激反应的中枢调节因子,被不同的应激条件激活,包括物理应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:531629
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:488547
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:599630
      ANK;ANK重复[结构图案]

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000010.11参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      102394110..102402529
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060934.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      103279058..103287478
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)