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    镁4a甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4,同工酶A[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:269181,更新日期2024年5月9日

    总结

    官方符号
    镁4a由提供MGI公司
    官方全名
    甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4,同工酶A由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:2662992
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000026110 联盟基因组:MGI:2662992
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria属;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    GnT-IVa;glcNAc-T-IVa;9530018I07Rik公司
    总结
    激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性。作用于蛋白质N-连接糖基化的上游或内部。预计位于高尔基体内;胞外区域;和膜。预计为膜的组成部分。预计在高尔基球堆栈中活跃;内质网;和内质网-高尔基体中间室。以多种结构表达,包括消化系统;泌尿生殖系统;神经系统;鼻子;和呼吸系统。与人MGAT4A同源(α-1,3-甘露糖基-糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在大肠成体(RPKM 27.4)、结肠成体(RTKM 23.5)和20个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

    地点:
    1 B类;1 15.46立方厘米
    外显子计数:
    19
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 1 NC_000067.7(37478421..37580599,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6(37439340..37541060,补码)

    染色体1-NC_000067.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene cytochrome C oxidase assembly factor 5 Neighboring gene unc-50 homolog Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37528102-37528303 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1540 Neighboring gene G1 to S phase transition pseudogene Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1541 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00677 Neighboring gene predicted gene, 39627 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5748 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37642841-37643028 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37643098-37643207 Neighboring gene RIKEN cDNA 4930556I23 gene Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37671888-37672102 Neighboring gene capping protein inhibiting regulator of actin like Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00679 Neighboring gene RIKEN cDNA 4930470B04 gene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00681

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:邮编61617
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?
    提交: 新GenerRIF 更正

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(1)
    • 目标(2)1个引文

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    组件 证据代码 酒吧
    高尔基体中的位置 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    高尔基球堆栈中的is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    内质网内is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    内质网高尔基体中间室中的is_active_ 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于细胞外区域 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    α-1,3-腺苷-糖蛋白4-β-N-乙酰基葡糖胺基转移酶A
    姓名
    N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa
    N-糖基-寡糖-糖蛋白N-乙酰葡糖胺基转移酶IVa
    UDP-N-乙酰氨基葡萄糖:α-1,3-D-甘露醇β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖苷转移酶IVa
    NP_001277730.1号
    NP_776295.1号
    XP_006496085.1型
    XP_006496087.1型
    XP_006496089.1型
    XP_011236828.1号
    XP_017176450.1型
    XP_017176453.1号
    XP_017176454.1号
    XP_017176455.1号
    XP_017176456.1号
    XP_036021327.1号
    XP_036021329.1号
    XP_036021332.1型
    XP_036021335.1号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节为中报告的基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001290801.1号NP_001277730.1α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型2

      参见NP_001277730.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      说明
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)在5'编码区使用交替的框内剪接位点。编码蛋白(亚型2)比亚型1短。
      源序列
      AC084390、AC140321、AK035332、AK076502、AK155724、AK163327
      共识CDS
      CCDS69882.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q812G0型
      相关的
      ENSMUSP0000012111.2公司,ENSMUST00000154819.8号
      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:94371
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    2. NM_173870.3NP_776295.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型1

      参见NP_776295.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      说明
      转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较长的蛋白质(亚型1)。
      源序列
      AC084390、AC140321、AK035332、AK076502、AK155724、AK163327
      共识CDS
      CCDS14893.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第三季度第1季度,Q80UI0型,Q812G0型
      相关的
      ENSMUSP00000114175.2,ENSMUST0000051952.8
      保守领域(2)总结
      pfam04666型
      地点:103380
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:287302
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      37478421..37580599补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_036165442.1号XP_036021335.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X4

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第3季度第1季度,Q80UI0型,Q812G0型
      保守领域(2)总结
      辉瑞04666
      地点:103380
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:287302
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]
    2. XM_017320964.2号XP_017176453.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:1135
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    3. XM_017320966.1号XP_017176455.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:1135
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    4. XM_006496026.2号XP_006496089.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

      参见XP_006496089.1的相同蛋白质及其注释位置

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:1135
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    5. XM_017320961.2号XP_017176450.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X7

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:94371
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    6. 圣诞节_017320965.1XP_017176454.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

      保留域(1)总结
      pfam04666型
      地点:1135
      糖转移54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    7. XM_017320967.1号XP_017176456.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X9

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:1135
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    8. XM_006496024.3号XP_006496087.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X5

      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:103380
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
    9. XM_006496022.5号XP_006496085.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X4

      参见XP_006496085.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第三季度第1季度,Q80UI0型,Q812G0型
      保守领域(2)总结
      pfam04666型
      地点:103380
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:287302
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]
    10. XM_036165436.1号XP_036021329.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X2

      保守领域(2)总结
      pfam04666型
      地点:140417
      糖转移54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:324339
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]
    11. 圣诞节_036165439.1XP_036021332.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X3

      保守领域(2)总结
      pfam04666型
      地点:131408
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:315330
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]
    12. XM_036165434.1号XP_036021327.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X1

      保守领域(2)总结
      pfam04666型
      地点:140417
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区
      cd21105
      地点:324339
      类PGAP4;推测TM2螺旋[结构基序]
    13. XM_011238526.3号XP_011236828.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X6

      参见XP_011236828.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q812G0型
      保守领域(1)总结
      pfam04666型
      地点:94371
      糖转运蛋白_54;N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV(GnT-IV)保守区