美国国旗

美国政府的官方网站

格式

发送至:

选择目的地
    • 显示当前项目。

    FHL2型四个半LIM结构域2[智人(人类)]

    基因ID:2274,更新日期2024年4月7日

    总结

    官方符号
    FHL2型由提供HGNC公司
    官方全名
    四个半LIM域2由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:3703
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000115641 MIM:602633; 联盟基因组:HGNC:3703
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    DRAL;AAG11;FHL-2;SLIM3;修身-3
    总结
    该基因编码一个仅含四个半LIM蛋白家族的成员。家族成员包含两个高度保守、串联排列的锌指结构域,其中四个高度保守的半胱氨酸与每个锌指中的锌原子结合。这种蛋白质被认为在细胞外膜的组装中起作用。此外,该基因在正常成肌细胞转化为横纹肌肉瘤细胞的过程中下调,编码蛋白可能作为早老素-2和细胞内信号通路之间的链接。已鉴定出编码不同亚型的多种交替剪接变体。[由RefSeq提供,2016年1月]
    表达式
    心脏(RPKM 149.2)、卵巢(RPKM139.8)和13个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的FHL2基因组数据查看器
    位置:
    第2季度12.2
    外显子计数:
    11
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 2 NC_000002.12(105357712..105438529,补码)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 2 NC_060926.1(105818881..105899699,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.0p13型(GCF_000001405.25号) 2 NC_000002.11(105974169..106054986,补码)

    2号染色体-NC_000002.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:105866724-105867602 Neighboring gene transforming growth factor beta receptor associated protein 1 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16313 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 6730 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 11837 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16314 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16315 Neighboring gene C2orf49 divergent transcript Neighboring gene chromosome 2 open reading frame 49 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:105985867-105986368 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr2:105986369-105986868 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 16316 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr2:106015289-106016111 Neighboring gene NANOG hESC enhancer GRCh37_chr2:106043866-106044367 Neighboring gene uncharacterized LOC105373529 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr2:106093757-106093969 Neighboring gene VISTA enhancer hs2590 Neighboring gene uncharacterized LOC105375311

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用bHLH转录因子结合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    实现相同的蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    启用金属离子绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使转录辅助调节因子活性发挥作用 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    激活转录辅抑制因子活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    启用转录因子结合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    启用转录因子结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    Z光盘中的活动 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    局部粘着 HDA公司 公共医学 
    核质定位 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    四个半LIM结构域蛋白2
    姓名
    LIM域蛋白DRAL
    aging-相关基因11
    横纹肌肉瘤LIM蛋白下调
    骨骼肌LIM-蛋白3

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_008844.2参考SeqGene

      范围
      5261..82948
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形),轻轨_740

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001039492.3号NP_001034581.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      参见NP_001034581.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(5)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AC012360、AC108058、DQ266432、L42176
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      第3天第0天,Q2TSB7问题,数量561w1,第6季度第9季度第8季度
      相关的
      ENSP0000322909.8标准,ENST00000322142.13号机组
      保守领域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第一个LIM域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    2. NM_001318894.1号NP_001305823.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(6)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AC108058、CR936682、DQ266432
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,第6季度第9季度第8季度
      相关的
      ENSP0000386892.3号,恩斯特00000409177.6
      保留域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第一个LIM域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    3. NM_001318895.3NP_001305824.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(7)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AC108058,DQ266432
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP0000433567.2标准,ENST00000530340.6标准
      保留域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第一个LIM结构域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    4. NM_001318896.2NP_001305825.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(8)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AC012360、AL521653、DA682076、DQ266432
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP0000386633.1号,ENST00000408995.5标准
      保守领域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第一个LIM结构域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第二个LIM结构域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    5. NM_001318897.2号NP_001305826.1号四个半LIM域蛋白2亚型b

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(9)在5’UTR中不同,与变体2相比,缺少一个替代外显子。与亚型a相比,生成的亚型(b)在N末端较短。变体9和10编码相同的亚型。
      源序列
      AB158503、AC012360、BP257466、DQ266432
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q53T40型
      保守领域(3)总结
      cd09431号
      位置:48104
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:107164
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:143
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    6. NM_001318898.2NP_001305827.1号四个半LIM域蛋白2亚型b

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:与变体2相比,该变体(10)缺少两个交替的外显子。与亚型a相比,生成的亚型(b)在N末端较短。变体9和10编码相同的亚型。
      源序列
      AC012360、BI562043、DQ266432
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q53T40型
      保守领域(3)总结
      cd09431号
      位置:48104
      LIM3_Fhl2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第三个LIM结构域
      cd09433号
      位置:107164
      LIM4_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第四个LIM结构域
      cl02475号
      位置:143
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    7. NM_001318899.2NP_001305828.1号四个半LIM域蛋白2亚型c

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(11)在5’UTR中不同,与变体2相比,它包含一个替代的内部外显子。与亚型a相比,生成的亚型(c)在N末端较短。
      源序列
      AC012360、AC108058、BM559077、DA682076、DQ266432
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q53T40型
      保守领域(3)总结
      cd09431号
      位置:54110
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:113170
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:149
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    8. NM_001374399.1NP_001361328.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(12)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AC012360、AC068273、AC108058
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,数量561w1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP00000386665.1,恩斯特00000409807.5
      保守领域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第一个LIM域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    9. NM_001450.4号NP_001441.4号四个半LIM域蛋白2亚型a

      参见NP_001441.4的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(1)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      AA758053、AC012360、BC014397、L42176
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP00000377021.3,ENST00000393353.7标准
      保留域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第一个LIM域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    10. NM_201555.3号NP_963849.1号四个半LIM域蛋白2亚型a

      参见NP_963849.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(2)编码亚型a。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型。
      源序列
      BC014397,L42176
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP0000344266.5号,ENST00000344213.9号机组
      保守领域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第一个LIM结构域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第二个LIM域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指
    11. NM_201557.5号NP_963851.2号四个半LIM域蛋白2亚型a

      参见NP_963851.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(4)在5'UTR上有所不同。变体1、2、4、5、6、7、8和12都编码相同的亚型(a)。
      源序列
      BP257466、DQ266432、U29332
      共识CDS
      CCDS2070.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题13229,问题13644,问题14192,问题2I5I4,Q5TM15问题,问题9P294
      UniProtKB/TrEMBL公司
      D3DVK0型,Q2TSB7问题,问题561W1,问题6I9R8
      相关的
      ENSP0000377020.3号文件,ENST00000393352.7标准
      保守领域(5)总结
      cd09422
      位置:3697
      LIM1_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第一个LIM结构域
      cd09426
      位置:101157
      LIM2_FHL2;四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)的第二个LIM结构域
      cd09431号
      位置:162218
      LIM3_Fhl2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第三个LIM域
      cd09433号
      位置:221278
      LIM4_FHL2;四个半LIM域蛋白2(FHL2)的第四个LIM域
      cl02475号
      位置:533
      直线电机;LIM是一个小的蛋白质相互作用域,包含两个锌指

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000002.12参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      105357712..105438529补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060926.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      105818881..105899699补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    抑制的参考序列

    以下参考序列已被抑制。解释

    1. NM_201556.1号:抑制的序列

      描述
      NM_201556.1:该RefSeq被永久性抑制,因为它是一个非传感介导的mRNA衰变(NMD)候选基因。