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    Krt8(Krt8)角蛋白8[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:16691,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    Krt8(Krt8)由提供MGI公司
    官方全名
    角蛋白8由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:96705
    参见相关内容
    恩森布尔:ENSMUSG0000049382 联盟基因组:MGI:96705
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    K8;卡2;EndoA;Krt2-8;Krt-2.8
    总结
    预计可启用支架蛋白结合活性。作用于几个过程的上游或内部,包括参与胚胎胎盘发育的细胞分化;细胞表面受体信号通路;以及肝细胞凋亡过程。位于多个蜂窝组件中,包括Z盘;顶端外侧质膜;和肌膜。以多种结构表达,包括消化系统;早期胚胎;泌尿生殖系统;表皮系统;和感觉器官。该基因的人类同源基因与肝硬化有关。与人类KRT8同源(角蛋白8)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    成人结肠(RPKM 1701.0)、成人大肠(RPKM 1411.0)和其他6种组织中的偏向性表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    15层;15 57.2立方厘米
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7(101905146..101912777,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 15 NC_000081.6(101996711..102004342,补遗)

    染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene keratin 79 Neighboring gene keratin 78 Neighboring gene predicted gene, 36026 Neighboring gene predicted gene, 41404

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC118110型

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现含蛋白复合物结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使支架蛋白结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    角蛋白,II型细胞骨架8
    姓名
    CK-8型
    细胞角蛋白内切A
    细胞角蛋白-8
    角蛋白复合物2,碱性,基因8
    Ⅱ型角蛋白Kb8

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此它们的版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_031170.2号NP_112447.2角蛋白,II型细胞骨架8

      参见NP_112447.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      145777肯尼亚先令
      共识CDS
      CCDS27868.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第11679页,Q3KQK5号,Q3TGI1号机组,Q3TJE1号机组,第3季度7,Q61463问题,Q61518号,Q61519号
      相关的
      ENSMUSP000000023952.9号,恩斯穆斯特00000023952.10
      保守领域(3)总结
      pfam00038型
      位置:96407
      长丝;中间丝蛋白
      pfam16208型
      位置:6993
      角蛋白2_head;角蛋白II型头部
      第24005条
      位置:288347
      DUF2570;功能未知的蛋白质(DUF2570)

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      101905146..101912777补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)