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    阿格尔晚期糖基化终产物特异性受体[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:11596,更新日期2024年5月14日

    总结

    官方符号
    阿格尔由提供MGI公司
    官方全名
    晚期糖基化终产物特异性受体由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:893592
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000015452 联盟基因组:MGI:893592
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;蘑菇总科;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    愤怒
    总结
    启用S100蛋白结合活性;高级糖基化终产物结合活性;和肝素结合活性。参与多种过程,包括细胞对淀粉样β的反应;长时突触增强负调控;积极调节细胞因子的产生。多个过程的上游或内部行为,包括诱导阳性趋化性;晚期糖基化终产物受体活性的负调控;积极调节大分子代谢过程。位于细胞外间隙和质膜。以多种结构表达,包括消化系统;脑;泌尿生殖系统;溶血性突起系统腺体;和肺。该基因的人类同源基因与多种疾病有关,包括自身免疫性疾病(多发性);心血管系统疾病(多发);囊性纤维化;肾功能衰竭(多发);狼疮性肾炎。与人AGER(高级糖基化终产物特异性受体)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    针对肺成人的限制性表达(RPKM 481.7)查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    17 B1;17 18.18厘米
    外显子计数:
    10
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 17 NC_000083.7(34816545..34819911)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 17 NC_000083.6(34597460..34600937)

    17号染色体-NC_000083.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene G-protein signalling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans) Neighboring gene pre B cell leukemia homeobox 2 Neighboring gene ring finger protein 5 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E45 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E11640 Neighboring gene 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 Neighboring gene EGF-like domain 8

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与星形胶质细胞活化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    星形胶质细胞发育中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    通过JAK-STAT参与细胞表面受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    淀粉样β蛋白参与细胞反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与葡萄糖介导的信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内诱导阳性趋化性 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    炎症反应中的上游活动 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与学习或记忆 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与小胶质细胞活化 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与小胶质细胞活化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与血液循环负调节 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞粘附的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与胶原生物合成过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮细胞迁移的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮细胞增殖的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与白细胞介素-10产生的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与长期突触抑制的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与长期突触增强的负调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与长期突触增强的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质磷酸化的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元投射发育 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与ERK1和ERK2级联的正向调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与JNK级联的正向调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_JUN激酶活性的正向调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与NF-kappaB转录因子活性的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与活化T细胞增殖的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与淀粉样前体蛋白分解代谢过程中天冬氨酸型内肽酶活性的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与自噬的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与趋化因子产生的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与树突状细胞分化的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮细胞凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮素生成的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与上皮细胞向间充质细胞转化的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与成纤维细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与成纤维细胞增殖的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与基因表达的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与异型细胞-细胞粘附的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与白细胞介素-1β产生的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与白细胞介素-12产生的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与白细胞介素-6产生的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or对单核细胞趋化蛋白-1产生的正向调节 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与单核细胞外渗的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与非规范NF-kappaB信号转导的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与p38MAPK级联的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与吞噬、吞噬的正向调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白磷酸化的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与活性氧代谢过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与平滑肌细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与平滑肌细胞增殖的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与肿瘤坏死因子产生的正调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与B型胰腺细胞凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或膜蛋白定位内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与CD4阳性α-βT细胞活化的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_在DNA结合调节范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与调节T细胞介导的细胞毒性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与炎症反应的调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与炎症反应的调节 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与长时程突触增强的调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与p38MAPK级联调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与p38MAPK级联调节 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与自发突触传递的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    淀粉样β的参与反应 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或缺氧反应中 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    卷入细胞转移 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    参与胞吞作用 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与跨血脑屏障转运 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    晚期糖基化终产物特异性受体
    姓名
    晚期糖基化终产物受体
    晚期糖基化终产物受体

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. 纳米_001271422.1NP_001258351.1号晚期糖基化终产物特异性受体亚型b前体

      参见NP_001258351.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)缺少框架内外显子。编码亚型(b)比亚型a短。
      源序列
      AK004802,CT009767
      共识CDS
      CCDS70795.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题62151
      相关的
      ENSMUSP00000134401.2公司ENSMUST00000174496.9
      保守领域(3)总结
      智能00408
      位置:249304
      IGc2;免疫球蛋白C-2型
      智能00409
      位置:24116
      IG;免疫球蛋白
      pfam08205型
      位置:123216
      C2-set_2;CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    2. NM_001271423.1号NP_001258352.1号晚期糖基化终产物特异性受体亚型c前体

      参见NP_001258352.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(3)使用了一个替代的框内剪接位点,并且缺少框内外显子。编码的亚型(c)比亚型a短。
      源序列
      CT009767号
      共识CDS
      CCDS70796.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题62151
      相关的
      ENSMUSP00000134579.2号ENSMUST00000173992.8号
      保守领域(3)总结
      智能00408
      位置:240295
      IGc2;免疫球蛋白C-2型
      智能00410
      位置:24107
      IG_类;免疫球蛋白样
      pfam08205型
      位置:114207
      C2-set_2;CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    3. NM_001271424.1号NP_001258353.1号晚期糖基化终产物特异性受体亚型d

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(4)在编码区域中包含多个差异,并在备用起始密码子处开始翻译。与亚型a相比,编码亚型(d)较短,具有明显的N末端。
      源序列
      CT009767号
      UniProtKB/TrEMBL公司
      F1ABR7型
      相关的
      ENSMUST00000184805.8号
      保守领域(3)总结
      智能00410
      位置:159235
      IG_类;免疫球蛋白样
      pfam08205型
      位置:40133
      C2-set_2;CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
      cd00096
      位置:5660
      免疫球蛋白;Ig链B[结构基序]
    4. NM_007425.3号NP_031451.2号晚期糖基化终产物特异性受体亚型a前体

      参见NP_031451.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:该变体(1)编码最长的亚型(a)。
      源序列
      BC061182,CT009767
      共识CDS
      CCDS28649.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      C5H3H4型C5H3H5型C5H3H7型C5H3I0型C5H7W3型C5H7W4型C5H7W5型C5H7W6型C5H7W7型C5H7W8型C5H7W9型O35444号Q2PGG1系列问题62151V5R4Y0版
      UniProtKB/TrEMBL公司
      F1ABS0型
      相关的
      ENSMUSP000000015596.4号ENSMUST00000015596.10号
      保留域(4)总结
      智能00408
      位置:249304
      IGc2;免疫球蛋白C-2型
      智能00410
      位置:242318
      IG_类;免疫球蛋白样
      pfam08205型
      位置:123216
      C2-set_2;CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
      第11960条
      位置:24110
      免疫球蛋白;免疫球蛋白结构域

    核糖核酸

    1. 编号_073173.1RNA序列

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(5)在3'端附近有一个交替的剪接结构。该变体被表示为非编码,因为使用变体1中使用的5’-最期望的翻译起始密码子,使转录物成为非传感介导的mRNA衰变(NMD)的候选。
      源序列
      CT009767号
      相关的
      ENSMUST00000174069.8
    2. 编号073175.1RNA序列

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(6)在5'端附近有一个交替的剪接结构。该变体被表示为非编码,因为使用变体1中使用的5’-最期望的翻译起始密码子,使转录物成为非传感介导的mRNA衰变(NMD)的候选。
      源序列
      CT009767号
      相关的
      ENSMUST00000173589.8
    3. 编号_073176.1RNA序列

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(7)在5'端附近具有交替剪接结构,在3'端附近缺少外显子。该变体被表示为非编码,因为使用变体1中使用的5’-最期望的翻译起始密码子,使转录物成为非传感介导的mRNA衰变(NMD)的候选。
      源序列
      CT009767号
      相关的
      ENSMUST00000172932.2号

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000083.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      34816545.34819911
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_006523501.4号XP_006523564.1号晚期糖基化终产物特异性受体亚型X1

      参见XP_006523564.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      F1ABR8型
      保守领域(3)总结
      智能00408
      位置:249277
      IGc2;免疫球蛋白C-2型
      智能00409
      位置:24116
      IG;免疫球蛋白
      pfam08205型
      位置:123216
      C2-set_2;CD80样C2-set免疫球蛋白结构域