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    Egln2号机组egl-9家族低氧诱导因子2[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:112406,更新日期2024年5月12日

    总结

    官方符号
    Egln2号机组由提供MGI公司
    官方全名
    egl-9家族低氧诱导因子2由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:1932287
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000058709 联盟基因组:MGI:1932287
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    Ier4;博士学位1;SM-20;Hif-p4h-1;0610011A13瑞克
    总结
    预计可实现亚铁结合活性;氧传感器活性;肽基脯氨酸4-双加氧酶活性。预计参与多种过程,包括细胞氧化还原稳态;细胞缺氧反应;肽基-脯氨酸羟基化为4-羟基-L-脯氨酸。预计位于核质中。预计在细胞质和细胞核中活跃。在大脑中表达;大脑皮层;海马;和嗅觉上皮。该基因的人类同源基因与肾细胞癌有关。与人EGLN2同源(egl-9家族缺氧诱导因子2)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    在成年睾丸(RPKM 271.8)、成年肾上腺(RPKM 57.2)和其他27种组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    7 A3;7 15.83立方厘米
    外显子计数:
    7
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 7 NC_000073.7(26858083..26866227,补体)
    108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 7 NC_000073.6(27158658..27166802,补遗)

    染色体7-NC_000073.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_18343 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 4 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr7:27952094-27952395 Neighboring gene RAB4B, member RAS oncogene family Neighboring gene STARR-positive B cell enhancers ABC_E1725 and ABC_E288 Neighboring gene microRNA 3101 Neighboring gene MIA SH3 domain containing

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 核酸内切酶介导(3)
    • 目标(5)1条引文

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC101954年

    基因本体论 MGI提供

    组件 证据代码 酒吧
    细胞质中有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    脯氨酰羟化酶EGLN2
    姓名
    高频脉冲1
    HIF-脯氨酰羟化酶1
    HPH-1型
    法尔科
    低氧诱导因子脯氨酰羟化酶1
    即时早期响应4
    脯氨酰羟化酶结构域蛋白1
    NP_001344696.1号
    NP_444438.2号
    XP_030097849.1号
    XP_030097850.1型
    XP_030097851.1号
    XP_036008464.1号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_001357767.1NP_001344696.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型2

      状态:已验证

      源序列
      AC157553型
      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:172266
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
    2. NM_053208.4号NP_444438.2号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型1

      参见NP_444438.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      BC086764、BE993075、CB248412
      共识CDS
      CCDS21011.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题8C6I4问题8CIL9Q8VHJ1型Q91年2Q99MI0型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      第3季度第8季度Q3U8V5版本Q80X29型
      相关的
      ENSMUSP00000078966.5ENSMUST00000080058.11号
      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:217387
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000073.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      26858083..26866227补码
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. XM_030241990.1号XP_030097850.1型脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X2

      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:172266
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
    2. XM_030241991.1号XP_030097851.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X2

      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:172266
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
    3. 圣诞节_030241989.1XP_030097849.1号脯氨酰羟化酶EGLN2异构体X1

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题8C6I4问题8CIL9Q8VHJ1型Q91年2Q99MI0型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q3TXL8号第3U8V5期Q80X29型
      相关的
      ENSMUSP00000104019.2号机组ENSMUST00000108382.2号
      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:217387
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
    4. XM_036152571.1号XP_036008464.1号脯氨酰羟化酶EGLN2异构体X1

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      问题8C6I4问题8CIL9Q8VHJ1型Q91年2Q99MI0型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q3TXL8号第3U8V5期Q80X29型
      保守领域(1)总结
      智能00702
      位置:217387
      P4Hc;脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物