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    H3C4型H3聚集组蛋白4[智人(人类)]

    基因ID:8351,更新于2024年3月5日

    总结

    官方符号
    H3C4型由提供HGNC公司
    官方全名
    H3聚集组蛋白4由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:4767
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000197409 MIM:602811; 联盟基因组:HGNC:4767
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    H3/b;H3C1;H3C2;H3C3;H3C6;H3C7;H3C8;H3FB;H3C10;H3C11;H3C12;HIST1H3D
    总结
    组蛋白是真核生物中负责染色体纤维核小体结构的基本核蛋白。四个核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)中每一个的两个分子形成八聚体,约146 bp的DNA被包裹在重复单元中,称为核小体。连接体组蛋白H1与核小体之间的连接体DNA相互作用,并在染色质压缩成高阶结构中发挥作用。该基因无内含子,编码组蛋白H3家族成员的复制依赖型组蛋白。该基因的转录本没有多聚a尾部,但含有回文终止元件。该基因位于第6染色体上的大组蛋白基因簇中。【RefSeq提供,2015年8月】
    表达式
    骨髓(RPKM2.8)、前列腺(RPKM1.5)和14个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的H3C4基因组数据查看器
    位置:
    第22页
    外显子计数:
    2
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 6 NC_000006.12(26196784..26199293,补码)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(合同通用条款第009914755.1条) 6 NC_060930.1(26065245.26067759,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 6 NC_000006.11(26197012..26199521,补码)

    染色体6-NC_000006.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24199 Neighboring gene H4 clustered histone 4 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24200 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:26196641-26197242 Neighboring gene H1.12 linker histone, cluster member, pseudogene Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:26197243-26197843 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24202 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 24203 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr6:26199013-26200212 Neighboring gene H2A clustered histone 7 Neighboring gene H2B clustered histone 7 Neighboring gene ribosomal protein S10 pseudogene 1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    表型

    EBI GWAS目录

    描述
    全基因组荟萃分析确定了11个新的人体测量特征基因座,并为基因结构提供了见解。
    数百种变异聚集在基因组基因座和生物学途径中,影响人类身高。
    东亚成人身高全基因组关联研究的Meta分析确定了17个新基因座。

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    Tat公司 塔特 HIV-1 Tat肽结合核心组蛋白H2A、H2B、H3和H4,Tat蛋白向HIV-1 LTR启动子招募组蛋白乙酰转移酶,导致组蛋白H3和H4乙酰化,脱去染色质结构并增加NFkappaB反应性 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    潜在的阅读

    包含基因:H2AC7型

    基因本体论 GOA提供

    一般蛋白质信息

    首选名称
    组蛋白H3.1
    姓名
    H3组蛋白家族,成员B
    组蛋白1,H3d
    组蛋白H3/b
    组蛋白簇1 H3家族成员d
    组蛋白簇1,H3d

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001376937.1号NP_001363866.1号组蛋白H3.1

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:与变体2相比,该变体(1)在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      AL031777号
      共识CDS
      CCDS4590.1公司
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A0PJT7型A5PLR1型P02295号P02296号第16106页第68431页Q6ISV8发动机问题6NWP8问题6NWP9Q6NXU4型Q71DJ3号机组问题93081
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8K4Y7型B2R6Y1型
      相关的
      ENSP00000366999.2号恩斯特00000356476.3
      保守领域(1)总结
      PTZ00018型
      位置:1136
      PTZ00018;组蛋白H3;临时的
    2. NM_003530.4号NP_003521.2号组蛋白H3.1

      参见NP_003521.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      成绩单变体:此变体(2)表示较长的成绩单。变体1和2编码相同的蛋白质。
      源序列
      BC031333、DB242999
      共识CDS
      立方厘米4590.1
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第0页第7页A5PLR1型P02295号P02296号第16106页第68431页Q6ISV8发动机问题6NWP8问题6NWP9Q6NXU4型Q71DJ3号机组问题93081
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A8K4Y7型B2R6Y1型
      保守领域(1)总结
      PTZ00018型
      位置:1136
      PTZ00018;组蛋白H3;临时的

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000006.12参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      26196784..26199293补码
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060930.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      26065245..26067759补码
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)