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免疫系统 PDB id
5焦耳

 

 

 

 

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JSmol公司 PyMol公司  
目录
蛋白质
公元203年。
公元42年。
水域 ×226
PDB id:
5焦耳
姓名: 免疫系统
标题: irf-3与cbp的复合物
结构: 干扰素调节因子3。链:a,b,例如,片段:unp残基189-398。同义词:irf-3。工程设计:是的。Creb结合蛋白。链:c,d,f,h。片段:unp残基2065-2111。工程:是的
资料来源: 智人。人类。有机体_出租车:9606。基因:irf3。表达单位:大肠杆菌。表达式系统最大值:562。基因:crebbp,cbp。表达式系统最大值:562
分辨率:
2.50Å R系数:   0.194     无R:   0.242
作者: B.赵,P.李
密钥参考: B.赵等。(2016).天然免疫适配器蛋白协同招募和激活IRF-3的结构基础。美国国家科学院程序113E3403。PubMed编号:27302953 内政部:10.1073/pnas.1603269113
日期:
2016年4月18日 发布日期:   2016年6月15日
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 标题
 工具书类

蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
问题14653 (IRF3_胡曼)-智人干扰素调节因子3
序号:
结构:
公元427年。
公元203年。*
蛋白质链
Pfam公司   架构模式 ?
问题92793 (CBP_人类)-智人CREB结合蛋白
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
 
序号:
结构:
公元2442年。
公元42年。
密钥: PfamA域 二级结构 CATH域
* PDB和UniProt序列不同2个残留位置(黑色十字架)

酶反应
1类酶: 链条A、B、E、G: 电气控制。?
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
2类酶: 链条C、D、F、H: E.C.2.3.1节-  - ?????
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
3类酶: 链条C、D、F、H: E.C.2.3.1.48段 -组蛋白乙酰转移酶。
[国际酶] [ExPASy] [KEGG](KEGG) 【布伦达】
反应: 乙酰辅酶A+L-赖氨酸-[蛋白质]=辅酶A+H++N个6-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
乙酰辅酶A
+ L-赖氨酸-[蛋白质]
= CoA公司
+ H(+)
+ N(6)-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下前体,以不同的成熟蛋白质。
从获取的.mol文件生成的分子图KEGG ftp站点

 

 
添加了参考
 
 
DOI编号:10.1073/pnas.1603269113 美国国家科学院程序 113:E3403(2016)
PubMed编号:27302953  
 
 
天然免疫适配器蛋白协同招募和激活IRF-3的结构基础。
B.赵, C.舒, X.高, B.桑卡兰, 杜富珍, C.L.谢尔顿, A.B.Herr先生, 季J.Y, P.李。
 
  摘要  
 
I型干扰素是介导先天性抗病毒免疫的关键细胞因子。cGMP-AMP公司合成酶、维甲酸诱导蛋白1(RIG-I)样受体和Toll样受体识别微生物双链DNA、dsRNA和LPS诱导I型干扰素的表达。这些信号通路汇聚于转录因子IRF-3(IFN调节因素3)。衔接蛋白STING(干扰素基因刺激物),MAVS(线粒体抗病毒信号)和TRIF(TIR域相关适配器诱导IFN-β)通过保守的pLxIS介导IRF-3的募集动机。这里我们显示磷酸化STING、MAVS和TRIF的pLxIS基序以类似方式与IRF-3结合,而基序上游的残基赋予特殊性。IRF-3拟磷酸突变体S386/396E的结构与cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合蛋白结合揭示pLxIS基序也介导IRF-3二聚体化和活化。此外,轮状病毒NSP1(非结构蛋白1)利用pLxIS基序目标IRF-3用于降解,但不需要NSP1的磷酸化它的活动。这些结果表明有一个协调一致的招聘机制和IRF-3的激活,可被病毒蛋白破坏以逃避先天性免疫反应。
 

 

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