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PDBsum条目5jem
转至PDB代码:
免疫系统
PDB id
5焦耳
加载。。。
目录
蛋白质
链
公元203年。
公元42年。
水域
×226
PDB id:
5焦耳
链接
PDBe公司
RCSB公司
毫米数据库
耶拿图书馆
蛋白质体
CATH公司
SCOP公司
PDBSWS公司
PDBePISA公司
ProSAT项目
姓名:
免疫系统
标题:
irf-3与cbp的复合物
结构:
干扰素调节因子3。
链:a,b,例如,片段:unp残基189-398。
同义词:irf-3。
工程设计:是的。
Creb结合蛋白。
链:c,d,f,h。片段:unp残基2065-2111。
工程:是的
资料来源:
智人。
人类。
有机体_出租车:9606。
基因:irf3。
表达单位:大肠杆菌。
表达式系统最大值:562。
基因:crebbp,cbp。
表达式系统最大值:562
分辨率:
2.50Å
R系数:
0.194
无R:
0.242
作者:
B.赵,P.李
密钥参考:
B.赵
等。
(2016).
天然免疫适配器蛋白协同招募和激活IRF-3的结构基础。
美国国家科学院程序
,
113
,
E3403。
PubMed编号:
27302953
内政部:
10.1073/pnas.1603269113
日期:
2016年4月18日
发布日期:
2016年6月15日
PROCHECK检查
标题
工具书类
蛋白质链
?
问题14653
(IRF3_胡曼)-
智人干扰素调节因子3
序号:
结构:
公元427年。
公元203年。
*
蛋白质链
?
问题92793
(CBP_人类)-
智人CREB结合蛋白
序号:
结构:
序号:
结构:
序号:
结构:
序号:
结构:
序号:
结构:
公元2442年。
公元42年。
密钥:
PfamA域
二级结构
CATH域
*
PDB和UniProt序列不同
2个残留位置(黑色
十字架)
酶反应
1类酶:
链条A、B、E、G:
电气控制。?
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
2类酶:
链条C、D、F、H:
E.C.2.3.1节-
- ?????
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
3类酶:
链条C、D、F、H:
E.C.2.3.1.48段
-组蛋白乙酰转移酶。
[国际酶]
[ExPASy]
[KEGG](KEGG)
【布伦达】
反应:
乙酰辅酶A+L-赖氨酸-[蛋白质]=辅酶A+H
+
+N个
6
-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
乙酰辅酶A
+
L-赖氨酸-[蛋白质]
=
CoA公司
+
H(+)
+
N(6)-乙酰-L-赖氨酰-[蛋白质]
注意,如果给出了一个以上的E.C.等级(如上所述),每个等级可以
对应于不同的蛋白质结构域,或者在多蛋白的情况下
前体,以不同的成熟蛋白质。
从获取的.mol文件生成的分子图
KEGG ftp站点
添加了参考
DOI编号:
10.1073/pnas.1603269113
美国国家科学院程序
113
:E3403
(2016)
PubMed编号:
27302953
天然免疫适配器蛋白协同招募和激活IRF-3的结构基础。
B.赵,
C.舒,
X.高,
B.桑卡兰,
杜富珍,
C.L.谢尔顿,
A.B.Herr先生,
季J.Y,
P.李。
摘要
I型干扰素是介导先天性抗病毒免疫的关键细胞因子。
cGMP-AMP公司
合成酶、维甲酸诱导蛋白1(RIG-I)样受体和
Toll样受体识别微生物双链DNA、dsRNA和LPS
诱导I型干扰素的表达。
这些信号通路汇聚于
转录因子IRF-3(IFN调节
因素3)。
衔接蛋白STING(干扰素基因刺激物),MAVS
(线粒体抗病毒信号)和TRIF(TIR域相关适配器
诱导IFN-β)通过保守的pLxIS介导IRF-3的募集
动机。
这里我们显示磷酸化STING、MAVS和TRIF的pLxIS基序
以类似方式与IRF-3结合,而基序上游的残基
赋予特殊性。
IRF-3拟磷酸突变体S386/396E的结构
与cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合蛋白结合
揭示pLxIS基序也介导IRF-3二聚体化和活化。
此外,轮状病毒NSP1(非结构蛋白1)利用pLxIS基序
目标IRF-3用于降解,但不需要NSP1的磷酸化
它的活动。
这些结果表明有一个协调一致的招聘机制
和IRF-3的激活,可被病毒蛋白破坏以逃避先天性
免疫反应。
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