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PDBsum条目5jem
转至PDB代码:
隧道分析:5jem,计算公式为
摩尔2.0
PDB id
5焦耳
隧道按整体结构计算
计算的隧道不包括配体
查看选项
摩尔
联机
2
操纵
和
可视化
使用HETATM:
不带HETATM:
20
隧道,
按隧道半径着色
20
隧道,
颜色由
隧道半径
20
隧道,
颜色如中所示
下面列出
隧道是与周围蛋白质相连的内部空间。
仅显示长度超过15º的通道。
隧道
自由R
长度
HP病变
HP滚刀
极地的
相对静音
残留
..
类型
配体
半径
1
1.18
1.55
38.9
-1.00
-0.04
18.1
71
5
4
4
三
4
0
0
2
1.19
1.53
40.4
-0.61
0.12
7.8
67
三
0
三
5
4
2
0
三
1.47
2.07
41.4
-2.00
-0.79
9.4
87
2
1
8
2
0
2
0
4
1.17
1.41
42.9
-2.12
-0.83
16.5
89
三
4
8
1
0
2
0
5
1.18
1.53
44.1
-0.51
0.13
7.3
68
三
1
三
5
4
1
0
6
1.47
2.08
45.3
-1.86
-0.73
8.8
88
2
2
8
2
0
1
0
7
1.18
1.55
45.3
-0.74
-0.04
7.1
69
三
2
4
5
5
2
0
8
1.19
1.55
46.7
-0.52
0.05
6.8
68
4
1
4
5
5
三
0
9
1.17
1.54
47.4
-0.45
0.07
6.8
69
三
2
三
5
5
2
0
10
1.18
1.56
48.3
-1.24
-0.03
20.2
73
8
三
5
三
4
1
0
11
1.46
2.07
49.4
-1.65
-0.67
7.4
86
三
2
9
2
1
2
0
12
1.46
2.06
50.4
-2.42
-0.78
23.2
83
7
6
7
1
0
1
0
13
1.46
2.06
50.8
-1.53
-0.65
6.7
84
2
三
9
2
1
三
0
14
1.17
1.45
53.5
-1.09
-0.09
11.2
72
4
1
6
5
4
2
0
15
1.46
2.06
64.9
-2.53
-0.75
24.8
83
8
6
9
1
0
1
0
16
1.18
1.58
68.1
-1.63
-0.23
19.7
72
8
5
6
4
4
2
0
17
1.21
1.62
67.8
-1.73
-0.25
20.4
71
9
5
5
5
4
2
0
18
1.46
2.06
68.7
-2.58
-0.81
21.1
84
7
6
11
1
0
2
0
19
1.48
2.11
74.5
-2.46
-0.76
18.7
84
8
4
13
1
0
三
0
20
1.04
1.46
17.7
2.17
0.65
3.8
78
1
0
0
5
1
0
0
残留物类型
_
着色
积极的
否定
中性
脂肪族的
芳香的
专业Gly(&G)
半胱氨酸
H、 K、R
D、 电子
S、 T、N、Q
A、 V、L、I、M
F、 Y、W
P、 G公司
C类
确认
隧道计算公式为
MOLE 2.0程序
版本2.5.13.11.08和可视化使用
酸碱度0.97rc
.