垫片
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PDBsum条目5jem

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隧道分析:5jem,计算公式为摩尔2.0 PDB id
5焦耳
隧道按整体结构计算 计算的隧道不包括配体

查看选项
摩尔联机2操纵

可视化
使用HETATM:
不带HETATM:
 
20隧道,按隧道半径着色 20隧道,颜色由隧道半径 20隧道,颜色如中所示
下面列出
隧道是与周围蛋白质相连的内部空间。仅显示长度超过15º的通道。
隧道
自由R
长度
HP病变
HP滚刀
极地的
相对静音
残留..类型
配体
半径
1 1.18 1.55 38.9 -1.00 -0.04 18.1 71 5 4 4 4 0 0  
2 1.19 1.53 40.4 -0.61 0.12 7.8 67 0 5 4 2 0  
1.47 2.07 41.4 -2.00 -0.79 9.4 87 2 1 8 2 0 2 0  
4 1.17 1.41 42.9 -2.12 -0.83 16.5 89 4 8 1 0 2 0  
5 1.18 1.53 44.1 -0.51 0.13 7.3 68 1 5 4 1 0  
6 1.47 2.08 45.3 -1.86 -0.73 8.8 88 2 2 8 2 0 1 0  
7 1.18 1.55 45.3 -0.74 -0.04 7.1 69 2 4 5 5 2 0  
8 1.19 1.55 46.7 -0.52 0.05 6.8 68 4 1 4 5 5 0  
9 1.17 1.54 47.4 -0.45 0.07 6.8 69 2 5 5 2 0  
10 1.18 1.56 48.3 -1.24 -0.03 20.2 73 8 5 4 1 0  
11 1.46 2.07 49.4 -1.65 -0.67 7.4 86 2 9 2 1 2 0  
12 1.46 2.06 50.4 -2.42 -0.78 23.2 83 7 6 7 1 0 1 0  
13 1.46 2.06 50.8 -1.53 -0.65 6.7 84 2 9 2 1 0  
14 1.17 1.45 53.5 -1.09 -0.09 11.2 72 4 1 6 5 4 2 0  
15 1.46 2.06 64.9 -2.53 -0.75 24.8 83 8 6 9 1 0 1 0  
16 1.18 1.58 68.1 -1.63 -0.23 19.7 72 8 5 6 4 4 2 0  
17 1.21 1.62 67.8 -1.73 -0.25 20.4 71 9 5 5 5 4 2 0  
18 1.46 2.06 68.7 -2.58 -0.81 21.1 84 7 6 11 1 0 2 0  
19 1.48 2.11 74.5 -2.46 -0.76 18.7 84 8 4 13 1 0 0  
20 1.04 1.46 17.7 2.17 0.65 3.8 78 1 0 0 5 1 0 0  

残留物类型_着色
积极的 否定 中性 脂肪族的 芳香的 专业Gly(&G) 半胱氨酸
H、 K、R D、 电子 S、 T、N、Q A、 V、L、I、M F、 Y、W P、 G公司 C类

确认
隧道计算公式为MOLE 2.0程序版本2.5.13.11.08和可视化使用酸碱度0.97rc.
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