辛布

从单细胞数据集模拟批量RNA-seq数据集

生物导体版本：释放（3.19）

SimBu可用于模拟具有已知细胞类型分数的大量RNA-seq数据集。您可以使用自己的单细胞研究进行模拟，也可以使用sfaira数据库。存在不同的预定义模拟场景，以及运行自定义模拟的选项。此外，可以通过添加mRNA偏差来调整表达值，从而产生更具生物相关性的模拟。

作者：亚历山大·迪特里希

维护人员：亚历山大·迪特里希（Alexander Dietrich）

引文（从R中输入引文（“SimBu”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SimBu”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“SimBu”）

生物视图	RNA序列,单个单元格,软件
版本	1.6.0
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年）
许可证	GPL-3+文件许可证
取决于
进口	蛇怪,生物并行，data.table，dplyr，ggplot2，工具，矩阵（>=1.3.3），方法，品学兼优、proxyC、RColorBrewer、RCurl、网状、，稀疏矩阵统计,总结性实验，第三年
系统要求
网址	https://github.com/omnidecov/SimBu
错误报告	https://github.com/omnidecov/SimBu/issues

建议	curl、knitr、matrixStats、rmarkdown、Seurat（>=5.0.0）、SeuratObject（>=5.0）、testtat（>=3.0.0）
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	SimBu_1.6.0.tar.gz公司
Windows二进制	SimBu_1.6.0.zip软件
macOS二进制（x86_64）	模拟Bu_1.6.0.tgz
macOS二进制（arm64）	模拟Bu_1.6.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBu
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/SimBu
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SimBu/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SimBu/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档