GWENA公司
用于增强共表达分析的管道
生物导体版本：释放（3.19）
高通量测序的发展导致更多地使用共表达分析来超越单一特征（即基因）焦点。我们提出了GWENA（Gene Whole co-Expression Network Analysis），这是一种用于执行基因共表达网络分析并在单个管道中探索结果的工具。它包括共表达基因模块的功能丰富、表型关联、拓扑分析和条件间网络配置的比较。
作者：格温娜·莱莫恩[aut，cre]
、玛丽·皮尔·斯科特·博伊尔（Marie-Pier Scott-Boyer[ths]）、阿诺德·德罗伊特（Arnaud Droit[fnd]）
维护人员：格温娜·莱莫恩
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“GWENA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影（“GWENA”）
细节
| 生物视图 |
群集,GO（开始）,基因表达式,GeneSet扩展,图形和网络,微阵列,网络,网络扩展,路径,RNA序列,排序,软件,转录组学,可视化,mRNA微阵列 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
WGCNA（>=1.67），dplyr（>=0.8.3），dynamicTreeCut（>=1.6 3-1），ggplot2（>=3.1.1），gprofiler2（>=0.1.6），magrittr（>=1.5），tible（>=2.1.1），tidyr（>=1.0.0），NetRep（>=1.2.1），igraph（>=1.2.4.1），RColorBrewer（>=1.1-2），purr（>=0.3.3），rlist（>=0.4.6.1），matrixStats（>=0.55.0），总结性实验（>=1.14.1），字符串（>=1.4.0），集群（>=2.1.0），grDevices（>=4.0.4），方法，图形，统计，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
| 错误报告 |
https://github.com/Kumquatum/GWENA/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
测试that（>=2.1.0），knitr（>=1.25），rmarkdown（>=1.16），prettydoc（>=0.3.0），httr（>=1.4.1），S4载体（>=0.22.1），仿生风格(>= 2.15.8) |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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生成报告 |
程序包档案
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