结晶学报D辑
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结构
生物学
第57卷
|
第8部分
国际标准编号:2059-7983
2001年8月发行
封面插图:
糖化水解酶抑制剂纤维二糖基咪唑与纤维二糖水解酶Cel6A结合。
图像是使用
莫雷
之间的接口
O(运行)
和
光线追踪
. (
第1201页
).
专题评论
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1053-1060年
https://doi.org/10.107/S090744901008824
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原子力显微镜在高分子晶体学中的应用
A.麦克弗森
,
A.J.马尔金
,
Y.G.库兹涅佐夫
和
M.普洛普
原子力显微镜(AFM)可用于研究大分子晶体的生长
就地
,并推导该过程的机械、动力学和现象学特性。
阅读文章
研究论文
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1061-1070
https://doi.org/10.107/S090744901007235
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2.5时甲状腺素与大鼠穿甲素(rTTR)复合物的结构
奥决议:首次对甲状腺素结合的无偏见见解揭示了两个结合位点的不同激素取向
A.沃伊特扎克
,
V.科迪
,
J.R.勒夫特
和
W.庞伯恩
甲状腺素(T)独特环境的首次观察
4
)用X射线衍射法测定了四聚体大鼠转甲状腺素(rTTR)的结合。
PDB参考
:
大鼠甲状腺素反式甲状腺激素复合物
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(2001年)。
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57
,
1071-1078
https://doi.org/10.107/S090744901007405
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止血抑制剂水蛭抗血小板蛋白的结构
E.G.Huizinga公司
,
A.肖滕
,
T.M.康诺利
,
J.克罗恩
,
J.J.西克玛
和
P.格罗斯
水蛭抗血小板蛋白的结构通过单个同晶置换得到解析,并精炼为2.2
奥分辨率。
它类似于肝细胞生长因子的N域,但不存在可检测到的序列同源性。
富含甘氨酸和酸性残基的36位N-末端区域在电子密度图中不可见。
PDB参考
:
水蛭抗血小板蛋白
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57
,
1079-1090
https://doi.org/10.107/S090744901007673
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的结构
流感嗜血杆菌
一维无序孪晶晶体中的HslU蛋白
有轨电车
和
D.B.麦凯
的结构
流感嗜血杆菌
HslU已求解为2.3
一维无序孪晶晶体的光学分辨率。
描述了一种计算修正孪晶的方法。
PDB参考
:
HslU,1g41
;
SeMet-HslU,1im2
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(2001年)。
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57
,
1091-1100
https://doi.org/10.107/S090744901007685
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T中的相位变化
3
R(右)
人体胰岛素:由温度或压力引起?
G.D.史密斯
,
W.庞伯恩
和
R.H.祝福
由于冻结导致的相位变化
c(c)
T轴
3
R(右)
六聚体胰岛素加倍,不对称单元包含两个独立的TR
(f)
二聚体。
PDB参考
:
1.2
奥特
3
R(右)
胰岛素,1g7a
;
1.3
奥特
3
R(右)
胰岛素,1g7b
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(2001年)。
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57
,
1101-1109
https://doi.org/10.107/S090744901008186
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杀虫细菌δ-内毒素Cry3Bb1的结构
苏云金芽孢杆菌
N.加利茨基
,
V.科迪
,
A.沃伊特扎克
,
D.戈什
,
J.R.勒夫特
,
W.庞伯恩
和
L.英语
使用收集到的数据对δ-内毒素Cry3B1的晶体结构进行了改进,结果为2.4
奥分辨率,有残差
R(右)
17.5%的系数和
R(右)
自由的
25.3%。
该结构由三个结构域组成:I,一个七螺旋束(残基64-294);
II、 三片结构域(残基295-502);
和III,β-三明治结构域(残基503-652)。
PDB参考
:
δ-内毒素Cry3Bb1,1ji6
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(2001年)。
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57
,
1110-1118
https://doi.org/10.107/S090744901008654
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高pH和1.9无铜状态下蓝色亚硝酸铜还原酶的X射线结构
奥数分辨率
M.J.埃利斯
,
F.E.多德
,
R.W.奇怪
,
M.Prudíncio先生
,
G.锯床
,
R.R.伊迪
和
S.S.哈斯奈
高pH下亚硝酸盐还原酶的结构为高pH下酶的活性大大降低提供了结构解释。
PDB参考
:
天然蓝色亚硝酸铜还原酶
;
重组亚硝酸铜蓝还原酶
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(2001年)。
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57
,
1119-1126
https://doi.org/10.107/S090744901008873
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0.94时四方蛋清溶菌酶的结构
反扩散法生长晶体中的氧
C.绍特
,
F.奥塔洛拉
,
J.-A.加维拉
,
O.维达尔
,
R.Giegé
和
J.M.加西亚-鲁伊斯
采用反扩散法生产出高质量的四方溶菌酶晶体。
它们的原子分辨率分析(0.94
导致对交替构象和离子结合的详细描述。
PDB参考
:
四方溶菌酶
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
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57
,
1127-1134
https://doi.org/10.107/S090744901006783
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科莫
:组合分子替换程序
G.乔格尔
,
十、陶
,
Y.Xu先生
和
L.Tong先生
共聚单体
是一个通过组合分子置换方案进行结构测定的新程序。
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1135-1137
https://doi.org/10.107/S09074490100614X
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金属蛋白酶/去整合素jararhagin的结晶和初步X射线分析
哈拉拉卡葡萄
蛇毒
D.H.F.苏扎
,
H.S.Selistre-de-Araujo先生
,
A.M.穆拉达席尔瓦
,
M.S.Della-Casa先生
,
G.奥利瓦
和
R.C.加拉特
Jararhagin,一种金属蛋白酶/去整合素样蛋白,来自
巴西矛头蝮
根据出血性锌金属蛋白酶的晶体结构建立同源模型,结晶并获得分子置换溶液。
细化技术目前正被用于试图定位结构的非整合素样结构域。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
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57
,
1138-1140
https://doi.org/10.107/S09074490100748X
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6-磷酸-3-己酮糖异构酶YckF的克隆、纯化和性质研究
枯草芽孢杆菌
E.J.泰勒
,
S.J.查诺克
,
J.科尔比
,
G.J.戴维斯
和
G.W.黑色
6-磷酸-3-己糖异构酶,YckF,来自
枯草杆菌
,表示为
大肠杆菌
纯化至均匀并结晶。
YckF晶体衍射超过1.7
和属于任一空间组
P(P)
6
5
22或
P(P)
6
1
22,带单元间参数
一
=
b条
= 72.4,
c(c)
= 241.2
和在不对称单元中有两个分子。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
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57
,
1141-1143
https://doi.org/10.107/S090744901007491
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一种新型果胶裂解酶Pel10A的表征
纤维素假单胞菌
S.J.查诺克
,
I.E.布朗
,
J.P.图尔肯堡
,
G.W.黑色
和
G.J.戴维斯
果胶裂解酶10A的催化模块,Pel10Acm,来自
纤维素酶
,表示为
大肠杆菌
纯化至均匀并结晶。
Pel10Acm晶体衍射超过1.5
和属于空间组
P(P)
2
1
,带有单位-细胞参数
一
= 47.7,
b条
= 106.1,
c(c)
= 55.4
?,β=92.0°,在不对称单元中有两个分子。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1144-1146
https://doi.org/10.107/S090744901007739
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聚乙二醇中南极鱼类血红蛋白的配体和非配体形式:R态血红素中间体的结晶
A.里奇奥
,
L.维塔利亚诺
,
G.di Prisco公司
,
A.扎加里
和
L.马扎雷拉
脊椎动物血红蛋白第一次结晶为血红素状态。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1147年-1149年
https://doi.org/10.107/S090744901007909
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脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶的结晶和初步X射线晶体学分析
酿酒酵母
B.W.韩
,
J.Y.Lee先生
,
J.K.杨
,
B.I.李
和
S.W.Suh先生
dUTPase的正交晶体
酿酒酵母
已获得。
本地数据已收集到2.7
使用同步辐射X射线。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1150-1152
https://doi.org/10.107/S09074490100868X
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突变型核糖体蛋白L22的晶体使细菌核糖体对红霉素耐药
达维多瓦猪笼草
,
R.费多罗夫
,
V.斯特雷尔索夫
,
A.利贾斯
和
M.加伯
一种突变形式的
嗜热杆菌
负责红霉素耐药性的核糖体蛋白L22已结晶,X射线衍射数据已收集到1.8
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1153-1156
https://doi.org/10.107/S090744901005558
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GTP环水解酶I及其反馈调节蛋白GFRP刺激和抑制复合物的制备和结晶
N.迈塔
,
冈田克也
,
S.Hirotsu公司
,
K.Hatakeyama公司
和
T.白岛
获得了GTP环水解酶I及其反馈调节蛋白GFRP的刺激和抑制复合物的晶体。
结果表明,每个配合物由两个GTPCHI五聚体环和两个具有伪52点群对称性的GFRP五聚体圈组成。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1157-1158
https://doi.org/10.107/S090744901008927
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嗜盐古细菌过氧化氢酶-过氧化物酶的结晶及初步X射线分析
死海盐盒菌
Y.山田
,
S.Saijo公司
,
佐藤(T.Sato)
,
N.伊加拉什
,
H.臼井
,
T.藤原
和
N.田中
嗜盐古菌的过氧化氢酶-过氧化物酶
海星
纯化并成功结晶。
晶体衍射超过2.0
分辨率,属于空间组
C类
2
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1159-1161
https://doi.org/10.107/S09074490100871X
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重组耐热葡萄糖酸激酶GntK的结晶和初步X射线晶体学研究
大肠杆菌
L.卡夫
,
G.A.Sprenger公司
和
Y.Lindqvist(林德奎斯特)
葡糖酸激酶
大肠杆菌
已经以三种不同的晶体形式表达、纯化和结晶。
晶体衍射到2.0
使用同步辐射的光学分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1162-1163
https://doi.org/10.107/S09074490100926X
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凋亡相关钙结合蛋白ALG-2的结晶和初步晶体学研究
F.吴
,
张先生
和
W·龚
ALG-2是一种凋亡相关钙
2+
-T细胞受体诱导、Fas诱导和糖皮质激素诱导细胞死亡所需的结合蛋白。
钙
2+
-用悬滴气相扩散法将游离ALG-2结晶为两种晶型。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
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57
,
1164-1166
https://doi.org/10.107/S090744901009416
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OpcA侵袭蛋白的表达、重折叠和结晶
脑膜炎奈瑟菌
S.M.普林斯
,
C.蕨类
,
D.詹森
,
Y.Lobet公司
,
M.Achtman先生
,
B.库塞克
,
P.A.布洛
和
J.P.井架
细菌病原OpcA侵入蛋白的表达、复性、纯化和结晶方法
脑膜炎奈瑟菌
描述了。
衍射数据集已收集到2.0
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1167-1170
https://doi.org/10.107/S090744901009556
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ARL2-GTP和PDEδ配合物的共表达、铜提纯、结晶和初步X射线分析
L.雷诺
,
M.Hanzal-球员
和
R.C.Hillig公司
小GTPase ARL2-GTP和一种假定的效应蛋白(人类cGMP磷酸二酯酶δ亚基)的复合物,在两种蛋白在细胞内共表达后成功结晶
大肠杆菌
以及随后的铜提纯。
而第一个晶体在几天内生长并衍射到2.3
?,第二种形态在几个月后再结晶,衍射到1.8
Å。
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1171-1173年
https://doi.org/10.107/S090744901009568
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病原真菌内聚半乳糖醛酸酶的结晶及初步X射线研究
由紫韧革菌
清水县T
,
T.Nakatsu公司
,
K.米亚里
,
T.奥库诺
和
H.加藤
内聚半乳糖醛酸酶I的晶体
紫癜链球菌
已通过蒸汽扩散法获得。
晶体衍射到超高(0.96
采用同步辐射的分辨率,属于空间组
P(P)
1,带单位-细胞参数
一
= 37.26,
b条
= 46.34,
c(c)
= 52.05
Å,
α
= 67.17,
β
=72.44和
γ
= 68.90°.
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1174-1176
https://doi.org/10.107/S09074490100957X
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人钙结合蛋白MRP14(S100A9)的表达、纯化、结晶和初步X射线衍射分析
H.伊图
,
一、富士
,
石川克郎(K.Ishikawa)
,
姚明(M.Yao)
,
N.Watanabe公司
,
铃木先生
,
J.西希拉
和
一、田中
对人钙结合蛋白MRP14进行结晶,并进行初步的X射线衍射研究。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1177-1179
https://doi.org/10.107/S090744901009611
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第二种和古细菌型天冬氨酸-tRNA合成酶的结晶和初步X射线衍射数据
嗜热菌
C.查伦
,
H.罗伊
,
B.洛伯
,
D.科恩
和
R.Giegé
真杆菌中的第二种和古细菌型天冬氨酸-tRNA合成酶
嗜热杆菌
在空间组中在pH 9.5下结晶
P(P)
2
1
2
1
2
1
。数据收集到2.5
光学和分子替换给出了旋转和平移函数的解。
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1180-1183
https://doi.org/10.107/S090744901009805
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马精浆中前列腺激肽释放酶的纯化、结晶及X射线分析鉴定
A.L.卡瓦略
,
J.M.迪亚斯
,
L.桑兹
,
A.罗梅罗
,
J.J.卡尔维特
和
M.J.Romáo先生
从马精浆中分离出的前列腺激肽释放酶在结晶溶液中用聚乙二醇通过蒸汽扩散法结晶。
在低温条件下收集数据可以确定空间群(
C类
2) 和单元间参数(
一
= 72.6,
b条
= 79.1,
c(c)
= 45.7
Å, β = 98.3°).
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1184-1186
https://doi.org/10.107/S090744901009817
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中Ⅰ级过氧化氢酶的结晶和初步X射线分析
丁香假单胞菌
和
斯氏李斯特菌
十、卡佩纳
,
R.佩雷斯
,
W.F.奥乔亚
,
N.Verdaguer公司
,
M.Klotz先生
,
J.斯威塔拉
,
W.梅利克·阿达米扬
,
一、菲塔
和
P.C.洛伊文
为了从含血红素过氧化氢酶的第一分支获得一种酶的结构
丁香树
和Kat来自
seeligeri乳杆菌
分别以聚乙二醇和硫酸铵为沉淀剂,采用悬挂滴气相扩散技术进行结晶。
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1187-1188
https://doi.org/10.107/S090744901009970
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氮利用物质A(NusA)的结晶和初步X射线衍射研究
结核分枝杆菌
B.戈帕尔
,
K.G.帕帕维纳斯桑达拉姆
,
M.J.科尔斯顿
,
G.多德森
和
L.F.头发
氮利用物质A(NusA)来自
结核分枝杆菌
已经结晶。
天然蛋白质的衍射数据为1.7
已收集分辨率。
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(2001年)。
D类
57
,
1189-1191
https://doi.org/10.107/S090744901010137
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重组蛋白的结晶和初步X射线衍射研究
大肠杆菌
4-二磷酸胞苷基-2-
C类
-甲基-
D类
-赤藓醇合成酶
L.E.坎普
,
C.S.债券
和
W.N.亨特
一种参与类异戊二烯生物合成非甲羟戊酸途径的细菌酶已被克隆、纯化和结晶。
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1192-1195
https://doi.org/10.107/S090744901010149
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小鼠酯酶水解催化抗体家族Fab片段及其与过渡态类似物复合物的制备和结晶
T.A.穆拉诺瓦
,
S.N.鲁日尼科夫
,
S.E.Sedelnikova公司
,
A.莫尔
,
L.J.鹧鸪
,
H.卡基努玛
,
N.高桥
,
岛崎(K.Shimazaki)
,
J.孙
,
Y.Nishi先生
和
D.W.赖斯
一系列催化能力不同的相关小鼠酯酶解单克隆抗体的Fab片段已单独结晶,并与过渡态类似物以适合高分辨率结构测定的形式复合。
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《水晶学报》。
(2001年)。
D类
57
,
1196-1200
https://doi.org/10.107/S090744901007703
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人体肌肉肌酸激酶的结构
Y.Shen先生
,
L.唐
,
H.周
和
Z.林
人类肌肉肌酸激酶的晶体结构已通过分子置换法测定为3.5
奥分辨率。
晶体中存在严格和近似的双重对称二聚体。
PDB参考
:
人肌肌酸激酶
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(2001年)。
D类
57
,
1201-1203
https://doi.org/10.107/S090744901007697
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莫雷
–之间的web界面
O(运行)
和
光线追踪
射线跟踪器
M.哈里斯
和
T.A.琼斯
此公共web服务允许从分子建模程序快速轻松地生成公开质量的图像
O(运行)
.
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(2001年)。
D类
57
,
1204-1207
https://doi.org/10.107/S090744901007892
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微重力下大分子结晶的试验:有序的大胰岛素晶体
G.E.O.Borgstahl公司
,
A.瓦赫迪·法里迪
,
J.洛夫莱斯
,
H.D.贝拉米
和
E.H.斯奈尔
对胰岛素晶体进行的一项统计意义重大且无偏见的测试表明,微重力条件下生长的晶体优于单位重力条件下的晶体。
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