pegas:种群与进化遗传学分析系统

用于读取、写入、绘制、分析和操作等位基因和单倍型数据,包括来自VCF文件的数据,以及用于分析群体核苷酸序列和微卫星的功能,包括合并分析、连锁不平衡、群体结构(Fst、Amova)和平衡(HWE)、单倍型网络、,最小生成树和网络,以及中间连接网络。

版本: 1.3
取决于: R(≥3.2.0),(≥ 5.3-11)
进口: 图形、实用程序、方法
建议: rgl公司,snpStats(snpStat),阿德根特
出版: 2023-12-13
作者: 伊曼纽尔·帕拉迪斯ORCID标识[aut,cre,cph],蒂鲍特·琼巴特ORCID标识[aut,cph],日安·N·坎瓦尔ORCID标识[aut,cph],布赖恩·克瑙斯ORCID标识[或者,cph],克劳斯·施利普ORCID标识[aut,cph],阿拉斯泰尔·波茨ORCID标识[aut,cph],大卫·温特ORCID标识[aut,cph]
维护人员: 伊曼纽尔·帕拉迪斯。ird.fr>的天堂
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: https://emmanuelparadis.github.io/pegas.html
需要编译:
引用: pegas引文信息
材料: 新闻
CRAN检查: pegas结果

文档:

参考手册: 聚乙二醇.pdf
渐晕图: 绘制单倍型网络
正在读取文件

下载内容:

包源: 聚乙二醇1.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:佩加斯_1.3.zip,r版本:pegas_1.3.zip,r-oldrel:pegas_1.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):聚乙二醇1.3.tgz,r-oldrel(arm64):聚乙二醇1.3.tgz,r-版本(x86_64):聚乙二醇1.3.tgz,r-oldrel(x86_64):聚乙二醇1.3.tgz
旧来源: pegas档案

反向依赖关系:

反向取决于: StAMPP公司
反向进口: 基因HapR,图形4lg,HAC模拟,多金属氧化物半导体,PopGen报告,爆裂声,降雨,蜘蛛,
反向建议: 阿德根特,飞镖R,省道R.base,高级统计师,帕戈

链接:

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