graph4lg:用于景观遗传学分析的构建图

为景观遗传学分析绘制图表。这套函数可用于导入和转换空间和遗传数据最初以不同的格式导入使用创建的景观图“GRAPHAB”软件(Foltete等人,2012年)<doi:10.1016/j.envsoft.2012.07.002>, 通过距离关系绘制隔离诊断图,以便选择如何构建遗传图,创建包含大量修剪方法,用几个遗传距离加权它们的联系,绘制分析图形,并与其他图形进行比较。它使用来自其他软件包,如“adegenet”(琼巴特,2008)<doi:10.1093/bioinformatics/btn129>和“图表”(Csardiet Nepusz,2006)<https://igraph.org/>. 它还实现了方法在景观遗传学中常用来创建图形,由Dyer et描述Nason(2004)<doi:10.1111/j.1365-294X.2004.02177.x>和Greenbaum等人费弗曼(2017)<doi:10.1111/mec.14059>,并分析距离数据(van Strien等人,2015年)<doi:10.1038/hdy.2014.62>.

版本: 1.8.0
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 阿德根特,ggplot2,字符串,迁移率,统计数据,spastat.geom公司,spastat.linnet公司,矩阵,素食主义者,实用程序,方法,聚乙二醇,MASS(质量),第三年,服务提供商,平方英尺,高级统计师,说唱歌手,G距离,光栅,外国的,生态学者,Rdpack公司
建议: 针织者,rmarkdown公司
出版: 2023-01-30年
作者: 保罗·萨瓦里ORCID标识[或者,cre],吉尔斯·维德尔ORCID标识【ctb】,泰勒·鲁道夫,亚历山大·丹尼尔
维护人员: 保罗·萨瓦里
许可证: GPL-2型
需要编译:
引用: graph4lg引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: graph4lg结果

文档:

参考手册: 图形4lg.pdf
守夜人: 2-用“graph4lg”构建和分析遗传图
4-景观和遗传图与“graph4lg”的比较
1-使用“graph4lg”处理景观和遗传数据
3-使用Graphab和“graph4lg”构建和分析景观图

下载内容:

包源: 图4lg_1.8.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:graph4lg_1.8.0.zip,r版本:graph4lg_1.8.0.zip,r-oldrel:graph4lg_1.8.0.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):图表4lg_1.8.0.tgz,r-oldrel(arm64):图表4lg_1.8.0.tgz,r-版本(x86_64):图表4lg_1.8.0.tgz,r-oldrel(x86_64):图表4lg_1.8.0.tgz
旧来源: graph4lg存档

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