graph4lg:用于景观遗传学分析的构建图
为景观遗传学分析绘制图表。这套函数可用于导入和转换空间和遗传数据最初以不同的格式导入使用创建的景观图“GRAPHAB”软件(Foltete等人,2012年)<doi:10.1016/j.envsoft.2012.07.002>, 通过距离关系绘制隔离诊断图,以便选择如何构建遗传图,创建包含大量修剪方法,用几个遗传距离加权它们的联系,绘制分析图形,并与其他图形进行比较。它使用来自其他软件包,如“adegenet”(琼巴特,2008)<doi:10.1093/bioinformatics/btn129>和“图表”(Csardiet Nepusz,2006)<https://igraph.org/>. 它还实现了方法在景观遗传学中常用来创建图形,由Dyer et描述Nason(2004)<doi:10.1111/j.1365-294X.2004.02177.x>和Greenbaum等人费弗曼(2017)<doi:10.1111/mec.14059>,并分析距离数据(van Strien等人,2015年)<doi:10.1038/hdy.2014.62>.
版本: |
1.8.0 |
取决于: |
R(≥3.1.0) |
进口: |
阿德根特,ggplot2,字符串,迁移率,统计数据,spastat.geom公司,spastat.linnet公司,矩阵,素食主义者,实用程序,方法,聚乙二醇,MASS(质量),第三年,服务提供商,平方英尺,高级统计师,说唱歌手,G距离,光栅,外国的,生态学者,Rdpack公司 |
建议: |
针织者,rmarkdown公司 |
出版: |
2023-01-30年 |
作者: |
保罗·萨瓦里[或者,cre],吉尔斯·维德尔【ctb】,泰勒·鲁道夫,亚历山大·丹尼尔 |
维护人员: |
保罗·萨瓦里 |
许可证: |
GPL-2型 |
需要编译: |
不 |
引用: |
graph4lg引文信息 |
材料: |
自述文件 新闻 |
CRAN检查: |
graph4lg结果 |
文档:
下载内容:
链接:
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