HACSim：物种单体型积累的迭代外推遗传多样性评估曲线

基于Phillips等人（2015）的方法，使用非参数随机（Monte Carlo）优化方法对物种单倍型累积曲线进行迭代外推，以评估样本采样完整性<doi:10.1515/dna-2015-0008>菲利普斯等人（2019年）<doi:10.1002/ece3.4757>和Phillips等人（2020年）<doi:10.7717/peerj-cs.243>. 'HACSim输出了许多有用的采样覆盖率汇总统计数据（“采样紧密度测量”），包括恢复特定数量/比例的观察到的独特物种单倍型所需的可能所需样本大小的估计（以及所需的水平置信区间）。任何基因组标记都可以作为评估遗传多样性评估可能需要的样本大小的目标。该方法特别适合评估DNA条形码倡议的采样充分性。用户还可以根据各种核苷酸替代模型模拟自己的DNA序列。还提供了Shiny应用程序。

版本：	1.0.6-1
进口：	猿(≥ 5.3),数据表（≥1.12.8），图形（≥3.6.1），矩阵统计(≥ 0.56.0),聚乙二醇(≥ 0.13),卢比(≥ 1.0.3),闪亮的（≥1.6.0）、统计数据（≥3.6.1）、实用数据（≥3.6.1）
链接到：	卢比,RcppArmadillo公司
出版：	2022-06-13
作者：	Jarrett D.Phillips〔aut，cre〕，史蒂文·弗伦奇（Steven H.French）、纳夫迪普·辛格（Navdeep Singh）
维护人员：	贾勒特·菲利普斯（Jarrett D.Phillips）
许可证：	GPL-3公司
网址：	<https://github.com/jphill01/HACSim.R><https://github.com/jphill01/HACSim-RShiny应用程序><https://jphill01.shinyapps.io/HACSim网站>
需要编译：	对
CRAN检查：	HACSim结果

文档：

参考手册：

HAC输入.pdf

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包源：	HACSim_1.0.6-1.tar.gz公司
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macOS二进制文件：	r-prerel（arm64）：HACSim_1.0.6-1.tgz，r-release（arm64）：HACSim_1.0.6-1.tgz，r-oldrel（arm64）：HACSim_1.0.6-1.tgz，r-prerel（x86_64）：HACSim_1.0.6-1.tgz，r-release（x86_64）：HACSim_1.0.6-1.tgz
旧来源：	HACSim存档

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