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.2020年10月29日;183(3):636-649.e18。
doi:10.1016/j.cell.2020.09.020。 Epub 2020年10月7日。

TDP-43通过mPTP触发线粒体DNA释放激活ALS的cGAS/STING

附属公司

TDP-43通过mPTP触发线粒体DNA释放激活ALS的cGAS/STING

钱香玉等。 单元格. .

摘要

TDP-43的细胞质积聚是许多肌萎缩侧索硬化症(ALS)病例的疾病标志,与核因子κB(NF-κB)和I型干扰素(IFN)通路上调相关的神经炎症细胞因子谱有关。在这里,我们表明当TDP-43侵入线粒体并通过通透性转换孔释放DNA时,这种炎症是由细胞质DNA传感器环磷酸鸟苷(GMP)-AMP合成酶(cGAS)驱动的。cGAS及其下游信号伙伴STING的药物抑制或基因缺失可防止TDP-43诱导的多能干细胞(iPSC)衍生运动神经元和TDP-43突变小鼠中NF-κB和I型IFN的上调。最后,我们记录了患者脊髓样本中特定cGAS信号代谢物cGAMP水平的升高,这可能是ALS中mtDNA释放和cGAS/STING激活的生物标志物。我们的结果确定mtDNA释放和cGAS/STING激活是TDP-43相关病理学的关键决定因素,并证明在ALS中靶向此途径的潜力。

关键词:ALS;干扰素;核因子-κB;STING;TDP-43;cGAMP;cGAS;mPTP;线粒体;神经变性。

PubMed免责声明

利益冲突声明

利益声明S.L.M.宣布咨询IFM Therapeutics和Quench Bio,并获得葛兰素史克的资助。S.L.M.和C.-H.Y.是国际专利申请号PCT/AU2019051201的指定发明人。所有其他作者都声明没有相互竞争的利益。

数字

无
图形摘要
图S1
图S1
TDP-43导致NF-κB和I型IFN信号传导升高体外试验与图1(A)相关,多西环素(Dox-inducible wild-type(WT)或ALS突变体(Q331K)TDP-43被稳定转导到小鼠神经元细胞系NSC-34中。TDP-43诱导72小时后,收集RNA进行qPCRIfnb1号机组Ifna6号机组Ifit1号机组天花或(B)细胞进行裂解,以进行p-TBK1、p-IRF3、p-p65、TDP-43和肌动蛋白的western blot作为对照。印迹是三个独立实验的代表。(C) 对(A)中细胞的上清液进行干扰素βELISA。(D) 图1A中细胞MAVS、PKR、cGAS、STING、FLAG、TDP-43和肌动蛋白的代表性western blot。(E) 在诱导WT和Q331K TDP-43 72小时后,对MEF的上清液进行IFNβELISA。(F) 在诱导72小时后,对过度表达TDP-43(WT或Q331K)的人THP-1细胞的裂解物进行cGAMP ELISA。(G) 健康对照组和TDP-43-ALS患者iPSC分化为早产儿MNX1期间的图像+运动神经元(第18天),并进一步进入成熟的MNX1+/中国税务局+运动神经元(第28天)。(红色-MNX1或ChAT,绿色-β3-微管蛋白和蓝色-DAPI)。(刻度:40μm)。(H)MNX1型CHAT(查特)通过qPCR测定未分化(第0天)和分化iPSC-derived MNs(第28天)的表达。(一) (G)中细胞的p-TBK1、总TBK1,TDP-43,TFAM和Actin的代表性蛋白印迹(在1%NP-40中溶解)。数据为3-4个独立实验的平均值±SEM。P值使用单向或双向方差分析计算s。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。
图1
图1
TDP-43的炎症信号依赖于cGAS/STING(A)载体单独(Ctrl)或编码FLAG标记野生型(WT)TDP-43和ALS突变(Q331K)的质粒在不同先天免疫传感器基因缺陷的小鼠胚胎成纤维细胞(MEF)中短暂过表达。的表达式Ifnb1号机组天花72小时后通过qPCR进行测量,仅当cGAS或STING基因缺陷时才进行消融。(B) 可诱导的TDP-43结构(WT或Q331K)被转导到WT或STING(STING)CRISPR敲除(KO)THP-1细胞。Dox诱导72小时后,qPCR国际单项体育联合会1TNF公司已执行。(C) 对(B)中TDP-43过度表达的THP-1细胞进行与I型IFN和NF-κB相关的炎症信号通路的western blot分析。(D和E)cGAS抑制剂RU.521和STING抑制剂H-151可防止IFNB1公司TNF公司与健康对照组相比,ALS患者(B)和(E)iPSC-derived运动神经元中TDP-43过度表达THP-1细胞的诱导作用(RU.521,10μM;H-151,1μM)。DMSO被用作溶剂对照(0)。(F和G)通过ELISA对来自健康对照组和ALS患者的iPSC-derived运动神经元的(F)细胞裂解物和来自散发性ALS(n=16)或MS(n=12)患者的(G)死后脊髓样本的cGAMP进行定量。数据为平均值±SEM,来自3-5个独立实验([A]、[B]和[D]–[F])或3个独立实验的代表(C)。在(A)、(B)和(D)中使用双向方差分析计算p值,或在(E)-(G)中使用健康对照组和ALS患者iPSC-MN系(G298S、M337V和A382T)之间的非配对t检验计算p值。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。另请参见图S1和表S1。
图S2
图S2
mtDNA是一种激活cGAS/STING信号传导的DAMP,与图2(a)图2A中FLAG-cGAS免疫沉淀的代表性蛋白质印迹有关。(B) 在溴化乙锭(EtBr)中治疗三周后和去除EtBr2周后THP-1细胞线粒体DNA(mtDNA)耗竭的代表性qPCR分析。为了表明消耗,线粒体基因(MT-ND2型MT-ND3型)归一化为核基因POLG公司作为ΔCT,并与未处理细胞(UT)进行比较。(C)IFNB1公司用qPCR测定UT和ρ中的表达0THP-1细胞对以2′3′-c-di-AM(PS)2(Rp,Rp)(20μM)或DMSO作为溶剂对照刺激4小时或以(D)poly(dA:dT)(1μg/ml)、HT-DNA(2μg/ml)和等效Lipofectamine作为对照刺激6小时的反应。(E) 线粒体基因(MT-ND1号MT-ND2型)用EtBr治疗10天的iPSC-MN中的细胞数量减少。(F) 基因表达IFNB1公司TNF公司和(G)IFNβ和IP-10的生成在ρ0TDP-43-ALS患者的iPSC-MN。(H) 图2D中成像数据mtDNA核仁大小的量化。核仁大小分为三组;<0.0064毫米,0.0064-0.016毫米和>0.016毫米(一)线粒体DNA拷贝数无差异(钕1钕2)在转染WT或突变TDP-43(A315T和Q331K)的MEF的总细胞裂解液中观察到。数据是来自3个独立实验的平均值±SEM。P值使用双向方差分析计算s。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,不另说明。不重要。
图2
图2
TDP-43导致mtDNA释放到细胞质(A)中,TDP-43-EGFP(WT或ALS突变体A315T和Q331K)和FLAG-cGAS在HEK293T细胞中短暂过度表达,然后从FLAG免疫沉淀剂中提取DNA。直接qPCR揭示mtDNA的存在(MT-ND1号MT-ND2型)但不是与丰富的核LINE1元素相对应的DNA(l或f1L1ORF2级)或核糖体基因(RNA18S)绑定到FLAG-cGAS。(B) 使用EtBr(ρ0)。TDP-43诱导72小时后,IFNB1公司TNF公司与未经处理(UT)的对照组相比,表达减少。(C) 对(B)中TDP-43过度表达的THP-1细胞进行与I型IFN和NF-κB相关的炎症信号通路的western blot分析。箭头表示膜上有一个切口,便于多种蛋白质的检测。请参阅关键资源表中的非剪切斑点。(D) OMX-SR显微镜显示,TDP-43(FLAG-tagged,red)易位到线粒体(TIM44,蓝色;TOM20,青色),并诱导DNA(抗DNA,绿色)重新定位到TDP-43过度表达MEF(标尺,5μm)的细胞质中。概述图像是最大强度投影,放大图像是使用Imaris软件(右下角)进行的3D表面重建(比例尺,0.5μm)。另请参阅视频S1。(E和F)通过Imaris软件对(E)线粒体中FLAG-TDP-43的百分比(TIM44)和(F)线粒体外DNA的百分比进行空间量化;每组30-40个细胞。数据是平均值——SEM,来自3个独立实验([A]、[B]、[E]和[F])或3个独立试验的代表([C]和[D])。使用双向方差分析计算p值,以控制(A)和(B)或(E)和(F)的非配对t检验。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,***p<0.0001。另请参见图S2。
图3
图3
TDP-43进入线粒体需要与脂质激酶功能无关的AGK(A)OMX-SR显微镜显示,TDP-43(Myc-tagged,红色)进入线粒体(TIM44,蓝色)和TDP-43诱导DNA重定位(抗DNA,绿色)缺乏TIM22调节亚单位AGK(刻度条,0.5μm)的HEK293T细胞被消融到细胞质中。概述图像是使用Imaris软件进行的最大强度投影(顶部)或3D表面重建(底部)。另请参阅视频S2。(B和C)通过Imaris软件对(B)线粒体中Myc-TDP-43的百分比(TIM44)和(C)对照组线粒体外DNA的百分比进行空间量化,AGK公司−/−AGK公司−/−+重量,或AGK公司−/−+G126EHEK293T细胞;每组30个细胞。(D) 在缺乏AGK的细胞中,TDP-43诱导的(WT,突变体A315T和Q331K)mtDNA释放(胞质/总裂解,百分比)被消融。(E) 用TDP-43抑制剂肽(PM1;1μM,24小时)治疗可防止诱导IFNB1公司TNF公司在TDP-43-ALS患者iPSC-MN中。数据是来自3个独立实验的平均值±SEM。在(B)–(D)中使用单向或双向方差分析对Ctrl或(E)中健康Ctrl和ALS患者iPSC-MN进行非配对t检验,计算p值。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗∗p<0.0001。另请参见图S3。
图S3
图S3
mtDNA泄漏取决于TDP-43进入线粒体,与图3(A)有关,Flp-in对照中GFP-标记的TDP-43(WT、A315T和Q331K)、AGK、TFAM和Actin的代表性western blot分析,AGK公司−/−AGK公司−/−+重量AGK公司−/−+G126EHEK293T细胞。(B) 对面板(A)中的细胞进行典型的western blot分析,以使用所示的亚细胞标记物,与颗粒和RIPA全细胞裂解物(WCL)相比,确定洋地黄裂解胞质部分(cyt)的纯度。(C) 来自健康对照(HC1、HC2、HC3)和TDP-43-ALS患者(G298S、M337V、A382T)的iPSC MNs用1μM对照肽(Scr-ctrl)或抑制剂肽(PM1)处理24小时,并在0.0045%的Digitonin缓冲液中裂解(用于胞质部分)或在1x RIPA缓冲液中裂解(用于全细胞裂解物对照(WCL)然后提取DNA并通过qPCR直接扩增,以显示mtDNA的减少(MT-ND1号MT-ND2型)在细胞质中。LINE1元件(L1ORF1级)和核糖体基因(RNA18S)没有受到影响。(D) 对对照组和ALS患者iPSC-MN进行典型的western blot分析,以确定与颗粒和RIPA全细胞裂解物(WCL)相比,使用所示亚细胞标记物的洋地黄裂解胞质部分(cyt)的纯度。(E) 通过qPCR分析健康对照组(HC4、HC5、HC6)、C9-ALS患者和SOD1-ALS患者的iPSC-MN表达IFNB1公司TNF公司或(F)进行亚细胞分离和DNA定量,如面板(C)所示。数据为每组三名对照组或患者的三个独立实验的平均值±SEM。P值使用双向方差分析对每个基因型的空对照(Ctrl)进行计算。p<0.05,∗∗p<0.01。
图S4
图S4
TDP-43通过mPTP释放mtDNA,与图4(A)TDP-43过度表达的裂解caspase-3的代表性western blot有关Mcl1公司−/−强力霉素(Dox)治疗或ABT-737治疗72小时后MEF诱导细胞凋亡(t=4h)。(B) 图4A中细胞中Bak、Bax、TDP-43和肌动蛋白的代表性western印迹。(C) 用四甲基罗丹明甲酯(TMRM)对来自健康对照组和携带TDP-43突变的ALS患者的iPSC-derived MN进行染色,以探测线粒体膜电位(mΔΨ),并通过FACS分析进行量化(MFI:平均荧光强度)。(D) 线粒体ROS抑制剂mitoQ和mitoTEMPO(0.1-1μM)能有效防止IFNB1公司TNF公司在TDP-43-ALS iPSC-MN中。用CsA(12.5μM)或(G-H)CRISPR处理的HEK293T细胞的细胞溶质裂解物(0.025%洋地黄素)和WCL(1x RIPA)的(E-F)代表性western blot分析Ppid(Ppid)转染TDP-43-EGFP(WT,A315T和Q331K,2.5μg)或未转染(Ctrl)的敲除MEF。使用亚细胞标记物证实了细胞溶胶部分的纯度(I)用VBIT-4和CsA处理(10uM,t=24h)可减少mtDNA(MT-ND1号MT-ND2型)如图S3C所示释放到细胞质中,(J)减少IFNB1公司TNF公司经qPCR测定,和(K)减少了由ELISA定量的IFNβ和IP-10的生成。(五十) CRISPR公司Vdac1型击倒MEF显示无TDP-43诱导国际单项体育联合会1天花表达式。数据为3-4个独立实验的平均值±SEM。P值使用健康对照组和TDP-43-ALS患者iPSC-MN系之间的非配对t检验或DMSO或载体对照组的单向方差分析计算s。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。
图4
图4
TDP-43通过编码TDP-43(WT或Q331K)的mPTP(A)质粒将mtDNA释放到细胞质,在Bax和Bak基因缺陷的MEF中短暂过度表达。的表达式Ifnb1号机组天花72小时后通过qPCR进行测量。(B)健康对照组和TDP-43(G298S、M337V和A382T)突变的ALS患者的人iPSC-衍生运动神经元在终末分化2周后用丝裂原红(mitoSOX red)进行处理,以量化线粒体ROS,然后进行荧光激活细胞分选(FACS)分析(MFI,平均荧光强度)。(C) OMX-SR显微镜显示,TDP-43诱导的(FLAG标记的,红色)DNA(反DNA,绿色)从线粒体(TIM44,蓝色;TOM20,青色)迁移到细胞质中,通过抑制TDP-43突变体(Q331K)-过表达MEFs(比例尺,5μM)中的mPTP(CsA,12.5μM)而显著减少。DMSO被用作溶剂对照。概述图像是最大强度投影,放大图像是使用Imaris软件(右下角)进行的3D表面重建(比例尺,0.5μm)。另请参阅视频S3。(D) 用Imaris软件对线粒体外DNA百分比进行空间量化(TIM44);每组30-40个细胞。(E和F)抑制HEK293T细胞中的mPTP(CsA,12.5μMIfnb1号机组基因表达与Hprt(小时)由TDP-43瞬时过表达(WT、A315T或Q331K)诱导。(G和H)CRISPR介导的mPTP成分的基因缺失Ppid(Ppid)还阻断了线粒体DNA向细胞质和(H)下游的释放Ifnb1号机组基因表达。数据为平均值±SEM,来自3个独立实验([A]、[B]和[D]–[H])或3个独立试验的代表(C)。在(B)和(D)中使用非配对t检验计算p值,在(A)和(E)–(H)中使用双向方差分析进行对照。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。另请参见图S4。
图S5
图S5
Prp-TDP-43的发病率和进展Tg(千克)/+与图5(A)相关的小鼠I型干扰素的qPCR分析(Ifnb1号机组Ifna6号机组),干扰素刺激基因(Mx1型Ifit1号机组Irf7型)和NF-κB基因(天花伊尔6伊尔1b)为WT和Prp-TDP-43提供Tg(千克)/+骨髓来源的巨噬细胞,取自150天大的小鼠。mRNA表达标准化为Hprt(小时)作为相对基因表达(每组4只小鼠的平均值±SD)。(B) WT和Prp-TDP-43的血清IFNβTg(千克)/+在第150天通过ELISA对小鼠进行定量。(C) WT和Prp-TDP-43的皮层和脊髓单细胞悬浮液Tg(千克)/+对小鼠(n=7,年龄120天)进行亚细胞分离,然后直接qPCR检测线粒体DNA(钕1钕2),线路1元素和核糖体控制(RNA18S)。(D) WT和Prp-TDP-43皮层和脊髓单细胞悬液的代表性western blot分析Tg(千克)/+小鼠,用亚细胞标记物表明(E)Digitonin裂解细胞溶质部分(cyt)的基因缺失显著降低发病后的疾病进展率(整个寿命期步态损伤的线性回归斜率)。数据为平均值±SEMP值Prp-TDP-43中的s 0.0018Tg(千克)/++/−和0.0015英寸Prp-TDP-43Tg(千克)/+−/−与Prp-TDP-43相比玻璃钢/++/+(F)Prp-TDP-43脑裂解物中转基因FLAG-TDP-43突变体(A315T)、TDP-43、STING和Actin的代表性western blotTg(千克)/+图5中使用的菌株和对照菌株。在150天大时,每组分析三只小鼠。(G) 使用ImageJ和MouseMove分析从OF测试中捕获的视频,然后将其作为男性WT(n=12)的代表性累积轨迹,−/−(n=6),Prp-TDP-43Tg(千克)/++/+(n=8),Prp-TDP-43Tg(千克)/++/−(n=5)和Prp-TDP-43Tg(千克)/+−/−(n=8)小鼠130天。(H) 测试数据的量化表明显著恢复Prp-TDP-43的运动活性Tg(千克)/+ALS模型相对于WT对照组(n=12)的移动距离,以及(I)在120-130天的10分钟of试验中,他们静止的部分时间。这里研究的动物都是雄性。数据为4项独立神经行为测试的平均值±SEM。P值使用两组(A、B、C)之间的非配对t检验或Prp-TDP-43的单向方差分析(E、H、I)计算sTg(千克)/++/+.p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。
图5
图5
基因缺失缓解ALS小鼠模型中的疾病(A)量化WT小鼠和转基因人类TDP-43突变等位基因A315T(Prp-TDP-43)小鼠的皮层、脊髓和血清中的cGAMPTg(千克)/+)(n=5)。参见动物表型评分。(B)不会改变Prp-TDP-43的发病情况Tg(千克)/+小鼠(步态障碍首次得分为1的当天发病率)。(C) Prp-TDP-43型Tg(千克)/+11只小鼠发展为进行性神经退行性疾病,需要平均148天进行安乐死。杂合(n=9)或纯合(n=10)缺失显著延长寿命。(D和E)120天时,Prp-TDP-43Tg(千克)/+在旋转试验中,小鼠的跌倒潜伏期显著降低(n=5-8),(E)步态明显受损(n=6-21)炎症基因表达的(F)qPCR与Hprt(小时)在大脑皮层和脊髓中,I型干扰素和NF-κB依赖性细胞因子的水平增加,因为(n=3–6)。(G) 通过WT和Prp-TDP-43大脑的冠状断面(标尺,5mm)的典型尼塞尔体染色(甲酚紫)Tg(千克)/+有或没有以下基因缺失的小鼠在150天龄时。概述图像是选定的放大灰度图像(比例尺,200μm)。(H) (G)(n=4)中棕色条标记的皮层V层神经元的量化。这里研究的所有动物都是雄性。数据为平均值±SEM。使用(A)中两组之间的非配对t检验或Prp-TDP-43的单向方差分析计算p值Tg(千克)/++/+在(B)–(F)和(H)中。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001,∗∗∗∗p<0.0001。另请参见图S5。
图6
图6
STING抑制改善神经变性体外试验在体内(A) 典型的亮场图像表明,H-151(1μM)可防止TDP-43-ALS患者在终末分化28天后iPSC-衍生运动神经元死亡(标尺,50μM)。(B) 通过LDH释放试验测定(A)中细胞死亡的定量。(C) 项目-TDP-43Tg(千克)/+小鼠每周三次腹腔注射H-151(210μg),持续四周,从110日龄开始发病。如qPCR所示,这种治疗显著降低了皮质和脊髓中促炎细胞因子基因的表达(n=3)。(D) 通过冠状切片的甲酚紫染色(标尺,5 mm)对神经元丢失进行成像。图中显示了一幅具有代表性的图像,选定的放大灰度图像突出显示了由棕色条(比例尺,200μm)标记的皮层V层神经元。(E) 来自(D)的皮层V层神经元的自动量化(n=6)。(F) 与DMSO处理的小鼠(n=5)相比,H-151处理的老鼠在旋转试验中表现出更好的性能。这里研究的所有动物都是雄性。数据为平均值±SEM。使用(B)中的双向方差分析或(C)、(E)和(F)中两组之间的非配对t检验计算p值。p<0.05,∗∗p<0.01,∗∗∗p<0.001。

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