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比较研究
.2011年12月2日;10(12):5275-84.
doi:10.1021/pr101183k。 Epub 2011年11月3日。

哺乳动物细胞的全系统蛋白质组分析揭示了保守的功能性蛋白质周转

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比较研究

哺乳动物细胞的全系统蛋白质组分析揭示了保守的功能性蛋白质周转

西德尼·B·剑桥等人。 蛋白组学研究杂志. .

摘要

哺乳动物蛋白质组中每个蛋白质的周转是一个重要的功能特征。在这里,我们使用高分辨率质谱来量化非分裂哺乳动物细胞中的蛋白质动力学。外源氨基酸与内源氨基酸与从头合成蛋白质的比率约为17:1。使用过饱和SILAC标记,我们获得了HeLa中4106个蛋白质和C2C12细胞中3528个蛋白质的准确周转率。对这些人类和小鼠细胞系的比较表明,蛋白质同源序列具有高度显著的周转相关性,因此具有较高的物种保守性。在功能上,我们观察到磷蛋白周转和基因本体分类的统计学显著趋势,这表明小鼠和人类之间存在广泛的协变量。同样,一些蛋白质复合物的成员,如蛋白酶体,具有高度相似的周转率。物种保守性高,复杂方差低,这意味着蛋白质周转的调节微调很大。

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