产品信息
GeneCopoeia的CytoCt™RT-qPCR系统可以通过实时RT-qCR直接分析10-100000个试管或96-well平板培养细胞的基因表达,无需任何RNA纯化,提高了方便性、速度、吞吐量、数据可靠性和灵敏度。传统上,在通过RT-qPCR分析进行基因表达定量和剖面分析之前,先从培养细胞中提取和纯化RNA。CytolCt™RT-qPCR系统跳过RNA提取步骤,直接从96倍平板或其他格式培养的细胞中制备细胞裂解物。借助GeneCopoeia的CytoCt™RT-qPCR系统,使用细胞裂解缓冲液,然后进行两步或一步RT-qCR工作流程,可以在约90分钟内完成基因表达分析。该系统包括CytoCt™细胞裂解试剂盒、CytoC™cDNA合成试剂盒和CytoCt™一步法RT-qPCR试剂盒。
优势
- 无需任何RNA纯化,直接从培养细胞中提取简便的RT-qPCR
- 10-10万培养细胞基因表达的敏感性检测
- 96-well板或管中直接细胞裂解的高通量和提高速度
- 从细胞裂解到RT-qPCR反应的稳健性能和系统优化
简单工作流
只需将细胞培养到所需的密度,然后添加裂解液并在室温下培养10分钟。接下来,转移到PCR板上,然后在25℃下加热2分钟,在37℃下加热5分钟,然后在75℃下加热10分钟。裂解产物可用于RT-qPCR反应或储存以备将来使用。
性能数据
图1。 使用来自试管或96孔板的细胞裂解物的一步RT-qPCR的灵敏度。 答:。使用GeneCopoeia、Ambion或Bio-Rad的裂解缓冲液裂解HCT116细胞的细胞裂解液对GAPDH基因进行一步RT-qPCR分析。将5µl不同浓度(5至5000个细胞/µl)的悬浮细胞与裂解缓冲液混合,并按照每个制造商的用户手册进行处理。在每个一步RT-qPCR反应中使用2µl细胞裂解液(估计相当于1-1000个细胞/反应)。BH1299细胞接种在96孔板中,梯度为250至5000个细胞/孔。培养96小时后,根据初始播种密度,估计每个孔的最终细胞数约为2500至50000个细胞。将每个孔中的细胞与50µl裂解缓冲液和DNase I混合,并按照用户手册进行处理。一步RT-qPCR反应使用2µl细胞裂解液(估计相当于10-200个细胞/反应)。
图2。使用总RNA或CytoCt的基因表达的一步RT-qPCR™缓冲液中的lysed-cell裂解物来自相同数量的细胞。每个反应大约有1500个细胞当量。答:。来自HCT116细胞的42个基因。B。来自H1299细胞的37个基因。
图3。基因表达的一步RT-qPCR,使用来自相同数量细胞的细胞裂解物,用GeneCopoeia或BioRad裂解缓冲液裂解。每个反应大约有1500个细胞当量。答:。HCT116细胞裂解物中的43个基因。B。来自H1299细胞裂解物的37个基因。
图4。在96 well板中使用细胞裂解物进行RT-qPCR检测。每孔接种3000–5000个HEK293细胞,置于96 well板中,培养至70%至90%汇合。细胞要么用GeneCopoeia和Bio-Rad的裂解缓冲液进行裂解,要么提取RNA。使用少量细胞裂解物(估计相当于200个细胞/反应)进行一步RT-qPCR反应,以检测8个基因的表达。