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.2021年4月13日;17(4):2630-2639.
doi:10.1021/acs.jctc.1c00136。 Epub 2021年3月29日。

蛋白质-配体结合诱导适配对接问题的可靠精确解

附属公司

蛋白质-配体结合诱导适配对接问题的可靠精确解

爱德华·米勒等。 化学理论计算杂志. .

摘要

我们将基于配体的药效团对接、刚性受体对接和蛋白质结构预测与显式溶剂分子动力学模拟相结合,提出了一种可靠、准确的蛋白质与配体结合诱导适配对接问题的解决方案。在详细的回顾性和前瞻性测试中,这种新方法成功地确定了90%以上的交叉对接案例中的蛋白质-甘氨酸结合模式,且根-平方偏差在2.5º以内。我们进一步证明,这些预测的配体受体结构足够准确,可以前瞻性地为具有挑战性的靶点实现基于结构的预测性药物发现,大大扩展了此类方法的适用范围。

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