doi:10.1007/978-1-4939-3524-6_13。
使用CPTAC分析门户识别和实施高度特征化的靶向蛋白质组分析
杰弗里·怀特克 1, 戈兰·N·哈卢萨 2, 安德鲁·霍夫纳格尔 三, 瓦吉莎·夏尔马 4, 布伦丹·麦克林 4, Ping Yan公司 1, 约翰·A·罗贝尔 5, 雅各布·肯尼迪 1, D R曼尼 6, 丽莎·齐默尔曼 7, 马修·梅耶 8, 梅赫迪·梅斯里 9, 艾米丽·博亚 9, 史蒂文·卡尔 6, 丹尼尔·W·陈 10, 西安晨 5, 陈静（音译） 10, 谢里·戴维斯 8, 马修·J·C·埃利斯 8, 大卫·费尼奥 11, 塔拉·希尔特克 9, 凯伦·凯彻姆 12, 克里斯·金辛格 9, 埃里克·库恩 6, 丹尼尔·利伯勒 7, 刘涛（Tao Liu） 13, 迈克尔·洛斯 2, 迈克尔·麦克斯 4, 钱伟军 13, 罗伯特·里弗斯 9, 卡琳·D·罗德兰 13, Kelly V橄榄球 11, 米切尔·G·斯科特 14, 理查德·德·史密斯 15, 斯特凡尼·托马斯 10, R Reid Townsend先生 8, 戈登·怀特利 2, 吴朝超 13, 张慧 10, Zhen Zhang先生 10, 亨利·罗德里格斯 9, 阿曼达·G·保罗维奇 16
附属机构
附属机构
- 1弗雷德·哈钦森癌症研究中心临床研究部，地址：1100 Fairview Avenue，N.，Seattle，WA，98109，USA。
- 2弗雷德里克癌症研究国家实验室，Leidos生物医学研究公司，美国马里兰州弗雷德里克。
- 三华盛顿大学实验医学系，西雅图，华盛顿州，美国。
- 4华盛顿大学基因组科学系，美国华盛顿州西雅图。
- 5美国北卡罗来纳大学教堂山医学院生物化学和生物物理系。
- 6美国马萨诸塞州剑桥市布罗德学院。
- 7美国田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学院吉姆·艾尔斯癌前检测与诊断研究所生物化学系。
- 8美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。
- 9美国马里兰州贝塞斯达国家癌症研究所癌症临床蛋白质组研究办公室。
- 10美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯大学医学院病理学系临床化学部。
- 11美国纽约州纽约市纽约大学医学院生物化学和分子药理学系。
- 12美国马里兰州罗克维尔ESAC公司数据协调中心。
- 13美国华盛顿州里奇兰太平洋西北国家实验室生物科学部。
- 14美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院病理学和免疫学系实验室和基因组医学部。
- 15美国华盛顿州里奇兰市太平洋西北国家实验室生物科学部和环境分子科学实验室。
- 16弗雷德·哈钦森癌症研究中心临床研究部，地址：1100 Fairview Avenue，N.，Seattle，WA，98109，USA。apaulovi@fredhutch.org。
剪贴板中的项目
使用CPTAC分析门户识别和实施高度特征化的靶向蛋白质组分析
杰弗里·怀特克等。
分子生物学方法.
2016.
doi:10.1007/978-1-4939-3524-6_13。
作者
杰弗里·怀特克 1, 戈兰·N·哈卢萨 2, 安德鲁·霍夫纳格尔 三, 瓦吉莎·夏尔马 4, 布伦丹·麦克林 4, Ping Yan公司 1, 约翰·A·罗贝尔 5, 雅各布·肯尼迪 1, D R曼尼 6, 丽莎·齐默尔曼 7, 马修·梅耶 8, 梅赫迪·梅斯里 9, 艾米丽·博亚 9, 史蒂文·卡尔 6, 丹尼尔·W·陈 10, 西安晨 5, 陈静（音译） 10, 谢里·戴维斯 8, 马修·J·C·埃利斯 8, 大卫·费尼奥 11, 塔拉·希尔特克 9, 凯伦·凯彻姆 12, 克里斯·金辛格 9, 埃里克·库恩 6, 丹尼尔·利伯勒 7, 刘涛（Tao Liu） 13, 迈克尔·洛斯 2, 迈克尔·麦克斯 4, 钱伟军 13, 罗伯特·里弗斯 9, 卡琳·D·罗德兰 13, Kelly V橄榄球 11, 米切尔·G·斯科特 14, 理查德·德·史密斯 15, 斯特凡尼·托马斯 10, R Reid Townsend先生 8, 戈登·怀特利 2, 吴朝超 13, 张慧 10, Zhen Zhang先生 10, 亨利·罗德里格斯 9, 阿曼达·G·保罗维奇 16
附属机构
- 1弗雷德·哈钦森癌症研究中心临床研究部，地址：1100 Fairview Avenue，N.，Seattle，WA，98109，USA。
- 2弗雷德里克癌症研究国家实验室，Leidos生物医学研究公司，美国马里兰州弗雷德里克。
- 三华盛顿大学实验医学系，西雅图，华盛顿州，美国。
- 4华盛顿大学基因组科学系，美国华盛顿州西雅图。
- 5美国北卡罗来纳大学教堂山医学院生物化学和生物物理系。
- 6美国马萨诸塞州剑桥市布罗德学院。
- 7美国田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学院吉姆·艾尔斯癌前检测与诊断研究所生物化学系。
- 8美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院医学系。
- 9美国马里兰州贝塞斯达国家癌症研究所癌症临床蛋白质组研究办公室。
- 10美国马里兰州巴尔的摩约翰霍普金斯大学医学院病理学系临床化学部。
- 11美国纽约州纽约市纽约大学医学院生物化学和分子药理学系。
- 12美国马里兰州罗克维尔ESAC公司数据协调中心。
- 13美国华盛顿州里奇兰太平洋西北国家实验室生物科学部。
- 14美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院病理学和免疫学系实验室和基因组医学部。
- 15美国华盛顿州里奇兰市太平洋西北国家实验室生物科学部和环境分子科学实验室。
- 16弗雷德·哈钦森癌症研究中心临床研究部，地址：1100 Fairview Avenue，N.，Seattle，WA，98109，USA。apaulovi@fredhutch.org。
剪贴板中的项目
摘要
美国国家癌症研究所（NCI）的临床蛋白质组肿瘤分析联合会（CPTAC）启动了一个分析门户(http://assesss.cancer.gov)作为特征明确的靶向蛋白质组分析的开放源代码库。该门户网站旨在通过提供详细的分析性能表征数据、标准操作程序和试剂访问，策划和传播高度表征的、基于靶向质谱（MS）的分析。通过查询门户访问分析内容，以查找针对与特定细胞路径、蛋白质复合体或特定染色体区域相关的蛋白质的分析。有可用分析的肽分析物的位置与蛋白质中其他感兴趣的特征相对应，例如序列域、亚型、单核苷酸多态性和翻译后修饰。总体目标是实现所有人类蛋白质的稳健量化，并标准化基于MS的靶向测定的量化，以最终实现随着时间的推移和实验室之间的结果协调。
关键词：协调；MRM；多重反应监测；PRM；定量分析数据库；定量蛋白质组学；SRM；选择性反应监测；标准化；靶向质谱法。
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