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.2010年2月3日;29(3):606-18.
doi:10.1038/emboj.2009.369。 Epub 2009年12月10日。

BCL-2在内质网对抗Beclin 1依赖性自噬需要NAF-1

附属公司

BCL-2在内质网对抗Beclin 1依赖性自噬需要NAF-1

娜塔莎·C·张等。 欧洲工商管理硕士J. .

摘要

除了线粒体外,BCL-2位于内质网(ER),是几个不同复合物的组成部分。在这里,我们确定了内质网处的BCL-2相互作用蛋白,即营养剥夺自噬因子-1(NAF-1),这是一种位性整合膜蛋白,其缺陷表达是神经退行性疾病Wolfram综合征2(WFS2)病因的基础。NAF-1在其细胞溶质区域内含有一个双铁双硫配位结构域,这对于与BCL-2的相互作用是必要的,但并不足够。NAF-1被ER限制的仅限BH3的蛋白BIK从BCL-2取代,并有助于调节BIK启动的自噬,而不是BIK依赖性的胱天蛋白酶激活。与BCL-2类似,NAF-1与肌醇1,4,5-三磷酸受体相关,是BCL-2介导的ER Ca(2+)储存抑制所必需的。在作为自噬生理刺激的营养剥夺期间,已知BCL-2通过抑制自噬效应器和肿瘤抑制因子Beclin 1发挥作用。在内质网BCL-2的这一途径中需要NAF-1,以在功能上拮抗Beclin 1依赖的自噬。因此,NAF-1是一种BCL-2相关的辅因子,以BCL-2为靶点,对抗内质网自噬途径。

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图1
图1
在ER中鉴定一种新型BCL-2相互作用伴侣NAF-1(A类)仅BH3-BIK在内质网置换BCL-2复合物的一个子集。从H1299 HA-BCL-2b5细胞纯化的LM模拟感染或感染Ad-BIKb5后与BMH交联,并通过免疫印迹观察。星号(*)表示BCL-2交联产品,由BIK取代。粗体箭头表示包含交联NAF-1/BCL-2的区域。(B)NAF-1的氨基酸序列。质谱鉴定的肽序列用双下划线表示。TM域由粗体单下划线表示。细胞溶质域中的半胱氨酸残基用星号表示(*). CDGSH域以灰色突出显示,预测的2Fe-2S配位Cys-3-His-1 aa以粗体标记。向下箭头(∨)表示Flag表位插入的位置。双线箭头(⇓)表示突变(E37Q)时引起WFS2的Glu残基。使用人类蛋白质参考数据库(HPRD)中的磷酸基序查找器发现的预测磷酸化位点在方框中以粗体显示;β-肾上腺素能受体激酶底物基序(aa 25-29)、PKA和PKC激酶底物基序(aa 32-34和67-69)以及酪蛋白激酶II底物基序(aa 34-37)。(C)推导了NAF-1的膜拓扑结构。灰色矩形表示CDGSH域。(D类)从H1299 neo和HA-BCL-2b5细胞中纯化的内源性NAF-1在内质网与BCL-2交联。LM经BMH交联,并用抗NAF-1抗体进行免疫沉淀。用抗BCL-2免疫印迹法分析沉淀。(E类)NAF-1由BCL-2替换为BH3-only BIK。H1299 HA-BCL-2b5细胞要么被模拟感染,要么被Ad-BIK感染。纯化的LM按(D类).
图2
图2
NAF-1/BCL-2相互作用。(A类)内源性NAF-1和BCL-2的协同免疫沉淀。收集来自SK-Mel5细胞的裂解物,并用抗NAF-1抗体进行免疫沉淀。用抗BCL-2和抗NAF-1对沉淀进行免疫印迹。(B)H1299细胞固定并用抗NAF-1和抗Calnexin或抗细胞色素双重染色c(c)抗体。比例尺代表10μm。(C)NAF-1-Flag和HA-BCL-2b5的共免疫沉淀。收集感染Ad-NAF-1-Flag的H1299 HA-BCL-2b5细胞的裂解物,并按(A类). (D类)NAF-1的CDGSH铁结合域突变干扰NAF-1与BCL-2的结合。H1299 HA-BCL-2b5细胞感染了Ad-rtTA、Ad-NAF-1-Flag或Ad-NAF-1-mut-Flag(C99S C101S C110S H114Q)。裂解液按(A类). 使用Scion Image软件进行密度分析,以量化NAF-1-Flag和NAF-1-mut-Flag的表达和共沉淀水平。图表描述了共沉淀蛋白与表达水平的比率。(E类)一个功能性CDGSH铁结合结构域是必需的,但不足以实现NAF-1和BCL-2的细胞溶质结构域之间的相互作用。HA-BCL-2ΔTM为在体外将翻译成兔网织红细胞裂解物的等分样品添加到每个GST下拉反应中。使用的GST融合蛋白为GST单独、GST-NAF1-C、GST-NAF1-C-mut(C99S C101S C110S H114Q)和GST-MitoNEET-C。使用抗HA和抗GST检测蛋白。
图3
图3
NAF-1不影响BIK启动的凋亡,但在缺乏caspase激活的情况下影响BIK诱导的自噬。(A类)用对照(CTRL)或NAF-1 shRNA处理的H1299 neo和HA-BCL-2b5细胞被模拟感染,或在没有或存在50μM zVAD-fmk的情况下用Ad-BIK感染。细胞裂解物通过免疫印迹分析。(B)使用荧光底物DEVD-AMC测定半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶活性。结果代表三个独立实验的平均±标准差。(C)延长BIK表达和半胱天冬酶抑制可诱导自噬,而NAF-1的敲除可增强自噬。用CTRL或NAF-1 shRNA处理的H1299 neo和HA-BCL-2b5细胞在zVAD-fmk存在下感染Ad-BIK达指定时间。细胞裂解物通过免疫印迹分析。通过密度分析将LC3 II水平归一化为肌动蛋白水平。图表描述了每条车道的标准化LC3 II水平。
图4
图4
NAF-1敲除导致饥饿诱导的Beclin 1依赖性自噬的发生率和强度增加。(A类)NAF-1敲除对饥饿诱导的自噬的影响。感染CTRL或NAF-1 shRNA的H1299细胞在含有DMSO(载体)或Baf A1(100 nM)的EBSS中饥饿4小时。细胞裂解物通过免疫印迹分析。(B)转染LUC或NAF-1 siRNA、未经处理和饥饿的H1299 GFP-LC3细胞中GFP-LC2染色的代表性图像。比例尺代表10μm。(C)自噬的定量表示为表达GFP-LC3的细胞显示点状GFP-LC3.的百分比。每个样本至少计数100个细胞;结果代表三个独立实验的平均±标准差。细胞裂解物通过免疫印迹分析。
图5
图5
BCL-2抑制Beclin 1依赖性自噬需要NAF-1。(A类)NAF-1有助于BCL-2和Beclin 1之间的相互作用。用Flag-Beclin 1和LUC或NAF-1 siRNA转染H1299 HA-BCL-2b5细胞。裂解细胞并用抗BCL-2抗体进行免疫沉淀。使用抗Beclin 1和抗BCL-2通过免疫印迹对沉淀进行分析。所有通道都来自相同的凝胶和相同的暴露。细白线表示车道已被移除的位置。(B)NAF-1缺失可阻止BCL-2b5对抗饥饿诱导的自噬。用LUC或NAF-1 siRNA转染H1299 GFP-LC3和BCL-2b5/GFP-LC2细胞,并饥饿4 h。如图4C所示,对细胞进行分析。(C)用LUC或NAF-1 siRNA处理的H1299 neo和HA-BCL-2b5细胞的代表性电子显微照片,有或没有随后的饥饿。比例尺代表10μm。细胞裂解物通过免疫印迹分析。所有通道都来自相同的凝胶和相同的暴露。细白线表示车道已被移除的位置。电子显微镜观察到的自噬水平(C)量化并表示为含有自噬空泡的细胞百分比(D类)或每个细胞的自噬体数量(E类). 每个样本至少计数100个细胞;结果表示平均值±标准误差。
图6
图6
NAF-1敲低逆转BCL-2降低ER Ca2+商店。(A类)用CTRL或NAF-1 shRNA处理的H1299 neo和HA-BCL-2b5细胞装载Fura-2AM和ER-Ca2+储存量被测量为细胞质钙的差异2+添加TG前后的浓度(2μM)。显示了在340/380 nm激发波长比和510 nm波长发射下测得的Fura-2AM荧光的代表性痕迹。箭头表示添加TG的时间,δ值表示TG敏感ER-Ca2+商店。(B)ER Ca差异2+存储显示为三个独立实验的平均±标准误差,如(A类). (C)共免疫沉淀内源性NAF-1和内源性IP3受体Ⅰ型。收集H1299 HA-BCL-2b5细胞的裂解液,用抗IP3R1抗体进行免疫沉淀。通过免疫印迹分析产生的沉淀物。

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