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.2010年2月;1800(2):181-9.
doi:10.1016/j.bbagen.2009.07.005。 Epub 2009年7月16日。

半乳糖凝集素-3在细胞核和细胞质中的动力学

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半乳糖凝集素-3在细胞核和细胞质中的动力学

凯文·豪德克等。 Biochim生物物理学报. 2010年2月.

摘要

这篇综述总结了半乳糖凝集素-3(Gal3)的部分研究,作为细胞细胞质和细胞核中碳水化合物结合蛋白动态行为的一个例子。在由15个成员组成的半乳糖凝集素家族中,Gal3(M(r)约30000)是嵌合体亚类的唯一代表,其中富含脯氨酸和甘氨酸的NH(2)-末端结构域融合到负责结合含半乳糖的糖缀合物的COOH末端碳水化合物识别结构域上。蛋白质在细胞质和细胞核之间穿梭,基于导入蛋白识别的靶向信号进行核定位,导出蛋白1(CRM1)识别的靶信号进行核输出。根据细胞类型、体外特定实验条件或组织位置,据报道Gal3仅为细胞质,主要为核,或分布在两个隔室之间。因此,蛋白质的核质分布必须反映出核质输入和输出之间的平衡,以及细胞质锚定或与核成分结合的机制。事实上,在细胞质和细胞核中已经报道了Gal3的一些配体。然而,大多数配体似乎通过蛋白质相互作用而不是通过蛋白质-碳水化合物识别来结合Gal3。例如,在细胞质中,Gal3与凋亡抑制因子Bcl-2相互作用,这种相互作用可能参与Gal3的抗凋亡活性。在细胞核中,Gal3是必需的前mRNA剪接因子;该蛋白通过与U1小核核糖核蛋白(snRNP)复合物结合而并入剪接体。尽管大多数这些相互作用是通过Gal3的碳水化合物识别域发生的,而糖配体(如乳糖)可以干扰其中一些相互作用,但蛋白质的碳水化合物结合活性的重要性本身仍然是未来研究的一个挑战。

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数字

图1
图1
(A)Gal3多肽几种同源物的羧基末端28个氨基酸残基的氨基酸序列。蛋白质数据库的登录号如下:人(NP 002297)、小鼠(NP 034835)、长尾仓鼠(CAA55479)、挪威大鼠(NP 114020)、兔子(NP 001075807)、狗(P38486)、牛(NP 001095811)、鲑鱼(NP 001134305)、鸡(NP 999756)。序列通过Vector NTI(Invitrogen)检索和对齐。左图显示了与每个物种多肽上的位置相对应的残数。与核导入相关的保守残基,对应于人类序列中的R224和小鼠序列中的I-LT,以黑体字突出显示,富含疏水性的保守NES以黑色背景上的白色字母显示。柱面和序列下方的箭头将其与面板B所示CRD晶体结构中相应的单个α螺旋线以及S2和F1β链对齐。(B)显示Gal3人CRD多肽骨架三维结构的带状图(蛋白质数据库#2NN8[92]),该结构由PyMOL(W.L.DeLano,the PyMOL Molecular Graphics System,DeLano Scientific LLC,加利福尼亚州帕洛阿尔托市,美国)生成。http://www.pymol.org). 构成β夹芯的两个β板的绞线标记为F1-F5(五股板)和S1-S6(六股板)。确定对核进口至关重要的残留物用填空表示法显示,并根据人类序列进行编号。
图2
图2
Gal3与snRNP和前mRNA剪接底物的关联图。前体mRNA在左侧显示为两个由单线内含子连接的矩形外显子。右侧显示了新发现的Gal3与剪接体外snRNP的关联。Gal3可以通过与U1 snRNP的结合在早期组装阶段进入剪接途径。此外,Gal3还与剪接体外部较大复合体中的多个snRNP结合。实心箭头表示累积实验数据支持的步骤;虚线箭头表示需要实验验证的假设Gal3参与。

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