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.2008年6月;20(3):316-25.
doi:10.1016/j.ceb.2008.03.004。 Epub 2008年4月25日。

组蛋白赖氨酸去甲基化酶的调控机制

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组蛋白赖氨酸去甲基化酶的调控机制

费兰等。 Curr Opin细胞生物学. 2008年6月.

摘要

自2004年发现第一个组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1(LSD1)以来,大量组蛋白脱甲基酶被发现并证明在基因表达、细胞分化和动物发育中发挥着重要作用。其他地方已经广泛讨论了化学机制和底物特性。本综述主要关注调节去甲基化酶募集和活性的调节机制。

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图1
图1。表达、相互作用蛋白和局部染色质环境对脱甲基酶调节的模型
多个水平的调节必须协调以允许适当的去甲基化酶活性-组蛋白赖氨酸去甲基化酶类(KDM-蓝色卵形)必须表达,适当的DNA结合因子和辅因子必须存在并关联,局部染色质环境必须允许(或积极促进)复合物的稳定性。A) 去甲基化酶表达的调控提供了第一个、最普遍的调控水平。B) 蛋白质:蛋白质相互作用允许按照不同的DNA结合模块的指示,构建具有不同组成的复合物(蓝色和绿色矩形表示不同的DNA结合因子)。在本例中,尽管局部环境允许,但通过结合转录因子(蓝色矩形)的KDM结合不会因相关辅因子的抑制而导致酶活性。C) 局部染色质环境通过招募和/或稳定适当的复合物影响去甲基化酶活性。在这里,尽管有适当的络合物形成,但缺少特定修饰(黄色圆圈)会导致络合物分离。D) 所有这些条件,通过分化或外部刺激信号,协调调节KDM活性(导致失去红三角,代表抑制性甲基化标记)和转录状态的改变(基因现在转录活跃)。尽管图中描绘了一个基因激活事件,但该模型对抑制转录的去甲基化酶也适用。
图2
图2。参与H3K4me和H3K27me调节的可能表观遗传机制图
A) KDM1/LSD1介导的H3K4me2去甲基化。说明了KDM1/LSD1复合体的逐步工作模型。整个过程包括HDAC介导的脱乙酰化、CoREST结合、KDM1/LSD1介导的H3K4脱甲基和BHC80结合(H3K4me0)。B) 提出了一种将二价结构域分解为单价结构域的模型。在多能性阶段,MLL和PRC复合物建立了“二价结构域”,H3K27和H3K4脱甲基酶的招募不存在。在分化过程中,甲基化酶复合物被选择性地保留,去甲基化酶被不同地招募,从而产生H3K4me3或H3K27me3结构域。

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引用人

工具书类

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