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比较研究
.2005年3月22日;1743(1-2):64-78.
doi:10.1016/j.bbamcr.2004.08.010。

Purα与DNA结合和局部链分离的机制及其与Pur家族成员Purβ的比较

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Purα与DNA结合和局部链分离的机制及其与Pur家族成员Purβ的比较

玛格丽特·沃特曼等人。 Biochim生物物理学报. .
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摘要

Pur-alpha是一种单链(ss)DNA和RNA-结合蛋白,具有三个保守的特征重复序列,对富含鸟苷的基序具有特定的亲和力。Pur-alpha通过与富含嘌呤的链保持接触并取代富含嘧啶的链来解开含有富含嘌呤的重复序列的双链寡核苷酸。突变分析表明,Pur-alpha重复区的精氨酸和芳香残基对ss和双链DNA结合都至关重要。Purα结合线性化或超螺旋的质粒DNA,在琼脂糖凝胶中产生一系列规则间隔的条带。这一系列很可能是由于Pur-α量子的局域解旋,因为凝胶中Pur-alpha的去除消除了该系列,并且Pur-alpha结合增加了质粒与高锰酸钾反应的敏感性,高锰酸钠是一种针对解旋区域的反应。Pur-alpha与线性双链DNA的结合为噬菌体T4 gp32蛋白创造了结合位点,该蛋白是一种ss-DNA结合蛋白,本身并不与线性DNA结合。相反,缺乏PurαC末端区域的Purβ结合超螺旋DNA,但不结合线性化DNA。类似地,Pur-alpha的C末端缺失可以结合超螺旋pMYC7质粒,但不能结合相同的线性双链DNA片段。因此,获取线性DNA最初需要Pur-alpha的C末端序列。

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