Expression profiling reveals novel innate and inflammatory responses in the jejunal epithelial compartment during infection with Trichinella spiralis

doi:10.1128/IAI.72.10.6076-6086.2004

.2004年10月；72(10):6076-86.

doi:10.1128/IAI.72.10.6076-6086.2004。

表达谱分析揭示了旋毛虫感染期间空肠上皮细胞室中新的固有和炎症反应

帕梅拉骑士¹, 艾伦·D·彭伯顿, 凯文·罗伯逊, 道格拉斯·罗伊, 史蒂文·怀特, 休·R·P·米勒

附属公司

PMID： 15385512
PMCID公司： PMC517597
内政部： 10.1128/IAI.72.10.6076-6086.2004

表达谱分析揭示了旋毛虫感染期间空肠上皮细胞室中新的固有和炎症反应

帕梅拉骑士等。感染免疫. 2004年10月.

.2004年10月；72(10):6076-86.

doi:10.1128/IAI.72.10.6076-6086.2004。

作者

帕梅拉骑士¹, 艾伦·D·彭伯顿, 凯文·罗伯逊, 道格拉斯·罗伊, 史蒂文·H·赖特, 休·R·P·米勒

附属

¹英国米德洛西安罗斯林爱丁堡大学兽医临床研究部。pam.knight@ed.ac.uk

PMID： 15385512
PMCID公司： PMC517597美元
内政部： 10.1128/IAI.72.10.6076-6086.2004

摘要

肠道线虫感染会导致肠道发生深刻的病理变化，最终导致寄生虫被驱除。我们应用表达谱作为寡核苷酸微阵列（Affymetrix MG-U74AV2基因芯片）和时间过程动力学的初始筛选过程，以研究BALB/c小鼠空肠上皮内旋毛虫线虫触发的基因转录。在检测到的4114个基因中，2617个基因存在于所有未感染和感染旋毛虫的复制品中，其中8%显著上调，而12%在驱虫时（感染后第14天）下调。杯状细胞粘蛋白基因转录物肠粘蛋白基因3（MUC3）、氯化钙通道5（CLCA5）和杯状细胞基因4（GOB4）的上调与粘液生成和改变的增强一致，而肥大细胞蛋白酶1和2（MCPT-1和-2）转录物上调60至70倍与上皮内粘膜肥大细胞募集一致。重要的是，在感染后第14天，唾液酸转移酶4C（SIAT4C）、富含脯氨酸的小蛋白2A（SPRR2A）和抵抗素样分子β（RELMbeta）有新的表达。相反，DNase I和再生蛋白3（REG3）转录物显著下调。时间进程分析显示早期（感染48小时内）诱导Siat4c、Sprr2A和Relnbeta，随后（120小时内）诱发Mcpt-1和Mcpt-2。研究结果表明，上皮细胞内存在早期先天性反应和后期炎症变化。早期上皮反应可能与修复（Sprr2A）和先天免疫（Siat4c和Relnbeta）的发展有关。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
差异表达基因的聚类。为了研究本实验中样本的相似性，在GeneSpring（Silicon Genetics）中对1662个可变基因（变异系数>0.4）的过滤子集进行了层次聚类（使用皮尔逊相关作为距离度量）。树状图通过基因表达模式将样本与短分支长度联系起来，表明相似性。每列代表一个样本，每行代表一个基因。生物复制（未感染的红色枝条；感染的绿色枝条）聚集在一起。为了帮助数据可视化，基因表达被显示为Z分数的颜色表示（有关数据分析的描述，请参见材料和方法）。绿色表示表达式比平均值减少，而红色表示增加。

**图2。**
第0天和第14天空肠上皮的基因表达*旋毛虫*感染。材料和方法中描述了上皮的制备、mRNA的提取和微阵列程序。平均日0信号(n个=4）根据平均14天信号绘制(n个=4）针对Affymetrix MG-U74AV2阵列上的每个基因探针集。对角线表示上下调节的10倍水平。通过使用特定引物进行单独的RT-PCR分析，确认所选转录物的改变表达（见材料和方法）。Sprr2A、Mcpt-1和Mcpt-2、Relmβ和Siat4c的转录物明显上调。DNase I和Reg3α和-γ的转录物下调，而线粒体肌酸激酶（Ckmt1），一种高度表达的看家基因，没有改变。

**图3。**
术后空肠上皮特异性转录物表达的时间变化*旋毛虫*感染。（a） Mcpt-1和Mcpt-2的RT-PCR产品；Reg3α、-β和-γ；Sprr2A；DNA酶I；Siat4c；Daf1；和Relmβ；线粒体肌酸激酶（Ckmt1）作为RT反应的阳性对照。RT的总RNA是从从*旋毛虫*-感染BALB/c小鼠在第0、1、3、7、14、28和56天p.i(n个=4/时间点）。（b）显示面板a中RT-PCR产物相对净强度的直方图与每个引物组记录的最高净强度进行了归一化，以可视化转录水平随时间的变化。✽, 与未感染水平显著不同(*P（P）*≤ 0.05).

**图4。**
空肠上皮Sprrs表达的变化*旋毛虫*感染。比较感染第0天和第14天Sprrs的杂交强度（表示为平均值±标准偏差[n个= 4]). 观察到Sprr2A上调(*P（P）*≤0.001），但Sprr1A、-1B或-3没有变化。50的信号截止电平显示为虚线。

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