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.2002年4月;70(4):845-57.
doi:10.1086/339432。 Epub 2002年3月1日。

612例炎症性肠病患者CARD15/NOD2突变分析及基因型-表型相关性

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612例炎症性肠病患者CARD15/NOD2突变分析及基因型-表型相关性

苏珊娜·莱斯奇等。 美国人类遗传学杂志. 2002年4月.

摘要

CARD15/NOD2编码一种与单核细胞识别细菌有关的蛋白质。最近在克罗恩病(CD)患者中发现了CARD15的突变,这是一种消化道慢性炎症状态。在此,我们报告了453例CD患者CARD15的突变分析,包括166例散发病例和287例家族性病例、159例溃疡性结肠炎(UC)患者和103名健康对照者。在确定的67个序列变异中,9个在CD患者中的等位基因频率>5%。其中6个被认为是多态性,3个(R702W、G908R和1007fs)被证实与CD易感性独立相关。27个罕见的额外突变也被认为是潜在的致病突变(DCM)。三个主要变体(R702W、G908R和1007fs)分别占CD总突变的32%、18%和31%,而27个罕见突变的总数占DCM的19%。总的来说,93%的突变位于基因的远端三分之一。未发现与UC相关的突变。相比之下,50%的CD患者至少携带一种DCM,其中17%的患者具有双重突变。该观察结果证实了CD的基因毒化效应。双剂量突变患者的特征是发病年龄较低(16.9岁vs.19.8岁;P=0.01),狭窄表型较常见(53%vs.28%;P=0.00003;比值比2.92),结肠受累频率较低(43%vs.62%;P=.003;比值比0.44)与那些没有突变的患者相比。对于任何CARD15基因型,疾病的严重程度和肠外表现没有差异。在有或无突变的CD患者组中,家族性和散发性病例的比例以及有吸烟习惯的患者的比例相似。这些发现为基于DNA的炎症性肠病易感性测试和遗传咨询提供了工具。

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数字

图1
图1
年观察到的九种最常见变异和一组罕见序列变异的分布卡15CD、UC和对照人群中的基因。将CD和UC人群中这些变异的等位基因频率与对照组进行比较,并将其显著性水平(P(P)值)用星号表示:*,P(P)<.05; **,P(P)<.005; ***,P(P)<.0005.
图2
图2
在CD患者中观察到DCM沿着CARD15/NOD2蛋白的分布和突变染色体的数量。星号(*)表示未考虑P268S突变,因为其与其他变体的紧密联系不平衡(见正文)。

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