标签:参考序列

新增!RefSeq版本224

新增!RefSeq版本224

查看RefSeq 224版,现已推出联机和来自FTP文件现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么?

截至2024年5月6日,此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据,包括:

  • 435879646条记录
  • 324246652种蛋白质
  • 62348147个RNA
  • 150742种生物的序列

该版本作为一个完整的数据集提供在多个目录中,也按逻辑分组进行划分。继续阅读“新建!RefSeq版本224”

现在可用!更新的细菌和考古参考基因组收集

现在可用!更新的细菌和考古参考基因组收集

下载更新的细菌和古细菌参考基因组采集! 我们通过在年的350000多个原核基因组中为每个物种选择“最佳”基因组组装,建立了19328个基因组的集合参考序列(大肠杆菌除外,其中两个组件被选为参考)。

有什么新功能?
  • 413个物种首次出现在这个集合中
  • 198个物种以更好的组合表示
  • 由于NCBI分类学的变化或物种分配的不确定性,27个物种被删除

继续阅读“现已提供!更新的细菌和古生菌参考基因组集合”

NCBI隐马尔可夫模型(HMM)15.0版现已推出!

NCBI隐马尔可夫模型(HMM)15.0版现已推出!

下载15.0版NCBI蛋白质谱的隐马尔可夫模型(HMM)原核基因组注释管道(PGAP)!使用HMMER序列分析包裹。

有什么新功能?

15.0版包含:

  • NCBI维护的16667个HMM
  • 自14.0版以来的279个新HMM
  • 数百个HMM具有更好的名称、EC编号、基因本体(GO)术语、基因符号或出版物。 

继续阅读“NCBI隐马尔可夫模型(HMM)15.0版现已推出!”

新的RefSeq注释现在可用!

新的RefSeq注释现在可用!

2月和3月NCBI真核基因组注释管道释放46个新注释参考序列!

新建批注
  • 白纹伊蚊(亚洲虎蚊)
  • 卡罗琳按蚊(绿按蚊)
  • 亚lbatus(蚊子)
  • 俄罗斯芽孢杆菌(手杖)
  • 微小鲍氏体病(鸡冠果冻)
  • 家蚕
  • 金龟子(金龟子)
  • 粗枝假丝酵母(蛇)
  • Cavia porcellus(家猪)
  • 继续阅读“新RefSeq注释现在可用!”
现已上市:RefSeq Release 223

现已上市:RefSeq Release 223

查看RefSeq 223版,现已推出联机和来自FTP文件现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么?

截至2024年3月4日,此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据,包括:

  • 425594654条记录
  • 316329937蛋白质
  • 60886133个RNA
  • 147591种生物的序列

继续阅读“现在可用:RefSeq Release 223”

加入NCBI参加TAGC 2024

在TAGC 2024加入NCBI

3月6日至10日,华盛顿特区。 

我们期待着在 联合遗传学会议(TAGC)2024年3月6日至10日,华盛顿特区地铁区。NCBI工作人员将参加各种活动和活动,包括举办一次实践研讨会:使用NCBI数据集浏览和下载NCBI。我们也很高兴分享我们最近在NIH比较基因组资源(CGR)在演讲期间周日的技术、工具和资源会议. 

查看NCBI的活动和事件时间表:

继续阅读“加入TAGC 2024 NCBI”

新的RefSeq注释现在可用!

新的RefSeq注释现在可用!

10月至1月期间NCBI真核基因组注释管道释放七十个新注释参考序列!

新建批注
  • 桤木
  • 扁桃体Amyelois transitella(蛾)
  • 黑腹锦葵(棕腹锦葵)
  • 中华蜜蜂(亚洲蜜蜂)
  • 鳞翅目(赖斯鲸)
  • 野蜂Bombus pascuorum(蜜蜂)
  • 爪蟾(斑腾)
  • Bos taurus(牛)

继续阅读“新RefSeq注释现在可用!”

更新的细菌和考古参考基因组集合可用!

更新的细菌和考古参考基因组集合可用!

下载更新的细菌和古细菌参考基因组采集! 本次收集(截至2024年1月18日,共有18941个基因组)是通过在330000多个原核基因组中为每个物种选择“最佳”基因组组合而建立的参考序列(大肠杆菌除外,其中两个组件被选为参考)。你可以通过对这些高质量的基因组而不是整个核苷酸或蛋白质数据库运行它们来加快序列搜索。

The 标准为给定种类选择参考程序集的方法包括程序集的连续性、RefSeq注释的完整性和质量。继续阅读“更新的细菌和考古参考基因组集合可用!”

RefSeq Release 222现已推出!

RefSeq Release 222现已推出!

查看RefSeq 222版,现已推出联机和来自FTP文件现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么?

截至2024年1月8日,此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据,包括:

  • 411137832条记录
  • 304562770蛋白质
  • 59343570个RNA
  • 145371种生物的序列

继续阅读“RefSeq Release 222现已推出!”