标签：NCBI数据集

NCBI分类法即将发生的变化

NCBI分类法即将发生的变化

NCBI正在不断改进我们的分类学应对新数据和生物命名和分类变化的资源。在接下来的几个月里，我们将更新更高级别的鸟类分类(Aves公司)、芽殖酵母(酵母亚门)，原核生物(细菌和古生菌)和病毒此更新还将更改包括真核生物在内的几个高级分类名称的正式等级。除了病毒的新物种名称外，这些变化都不会影响物种级别或更低级别的生物体名称。 

以下是按照我们计划的顺序对每个组所做更改的简要概述。请继续关注即将发布的帖子，它将更详细地描述每个类别的更改。  继续阅读“NCBI分类法即将发生的变化” →

新数据可用！在NCBI获取禽流感A（H5N1）病毒序列

新数据可用！在NCBI获取禽流感A（H5N1）病毒序列

来自的序列数据牛持续爆发甲型H5N1禽流感病毒现在可以通过NLM的NCBI资源获得NCBI病毒和NCBI数据集.

这些数据由美国农业部，美国疾病控制与预防中心（CDC），的世界卫生组织（WHO），爱荷华州立大学、和圣犹大儿童研究医院. 继续阅读“新数据可用！访问NCBI上的禽流感A（H5N1）病毒序列” →

增加约200万昆虫基因的同源群

增加约200万昆虫基因的同源群

如果ind进化rily相关基因跨越昆虫和其他 节肢动物在我们的新Ortholog网页

NCBI最近发布了一组约200万个昆虫基因的同源基因。现在，您可以通过在中搜索物种和基因名称来查找和访问同源基因、转录本和蛋白质NCBI所有数据库，NCBI基因，或NCBI数据集.作为前面描述的，这些正交曲线基于与黑腹果蝇带注释的基因组。使用果蝇属直系生物的基因命名法应能为昆虫和其他节肢动物提供更丰富的基因符号。  继续阅读“增加约200万昆虫基因的同源群” →

新增！RefSeq版本224

新增！RefSeq版本224

查看RefSeq 224版，现已推出联机和来自文件传输协议现场。您可以通过以下方式访问RefSeq数据NCBI数据集.

此版本中包括什么？

截至2024年5月6日，此完整版本包含基因组、转录和蛋白质数据，包括：

  • 435879646条记录
  • 324246652蛋白质
  • 62348147个RNA
  • 150742种生物的序列

该版本作为完整的数据集在多个目录中提供，也按逻辑分组进行划分。继续阅读“新增！RefSeq Release 224” →

使用NCBI数据集浏览分类记录

使用NCBI数据集浏览分类记录

新的和改进的NCBI数据集分类页面和命令行服务 

NCBI数据集很高兴为我们的分类页面使您更容易访问、浏览和下载任何分类级别的生物体分类信息。  

有什么新鲜事吗？
  • 通过更新的外观探索分类法记录
  • 从web或通过我们的更新访问和下载分类元数据命令行（CLI）工具 

继续阅读“使用NCBI数据集浏览分类记录” →

新的RefSeq注释现在可用！

新的RefSeq注释现在可用！

2月和3月NCBI真核基因组注释管道释放46个新注释英寸参考序列！

新建批注
  • 白纹伊蚊（亚洲虎蚊）
  • 卡罗琳按蚊（绿按蚊）
  • 亚长臂猿（蚊子）
  • 红藤巴氏杆菌（手杖）
  • 微小鲍氏体病（鸡冠果冻）
  • 家蚕
  • 金龟子（金龟子）
  • 粗枝假丝酵母（蛇）
  • Cavia porcellus（家猪）
  • 继续阅读“新的RefSeq注释现在可用！” →
在TAGC 2024加入NCBI

在TAGC 2024加入NCBI

3月6日至10日，华盛顿特区。 

我们期待着在 联合遗传学会议（TAGC）2024年3月6日至10日，华盛顿特区地铁区。NCBI工作人员将参加各种活动和活动，包括举办一次实践研讨会：使用NCBI数据集浏览和下载NCBI。我们也很高兴分享我们最近在NIH比较基因组资源（CGR）在演讲期间周日的技术、工具和资源会议. 

查看NCBI的活动和事件时间表：

继续阅读“加入TAGC 2024 NCBI” →

NCBI数据集API和命令行工具的重大更新

NCBI数据集API和命令行工具的重大更新

作为我们不断努力提升您体验的一部分，我们正在更新NCBI数据集应用程序编程接口（API）。开始于2024年6月，v2alpha API将升级为稳定v2版本。此时，v1版应用程序编程接口，这个命令行界面我)版本13和更早的版本，以及Python库v1将被弃用因此不再支持错误修复或更新.自2024年12月31日起生效东南方将不再可供使用。 

我们更新的API和CLI工具根据您的反馈提供了新的特性和功能。我们致力于使这一过渡尽可能顺利，并鼓励您审查我们的常见问题解答了解更多详细信息。如果使用NCBI数据集网页和命令行工具v14+，则无需执行任何操作。   继续阅读“NCBI数据集API和命令行工具的重大更新” →

新的RefSeq注释现在可用！

新的RefSeq注释现在可用！

10月至1月期间NCBI真核基因组注释管道释放七十条新注释英寸参考序列！

新建批注
  • 桤木
  • 扁桃体Amyelois transitella（蛾）
  • 普通Anolis sagrei ordinatus（棕色anole）
  • 蜜蜂（亚洲蜜蜂）
  • 鳞翅目（赖斯鲸）
  • 野蜂Bombus pascuorum（蜜蜂）
  • 爪蟾（斑腾）
  • Bos taurus（牛）

继续阅读“新RefSeq注释现在可用！” →

同源基因现在重定向到NCBI数据集基因

同源基因现在重定向到NCBI数据集基因

查看和下载相关基因的新方法 

作为之前宣布的，HomoloGene现在自动重定向到NCBI数据集基因页面让您轻松获取最新的序列和同源性数据。NCBI数据集基因表提供了到NCBI Orthologs的链接，其中包含扩展的基因和蛋白质信息以及到工具的链接。NCBI Orthologs包含越来越多的分类群的更多基因和序列。请参阅下面的示例。Legacy HomoloGene数据在FTP站点. 继续阅读“同源基因现在重定向到NCBI数据集基因” →