CePa公司 swMATH ID: 23825 软件作者: Gu,Z.G.,Wang,J。 描述: CePa:一个R包,用于发现由多个网络中心性加权的重要路径。概要:CePa是一个R包,旨在通过网络拓扑信息找到重要路径。与当前的路径富集工具相比,该软件包有几个优点。首先,在分析网络时,将通路节点而不是单个基因作为基本单位,以满足基因必须构建成复合体以保持正常功能的事实。其次,同时应用多个网络中心度从不同角度衡量节点的重要性,以全面了解生物系统。CePa扩展了标准途径富集方法,包括过表达分析程序和基因集分析程序。CePa在实际数据上进行了高性能评估,它可以提供更多与当前生物问题直接相关的信息。可用性:CePa可在综合R档案网络(CRAN)上获得:http://cran.r-project.org/web/packages/CePa/ 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23314125 依赖项: R(右) 相关软件: JASPAR公司;紧缩;星形底座;Pathway公用地;ConsensusPathDB协议;第页;中央服务器;GSA公司;MatlabBGL软件;生物网格;阿拉伯国家石油公司;记录仪 引用于: 1文件 全部的 前5名6位作者引用 1 克里斯托弗·恩格斯特罗姆 1 帕特里克·约翰逊 1 斯文·内兰德 1 谢尔盖·西尔维斯特罗夫。 1 弗雷德里克·斯沃特林。 1 霍尔格·威沙普特 0连载引用 在2个字段中引用 1 组合数学(05-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文