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CePa公司

swMATH ID: 23825
软件作者: Gu,Z.G.,Wang,J。
描述: CePa:一个R包,用于发现由多个网络中心性加权的重要路径。概要:CePa是一个R包,旨在通过网络拓扑信息找到重要路径。与当前的路径富集工具相比,该软件包有几个优点。首先,在分析网络时,将通路节点而不是单个基因作为基本单位,以满足基因必须构建成复合体以保持正常功能的事实。其次,同时应用多个网络中心度从不同角度衡量节点的重要性,以全面了解生物系统。CePa扩展了标准途径富集方法,包括过表达分析程序和基因集分析程序。CePa在实际数据上进行了高性能评估,它可以提供更多与当前生物问题直接相关的信息。可用性:CePa可在综合R档案网络(CRAN)上获得:http://cran.r-project.org/web/packages/CePa/
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23314125
依赖项: R(右)
相关软件: JASPAR公司;紧缩;星形底座;Pathway公用地;ConsensusPathDB协议;第页;中央服务器;GSA公司;MatlabBGL软件;生物网格;阿拉伯国家石油公司;记录仪
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