GSA公司 swMATH编号： 18747 软件作者： 布拉德利·埃夫隆；罗伯特·提比拉尼 描述： 关于测试基因集的重要性。本文讨论了从微阵列实验中鉴定差异表达基因组的问题。基因组是外部定义的，例如，从生物数据库中衍生的基因通路集。我们的出发点是{it A.Subramanian}等人【美国国家科学院院刊102，15545–15550（2005）】有趣的基因集富集分析（GSEA）程序。我们在一定程度上研究了这个问题，并对GSEA提出了两个潜在的改进：用于总结基因集的maxmean统计，以及用于更准确推断的重新标准化。我们讨论了各种示例和扩展，包括使用基因集分数进行类预测。我们还描述了一个新的实现我们想法的（R）语言包GSA。 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/GSA/index.html 源代码： https://github.com/cran/GSA网站 依赖项： R（右） 关键词： 多次测试;随机化;渗透 相关软件： KEGG公司;全球气候变化评估;生物导体;R（右）;群集查找;麦克卢斯特;风险评估;形状记忆合金;第PAGE页;迁移率;玻璃制品;GlobalAncova公司;PLINK公司;作为136;氟多醇;高D2波普;COSA公司;GoSurfer网站;GOstat公司;博拉索 引用于： 36文件 全部的 前5名90位作者引用 3 崔恒坚 3 布拉德利·埃夫隆 2 陈松溪 2 金，京嘉 2 约翰·林 2 Jeffrey C.Miecznikowski。 2 王思阳 2 Xu、Kai 1 拉斐尔·阿吉安托 1 威廉·巴里。 1 劳伦斯·戴维·布朗 1 陈斌 1 陈慧 1 陈希伟 1 陈永帅 1 崔月华 1 Andrew J.Dannenberg。 1 达扎德，让·尤德斯 1 埃德加·多布里班 1 董凯 1 克里斯托弗·恩格斯特罗姆 1 冯、龙 1 字体，马格纳斯 1 伊加·福基 1 丹尼尔·盖尔（Daniel P.Gaile）。 1 马克·根顿（Marc G.Genton）。 1 德巴希·戈什 1 戈尔德，大卫 1 郭文文 1 何增友 1 何塞·D·赫拉佐·马亚。 1 萧楚雄凯特 1 黄秀 1 旺彻·张 1 帕特里克·约翰逊 1 纳夫塔利·卡明斯基 1 金炳洙 1 Lee，Shinjae先生 1 李尔宁 1 李军 1 李润泽 1 梁凤 1 刘菲 1 刘，宋 1 卢布曼，大卫·M。 1 斯文·内兰德 1 诺贝尔，安德鲁B。 1 潘伟 1 赫伯特·彭 1 塔斯尼姆·H·巴特瓦。 1 秦英丽 1 J.Sunil Rao 1 法布里奇奥·鲁杰里 1 邵晓峰 1 沈晓彤 1 洛丽·谢泼德 1 谢尔盖·西尔维斯特罗夫。 1 夏洛特·索尼森 1 孙洁欢 1 弗雷德里克·斯沃特林。 1 图林，Måns 1 Robert John Tibshirani先生 1 童铁军 1 大卫·L·特里切勒。 1 马图库马利，维迪亚萨加 1 乔治·F·冯·博里斯。 1 王夏洛特 1 王海燕 1 王瑞 1 王舒蕾 1 王昭君 1 霍尔格·威沙普特 1 弗雷德·赖特（Fred A.Wright）。 1 吴岑 1 吴金曹 1 谢本怀 1 徐兴忠 1 姚舜 1 Yu，Donghyeon先生 1 于伟川 1 袁明 1 张咸阳 1 赵宏宇 1 赵琳达 1 钟平寿 1 周希凯西 1 周叶青 1 朱丽萍 1 子、薛敏 1 邹昌良 全部的 前5名17篇连载文章中引用 6 计算统计与数据分析 4 统计年鉴 4 应用统计学年鉴 3 遗传学和分子生物学中的统计应用 2 美国统计协会杂志 2 多元分析杂志 2 统计规划与推断杂志 2 统计传播。理论与方法 2 电子统计杂志 1 梅特里卡 1 统计与概率信件 1 统计科学 1 国际近似推理杂志 1 统计计算与仿真杂志 1 欧洲控制杂志 1 计算生物学和化学 1 科学中国。数学 全部的 前5名在6个字段中引用 34 统计学（62-XX） 13 生物学和其他自然科学（92-XX） 5 数值分析（65-XX） 2 概率论与随机过程（60-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 计算机科学（68至XX） 按年份列出的引文