GEMMA公司 swMATH ID: 23999 软件作者： 周，向 描述： GEMMA是一个软件，用于实现标准线性混合模型的全基因组高效混合模型关联算法以及全基因组关联研究（GWAS）的一些近亲：它适用于单变量线性混合模型（LMM）用于单个表型的标记关联测试，以解释群体分层和样本结构，并用于估计由分型基因型解释的表型（PVE）的方差比例（即“芯片遗传力”）。它符合一个多元线性混合模型（mvLMM），用于同时测试多个表型的标记关联，同时控制种群分层，并用于估计复杂表型之间的遗传相关性。它使用马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）拟合贝叶斯稀疏线性混合模型（BSLMM），通过分型基因型估计PVE，预测表型，并通过联合建模所有标记识别相关标记，同时控制种群结构。它估计方差分量/芯片遗传率，并按不同SNP功能类别进行划分。特别是，当个别水平的数据可用时，它使用HE回归或REML-AI算法来估计方差分量。当只有汇总统计信息可用时，它使用MQS估计方差分量。 主页： http://www.xzlab.org/software.html 相关软件： PLINK公司;格尔姆奈特;github;GWAS目录;REMI公司;GCTA公司;ElemStatLearn（电子状态学习）;R（右）;巴蒂;贝叶斯树;rSGDLM公司;高斯QR;qtlbim公司;pi-MASS公司;UniProt公司;遗传力 引用于： 5文件 标准条款 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 全基因组关联研究中方差分量估计与汇总统计的统一框架。 Zbl 1383.62305号周，向 2017 全部的 前5名16位作者引用 1 詹姆斯·鲍利 1 洛林·克劳福德 1 赛斯·R·弗拉克斯曼。 1 黄、健 1 焦玉玲 1 Chase N.乔纳。 1 穆罕默德·菲特拉·卡卡马加 1 刘，金 1 罗伯特·B·伦德。 1 克里斯托弗·S·麦克马汉。 1 本斯·帕尔达米安 1 卡里萨·帕尔达米安 1 丹尼尔·伦西（Daniel E.Runcie）。 1 塔马尔·索弗 1 韦斯特，迈克 1 杨，肯 3篇连载文章中引用 2 遗传学和分子生物学中的统计应用 2 应用统计学年鉴 1 中国统计学 在3个字段中引用 5 统计学（62-XX） 4 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 概率论与随机过程（60-XX） 按年份列出的引文