How do lncRNAs regulate transcription?

doi:10.1126/sciadv.aao2110

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.2017年9月27日；3（9）：eaao2110。

doi:10.1126/sciadv.aao2110。 eCollection 2017年9月。

lncRNA是如何调节转录的？

亿城龙¹, 王学圻¹, 丹尼尔·特尤曼斯^1 2, 托马斯·切赫¹

附属公司

¹科罗拉多大学生物前沿研究所化学与生物化学系和美国科罗拉多大学霍华德·休斯医学研究所，科罗拉多州博尔德市，邮编80309。
²美国科罗拉多丹佛大学安舒茨医学院，科罗拉多州奥罗拉市，邮编80045。

PMID： 28959731
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lncRNAs如何调节转录？

亿城龙等。科技进步. 2017.

.2017年9月27日；3（9）：eaao2110。

doi:10.1126/sciadv.aao2110。 eCollection 2017年9月。

作者

亿城龙¹, 王学圻¹, 丹尼尔·特尤曼斯^1 2, 托马斯·切赫¹

附属公司

¹科罗拉多大学生物前沿研究所化学与生物化学系和美国科罗拉多大学霍华德·休斯医学研究所，科罗拉多州博尔德市，邮编80309。
²美国科罗拉多丹佛大学安舒茨医学院，科罗拉多州奥罗拉市，邮编80045。

PMID： 28959731
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摘要

最近很明显，RNA本身是转录的产物，是转录过程的主要调节器。特别是，长非编码RNA（lncRNAs）在真核生物中数量众多，在许多情况下起转录调节器的作用。这些RNA通过结合组蛋白修饰复合物、DNA结合蛋白（包括转录因子）甚至RNA聚合酶II发挥作用。在其他情况下，似乎是lncRNA转录的作用，而不是lncRNA产物的调节作用。我们综述了近年来lncRNAs调控基因表达的分子机制的研究进展以及该研究领域的未来机遇。

PubMed免责声明

数字

**图1。B2 RNA直接抑制转录。**
在没有B2 RNA的情况下，可以组装一个功能性封闭的起始前复合物（PIC）。(顶部)这种复合物可以熔化dsDNA双链，形成开放的预起始复合物以促进转录起始。相反，B2 RNA在一个非功能封闭复合物中直接与RNA Pol II结合。(底部)B2 RNA阻止Pol II与功能性DNA接触，从而阻止dsDNA熔化和开放复合物形成。

**图2。roX1和roX2 RNA对过度活跃至关重要*果蝇属*X染色体。**
DCC由五种蛋白质（灰色）和roX1或roX2 RNA（橙色线）组成。MLE解旋酶将roX RNA改造成串联干环结构，并将其并入功能性DCC。当完全组装时，这种核糖核蛋白复合物被募集到X染色体并乙酰化赖氨酸¹⁶组蛋白4。这种PTM导致染色体减压和转录过度活跃。在没有roX RNA转录物的情况下，X染色体的H4K16乙酰化不会发生。

**图3。lncRNAs通过组蛋白修饰物调节转录。**
PRC1与lncRNA相互作用，TUG1或MALAT1。这些相互作用调节PRC1的甲基化状态和定位。PRC2被结合lncRNA或新生的前体mRNA抑制。lncRNAs Kcnq1ot1、Air和ROR（重编程调节器）调节G9a的活性，G9a是一种使H3K9甲基化的酶。HOTTIP与WDR5-MLL复合体相互作用，并将复合体定位于5′HOXA位点。RNAPII、RNA聚合酶II；MALAT1，转移相关肺腺癌转录本1。

**图4。ncRNAs通过DNA结合蛋白调节转录。**
lncRNAs（有时是miRNAs）与DNMT相互作用，导致DNMT在染色质位点的募集或抑制。DNA甲基化的改变（m⁵C）水平通常影响局部转录。lncRNA-转录因子相互作用可以从染色质中募集或驱逐转录因子，这种作用可以是顺式的（如图所示），也可以是反式的。从增强子区域转录的eRNA可以促进染色质环和基因激活。lncRNA与染色质绝缘体CCCTC-结合因子（CTCF）相互作用并调节转录。其机制可能涉及CTCF在染色质环和核结构中的作用。TSS，转录起始位点。

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